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  • SPACE SCIENCES  (5,509)
  • Genetics
  • 2020-2023  (1)
  • 2010-2014  (13)
  • 1965-1969  (5,509)
  • 1
    facet.materialart.
    Unknown
    La Habana
    Publication Date: 2021-01-30
    Description: Contiene los trabajos presentados, el programa científico y el perfil de instituciones marinas cubanas.
    Description: Published
    Description: zona costera
    Description: recursos marinos
    Description: acuacultura
    Description: acuariología
    Description: educación
    Description: genética
    Description: contaminación marina
    Description: microbiología
    Keywords: Coastal zone ; Marine resources ; Aquaculture ; Aquariology ; Education ; Genetics ; Marine pollution ; Microbiology
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Book , Refereed , Paper
    Location Call Number Expected Availability
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  • 2
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: Las colecciones microbianas son consideradas como centros de recursos genéticos que custodian dicho germoplasma, entre sus funciones principales se encuentra la conservación de los microorganismos, lo que permite garantizar el suministro de cepas requerido para acometer actividades docentes, investigativas o productivas. En Cuba, tales curadores, se aglutinaron en el Grupo de Colecciones Microbianas, que durante el 2002 se constituyó como Sección de Colecciones Microbianas y otros Materiales Biológicos de la ATAC, alcanzando en la actualidad más de 100 asociados, que participan en reuniones trimestrales, cursos, adiestramientos y talleres, donde son discutidos los resultados del trabajo científico-técnico desarrollado en sus colecciones. Se comentan de modo general su inserción en las distintas esferas de la economía del país, los servicios que prestan, los métodos para la conservación de los microorganismos con que trabajan y otros aspectos de interés.
    Description: Published
    Keywords: Genetics ; Biological collections ; Genetics
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Journal Contribution
    Location Call Number Expected Availability
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  • 3
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: En el presente trabajo se realizó un estudio de las relaciones evolutivas de las especies representativas de peces del género Lucifuga en Cuba mediante el análisis de sus variaciones genéticas y moleculares. Se estudiaron 11 sistemas proteicos y la secuencia parcial del gen mitocondrial citocromo b (cytb). Los animales fueron colectados en diferentes localidades de la zona occidental de Cuba. La filogenia reconstruida a partir de los caracteres moleculares indica la existencia de dos linajes evolutivos fundamentales cuya divergencia está sustentada por 11 loci proteicos, 73 sinapomorfías mitocondriales y un uso diferencial de los codones que codifican para el aminoácido valina. Uno de los linajes está constituido por las especies L. dentatus, L. dentatus var. holguinensis y L. simile y el otro por las especies L. subterraneus y L. teresinarum. La distribución de las especies en los linajes evolutivos se corresponde con la asignación de las mismas a los dos subgéneros definidos para este género. El análisis filogenético sostiene que las especies L. simile, L. dentatus y L. subterraneus constituyen linajes evolutivos independientes caracterizados por múltiples sinapomorfías, coincidiendo con clasificación taxonómica actual. L. teresinarum no se sustenta como clado monofilético y apunta a ser una sinonimia de L. subterraneus, aunque los resultados al respecto no son concluyentes. Los ejemplares de la denominada L. dentatus var. holguinensis capturados en dos localidades del norte de Matanzas constituyen un clado bien soportado definido por caracteres moleculares, bioquímicos y morfológicos. Esto sugiere la revisión de su estatus taxonómico.
    Description: Unpublished
    Description: Lucifuga (Ophidiiformes: Bythitidae)
    Description: Cuba
    Keywords: Genetics ; Evolution (organisms) ; Molecular taxonomy
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations , Master thesis
    Format: 81
    Location Call Number Expected Availability
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  • 4
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: La poliploidía ha sido una de las biotecnologías más empleadas en la ultima década para el mejoramiento genético de moluscos bivalvos por ser una de las mejores alternativas a corto plazo para incrementar la producción. Los organismos triploides presentan tres juegos completos de cromosomas homólogos que afectan la sinapsis, lo cual da como resultado una esterilidad parcial o total, la cual teóricamente repercute favorablemente en el crecimiento. Sin embargo, la inducción a la triploidía presenta algunos problemas que podrían resolverse con la disponibilidad de tetraploides para producir triploides biológicos. En este trabajo se presentan los resultados del desarrollo de biotecnologías de poliploidía en tres especies de moluscos nativos al noroeste de México, el abulón rojo (Haliotis rufescens), la almeja catarina (Argopecten ventricosus) y la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus). En abulón rojo se evaluó la inducción a la triploidía en tres épocas del año (mayo, septiembre y noviembre), obteniéndose en el mes de noviembre los mejores porcentajes de triploides. El éxito alcanzado en la triploidía fue paralelo a la viabilidad larval observada en larvas control durante cada inducción; la supervivencia más alta a trocófora y el coeficiente de variación (CV) más bajo ocurrió para las larvas producidas en noviembre o invierno. Las larvas producidas en mayo presentaron una supervivencia intermedia, mientras que las producidas en septiembre presentaron la supervivencia más baja a larva trocófora y el CV más alto. En almeja mano de león, para la cual se evaluaron diferentes concentraciones de citocalacina-B, se encontró que las concentraciones de CB de 0.75 mg/L y 1.0 mg/L presentaron el mayor éxito (87 % y 95 %, respectivamente), aunque la supervivencia larval estuvo inversamente correlacionada con el éxito a la triploidía. Al evaluar los efectos de la triploidía sobre la gametogénesis y el crecimiento de la almeja mano de león durante un período de 21 meses, comparando triploides, diploides tratados, y diploides control, se encontró que el crecimiento de los triploides no fue superior a los grupos diploides. La falta de ventaja de crecimiento del triploide ocurrió a pesar de la incapacidad de los triploides para madurar y formar gametos, mostrando una esterilidad del 95 % al 99 % con respecto a los diploides. Este resultado podría estar asociado con la característica reproductiva de esta especie en el sitio particular donde se realizo la evaluación, donde se ha observado que la reproducción es ‘oportunistica’, así como también podría estar relacionado con un efecto negativo de la alta productividad primaria en este sitio particular. En almeja catarina, especie para la cual ya se había desarrollado previamente el conocimiento sobre la triploidía (su inducción y ventajas en cultivo: Ruiz-Verdugo et al., 2000), en el presente trabajo se evaluó la inducción a la tetraploidía mediante tres métodos. El primero, por inhibición de la extrusión del primer cuerpo polar en ovocitos producidos por diploides y fertilizados por esperma haploide, produjo un porcentaje reducido de larva-D tetraploide, pero no resultó en supervivencia de estos a semilla o adulto. El segundo método, la inhibición de la primera división celular del cigoto, resultó principalmente en larva anormal no viable. El tercer método, la inducción a la tetraploidía inhibiendo el primer cuerpo polar en ovocitos de triploides fertilizados con esperma haploide, fue el único método en donde se obtuvo un alto porcentaje de larva-D tetraploide. De estas progenies tetraploides se logró el obtener adultos, mostrando que este es el único método viable para la producción de tetraploides, previamente demostrado para el ostión japonés. Adicionalmente a las definiciones de las mejores condiciones y métodos para inducción a la poliploidía en estas tres especies, y la evaluación del crecimiento comparativo entre diploides y triploides en una especie, se definieron algunos de los efectos que la condición de triploide tiene sobre la gametogénesis en pectínidos como la en almeja catarina y en almeja mano de león, evaluada a un nivel no previamente reportado en moluscos: estimación de la frecuencia de células gaméticas sexuales específicas para cada estadio de desarrollo y para cada sexo. Esto se realizó con fines de definir los estadios específicos de la ovogénesis y espermatogénesis en donde ocurre un arresto de la meiosis en los moluscos triploides. Se encontró que independientemente de la edad de muestreo y de la especie, el tipo de ovocito más abundante en triploides fue siempre el previtelogénico, mientras que en diploides siempre fue el vitelogénico. Esto indica que, en los pectinidos triploides el estadio de ovocito en el que la gametogénesis fue detenida fue en el ovocito previtelogénico, el cual se encuentra en la profase I, antes del estadio de diploteno. La causa principal para este arresto meiótico esta posiblemente asociada a problemas durante el estadio de cigoteno-paquiteno de la profase I, cuando la sinapsis y su resolución ocurren, ya que la presencia de tres cromosomas homólogos puede resultar en la formación de complejos sinaptoténicos anormales (múltiples entre cromátidas hermanas de los tres homólogos presentes), no resueltos al alcanzar el estadio de paquiteno. En la gónada masculina la espermatogénesis fue detenida en el estadio de espermatocito primario, indicando nuevamente que el arresto de la meiosis ocurre durante la etapa de la profase I, en el cigoteno – paquiteno, o antes de entrar al estadio de diploteno, el cual se sabe solamente se alcanza por aquellos ovocitos entrando a vitelogénesis (vitelogénicos), o por aquellos espermatocitos pasando a espermatocitos secundarios. Dado los resultados tanto en hembras como en machos de esta especie, en donde la esterilidad observada en triploides está dada por un arresto del proceso meiótico, evidenciado por la incapacidad de las células gaméticas para proceder a estadios meióticos más avanzados durante la gametogénesis, se propone que esta esterilidad puede ser resultado de la acción de mecanismos genéticos de mantenimiento celular recientemente descritos como “checkpoint mechanisms”. Finalmente, el tamaño celular y nuclear de los gametos en triploides presentó un incremento sustancial sobre el tamaño de las células y núcleos observados en diploides. Esto es indicativo de un incremento no solo en él numero de cromosomas en triploides, sino en el tamaño del núcleo conteniéndolos, así como un incremento en él numero de organélos y citoplasma para mantenimiento de esas células más grandes. Ese mayor tamaño en las células sexuales, específicamente los ovocitos, podría explicar el éxito logrado en la inducción a la tetraploidía en almeja catarina cuando se utilizaron ovocitos de triploides, ya que un mayor tamaño nuclear y celular permitiría un mejor acomodo de los cromosomas en la metafase y un mayor citoplasma permitiría una mayor reserva de componentes requeridos para la multiplicación de una célula poliploide (Guo y Allen, 1994c).
    Description: Polyploidy is a biotechnology that in the last decade had provided with an improvement method for mollusks in aquaculture. Triploids have three sets of chromosomes rather than the two carried by diploids. The third set has an effect on chromosomes synapsis, producing sterility during reproduction. That sterility is the most accepted cause for the better growth seen in triploids. Artificial induction to triploidy has some problems, which can be solved by the existence of tetraploids, which could be mated to diploids to produce biological triploids. This research presents results on the development of polyploidy biotechnologies for three mollusks species native to the northwest of Mexico: red abalone (Haliotis rufescens), the catarina scallop (Argopecten ventricosus), and the lion-paw scallop (Nodipecten subnodosus). In red abalone induction to triploidy was evaluated in three seasons, spring, summer, and winter, finding that the best results (85% to 100%) in percent triploids was when evaluated in the winter, and when CB concentration was not important in triploidy success. Success in triploid percent during each induction was parallel to larval viability in control groups: the largest survival to trochophore larvae and the lowest coefficient of variation was seen for the evaluations in November; the lowest survival and the highest coefficient of variation was seen during the evaluation in September; and for the May evaluation survival and CV were intermediate. In the lion-paw scallop, induction to triploidy was done only once, finding that concentration of CV was important in the success to produce triploids, but survival was inversely related to the percent of triploids produced. In lion-paw scallop, induction was done only during the natural reproductive season of this species, November, finding that the cytochalasin-B concentration used for the induction was important in the success to triploidy achieved, although there was an inverse relationship between CB concentration and D-larvae survival. Growth and gametogenesis were evaluated for triploids and diploids of the lion-paw scallop during a 21-mo period, not finding an advantage of triploid scallops over diploids for any of the traits evaluated for growth. The lack of advantage for triploids was observed in spite of 95% to 99% sterility in triploids. This is a unique result, as triploidy rarely has been reported as not advantageous in mollusks. Either, the reproductive strategy of this species (opportunistic), or a negative effect of high primary productivity at the site the study was carried might be related to this unique result. For the catarina scallop, a species for which triploidy had been previously demonstrated as feasible and highly promising for improving aquaculture production, the induction to tetraploidy, and the viability of tetraploids to juvenile size was investigated. Three methods were evaluated: inhibition of first polar body in eggs from diploids, inhibition of first cell division in diploid zygotes, and inhibition of first polar body in eggs from triploids. The first and the third did succeded in producing tetraploid larvae, but not the second one. However, juvenile and adult tetraploids were only seen when the third method was used, proving this method as the only one through which tetraploidy can be induced as previously demonstrated for the Pacific oyster. Using as model organism the catarina scallop and the lion-paw scallop, we attempted to understand the precise stage at which gametogenesis is inhibited in mollusks, which can allow for a better understanding of the effects of triploidy on gamete formation. Most previous studies in triploid mollusks had evaluated gametogenesis as developing stages describing the most common event at specific points in time, generally concluding that gametogenesis was delayed in triploids when compared to that seen in diploids. By using a different approach, that is, estimating the gametic cell type frequencies in both, diploids and triploids, the effects of triploidy on gametogenesis can be unequivocally defined to a particular cell type, and meiotic event. It was found that regardless of age at sampling, the most frequently occurring oocyte type in triploid scallops was the previtellogenic oocyte, whereas in diploids it was the vitellogenic oocyte. It is known that the previtellogenic oocyte in pectinids is in prophase I, at the pachytene - zygotene stage of meiosis, and that only those oocytes reaching the diplotene stage can become vitellogenic oocytes. Therefore, it can be concluded that triploidy induces sterility in pectinids because of inability to complete meiosis I, either at the pachytene or zygotene stage. In the male gonad of triploids, the most common gametic cell type was the primary spermatocyte, indicating again the arrest of meiosis at prophase I. Previous studies had proposed mechanical problems during synapsis of chromosomes as the cause of triploid sterility. However, genetic mechanisms can be proposed to be involved in the sterility seen among triploids, as those recently described as ‘checkpoints’, involving proteins detecting and arresting meiosis when failures or errors occur at different steps. Among those checkpoint mechanisms, the pachytene check point is proposed as one involved in the sterility seen among triploids, arresting the meiotic process when problems occur during the synapsis of chromosomes and with the resolution of chromosomes crossing over. Finally, gametic cells of triploids and diploids were compared for nucleus and cytoplasm diameter, finding a significant increase in cell and nucleus size in triploids over diploids. This result might point toward the cause for the only method to induce tetraploidy in catarina scallop having been only that using eggs from triploids, as these eggs would result in an increased probability of the extra set of chromosomes aligning correctly in the metaphase, and the largest cytoplasm would allow for an adequate energy reserve during cell divisions, as pointed out for the Pacific oyster (Guo y Allen, 1994c).
    Description: CONACyT (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología)
    Description: Moluscos, triploidía, tetraploidía
    Keywords: Genetics ; Growth ; Marine molluscs ; Genetics ; Growth
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations
    Format: 201
    Location Call Number Expected Availability
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  • 5
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: Durante la reproducción de camarones peneidos en cautiverio se ha observado que las hembras, a pesar de encontrarse bajo las mismas condiciones de maduración y de que provengan de una población homogénea en cuanto a edad y tamaño, presentan un diferente potencial reproductivo. Esto es, se ha observado que un alto porcentaje (75%) de hembras no desova o produce desoves no viables, mientras que un bajo porcentaje de hembras (25%) tienen la capacidad de desovar múltiples veces, produciendo estas la mayoría (50% -70%) de nauplios. Dado que el mantener en producción hembras con nulo o bajo desempeño reproductivo implica altos costos para los productores (alimento y espacio), se ha sugerido usar sólo múltiples desovadoras para incrementar el rendimiento por piscina de maduración. Para poder usar hembras múltiples desovadotas es necesario establecer metodologías que permitan identificar y aumentar en la población la frecuencia de estas hembras, siempre y cuando la condición fisiológica de las hembras y, por lo tanto, la calidad de la progenie que estas producen a lo largo de los desoves consecutivos, no disminuya de niveles óptimos. En este trabajo se establecieron dos estrategias que pueden ser utilizadas con el fin de lograr este objetivo: una de las estrategias fue la búsqueda de características que pudiesen ser utilizadas como criterios predictivos de un alto potencial reproductivo, y la segunda estrategia fue evaluar la determinación y variación genética disponible para esas características, con el fin de definir si podían ser utilizadas en un programa de mejoramiento genético para incrementar la capacidad reproductiva. Como una primera aproximación, se evaluó si los desoves consecutivos tenían un efecto sobre la condición fisiológica de las hembras y la calidad de su progenie (huevos y larvas), utilizando varios indicadores (productivos, bioquímicos, morfológicos e histológicos), ya que de existir un efecto negativo el uso de hembras con múltiples desoves para mejorar la producción no sería adecuado. De manera general, se encontró que las hembras con un mayor número de desoves presentan una menor latencia entre la ablación y el primer desove, así como un mayor peso, longitud e índice de condición. En términos bioquímicos, se observó que la composición de los órganos analizados (hemolinfa, hepatopáncreas y ovarios) no varia. Estos resultados nos indicaron que la condición fisiológica de las hembras no es afectada con relación al número de desoves que presentan, y que las hembras con múltiples desoves pueden satisfacer las demandas energéticas de las gónadas sin la disminución de las reservas. Así mismo, esto indicó que su capacidad de asimilación, acumulación y movilización de reservas es suficiente para sostener la demanda metabólica asociada con la producción de múltiples desoves, ya que se observó que las múltiples desovadoras transfieren adecuadamente sus reservas y producen huevos de alta calidad. Esto es, se encontró que los huevos pertenecientes a un mayor orden de desove presentaron altas concentraciones de proteínas, lípidos, triglicéridos, ácidos grasos y vitelina. Por otra parte, se encontró que la calidad de la progenie (huevos y larvas), evaluada en términos de variables morfológicas (de crecimiento), productivas (porcentaje de fertilización, eclosión, número de huevos y número de nauplios) y de desempeño (supervivencia larvaria en cultivo y supervivencia a pruebas de estrés) no se deterioran a lo largo de los desoves consecutivos que una misma hembra presenta. Sin embargo, los resultados de este trabajo indicaron que es importante separar el efecto del tiempo en producción y el de los desoves consecutivos (“orden desove”), ya que el tiempo en producción sí tiene un efecto negativo sobre la calidad de la progenie producida. Una vez que se determinó que la condición de las múltiples desovadoras y la calidad de su progenie no es afectada negativamente en desoves consecutivos, se evaluó si algunas de las variables analizadas podían ser utilizadas como criterios predictivos de la capacidad de desovar múltiples veces, obteniendo simultáneamente larvas de calidad. Primeramente, se observó que el número de días entre la ablación y el primer desove fue significativamente menor en las hembras con un mayor número de desoves, observando que las hembras que desovan dentro de los primeros 10 días después de la ablación presentan una alta probabilidad de tener más de un desove, y que aquellas que no desovan dentro de estos 10 días no desovan en los siguientes 19 días o sólo presentan un desove. Este fue un primer criterio predictivo, pero debido a que no todas las hembras que desovan dentro de los primeros 10 días después de la ablación son múltiples desovadoras, fue necesario determinar otros caracteres que pudieran ser complementarios. El peso y longitud de las hembras fueron de las primeras características que se evaluaron, y se encontró que las hembras con un mayor número de desoves y huevos presentaron un mayor peso y longitud. Así mismo, en este estudio se estimó un índice de condición (basado en la relación entre el peso y la longitud) observándose que las hembras con múltiples desoves presentaron un mayor índice de condición que las hembras con un solo desove. Adicionalmente, se evaluaron algunas variables asociadas con el nivel de reservas. Si la condición inicial que presentan las hembras y, por tanto, sus niveles de reservas determinan la capacidad de desovar múltiples veces, entonces algunas características en las mismas, así como en su primer desove como son las reservas bioquímicas, podrían ser utilizados como posibles criterios predictivos. Las características productivas, bioquímicas y morfológicas del primer desove de las hembras fueron clasificadas con relación al número total de desoves que presentaron al final del periodo de producción evaluado (aproximadamente 30 d), encontrándose un alto porcentaje de fertilización, mayor tamaño de huevos (diámetro), mayor número de huevos, y niveles más altos de triglicéridos y vitelina en los huevos pertenecientes al primer desove de las hembras múltiples desovadoras en comparación con hembras con pocos desoves. El hecho de encontrar que existen algunas variables predictivas de la capacidad de múltiples desoves fue el primer paso, ya que el objetivo final era conocer si de existir características predictivas, estas presentaban variación genética, lo cual haría factible la posibilidad de mejorar la capacidad reproductiva de las hembras mediante el establecimiento de un programa de mejoramiento genético. Para determinar si existía variación genética y cual era su magnitud, se realizaron estimaciones del parámetro conocido como ‘heredabilidad’ para los diferentes caracteres reproductivos, principalmente para aquellos definidos como caracteres predictivos de la capacidad de desovar múltiples veces: días al primer desove, número y tamaño de huevos pertenecientes al primer desove, y concentración de triglicéridos, vitelina y proteínas en huevos del primer desove. Las estimaciones de heredabilidad fueron obtenidas a partir de hermanos carnales, utilizando dos modelos. En uno se utilizó otro caracter como covariable con base en las relaciones conocidas entre algunos caracteres que fueron confirmadas en este trabajo. En un segundo modelo, las estimaciones fueron realizadas sin el uso de covariables. Independientemente del modelo utilizado, las heredabilidades más altas fueron las obtenidas para los caracteres ‘días al primer desove después de la ablación’ (h2 = 0.41 a 0.54), y concentración de vitelina (h2 = 0.28 a 0.47) y triglicéridos (h2 = 0.20 a 0.35) en huevos del primer desove. Heredabilidades menores fueron obtenidas para la concentración de proteínas (h2 = 0.13 a 0.18) y el número de huevos (h2 = 0.09 a 0.17), mientras que el diámetro de los huevos (h2 = 0 a 0.07) y las concentraciones de lípidos en huevos fueron de cero o insignificantes. En general, las heredabilidades para los caracteres incrementaron con el uso de la covariable excepto para los niveles de lípidos, para los cuales la heredabilidad fue de 0 con o sin el uso de la covariable. Las estimaciones de heredabilidad, así como las de algunas correlaciones fenotípicas y genéticas realizadas en este trabajo, además de proveer con la primera evidencia de la existencia de variación genética para caracteres reproductivos en peneidos, indican que los caracteres previamente definidos como predictivos (días al primer desove, niveles de triglicéridos y vitelina en huevos del primer desove) presentan la suficiente variación genética para ser utilizados en un programa de mejoramiento genético dirigido hacia la mejora de la capacidad reproductiva de las hembras de camarón blanco. La variación genética encontrada para estos caracteres reproductivos a la edad de desove nos llevó a preguntar si ésta variación podía estar asociada con algunas características medidas al inicio de la gametogénesis y por ende a una edad más temprana. El contar con criterios predictivos sujetos a selección para una alta capacidad reproductiva a una menor edad/talla puede resultar en importantes ganancias económicas al reducir el número de organismos mantenidos hasta edad/talla de reproductor. Con este fin, se realizó un estudio en donde se analizaron diferentes caracteres relacionados con la gametogénesis en hembras sub-adultas, de 7 meses de edad y un peso aproximado de 19 g. Primeramente y con el fin de obtener un valor cuantitativo y no sólo descriptivo de la madurez de las hembras al inicio de la gametogénesis, para cada hembra se obtuvo el número total de ovocitos, el número de ovocitos previtelogénicos, el número de ovocitos vitelogénicos, el área total del ovario, el diámetro promedio de los ovocitos, y un índice de madurez que representa el área total ocupada por todos los ovocitos presentes en el ovario. Estos dos últimos caracteres, diámetro medio de los ovocitos (DM) y madurez del ovario (MO), fueron elegidos sobre la base de que en ellos están contenidos tanto él numero como el diámetro de todos los ovocitos presentes en toda la superficie del ovario, y ambos son valores cuantitativos con una distribución normal, permitiendo el análisis genético o de estimación de la heredabilidad. Con el análisis de heredabilidad se determinó que las fases tempranas del desarrollo gonádico están determinadas genéticamente, sustentado por las altas heredabilidades encontradas para los caracteres DM y MO (h2 = 0.57 y h2 = 0.71). Una vez determinado esto, la pregunta que surgió fue: ¿existe alguna asociación entre los caracteres evaluados al inicio de la gametogénesis con los caracteres evaluados en las mismas familias de la población pero en talla reproductiva? A este respecto, encontramos que los caracteres evaluados en sub-adultos de camarón, como el DM y el MO, están positivamente correlacionados con la fecundidad en adultos (número de desoves, número de huevos en el primer desove y número de huevos totales), e inversamente correlacionados con la latencia al primer desove. Estos resultados permiten proponer que la selección para mejorar la capacidad reproductiva en adultos de camarón podría auxiliarse con información obtenida en sub-adultos. Sin embargo, puesto que la evaluación en estadios iniciales de gametogénesis implica el sacrificar organismos y analizar histológicamente la información de madurez del ovario, es importante definir otras características asociadas a la madurez del ovario que puedan ser predictivas de la capacidad de madurar. A este respecto, se evaluó en hembras adultas sin ablación la concentración de diferentes componentes bioquímicos en la hemolinfa con fines de definir si alguno podía ser utilizado como un indicador predictivo del estadio de madurez de las hembras. Se encontró que la concentración de vitelogenina en hemolinfa de hembras no ablacionadas fue mayor en aquellas hembras que posteriormente a la ablación alcanzaron un estadio de madurez mas avanzado. Se propone continuar en un futuro con la evaluación de la vitelogenina en hembras sub-adultas, así como con la estimación de la heredabilidad de ese caracter. En conclusión, dados los resultados obtenidos en este estudio, se puede concluir que las hembras con la capacidad de desovar múltiples veces son adecuadas para incrementar la producción de camarón con la obtención de larvas de calidad, y que los días entre la ablación y el primer desove, combinado con los niveles de vitelina de huevos pertenecientes al primer desove, pueden ser utilizados como criterios predictivos de la capacidad de desovar múltiples veces, y dada la heredabilidad estimada, pueden ser utilizados en un programa de mejoramiento genético dirigido hacia la mejora genética de la capacidad reproductiva de las hembras de camarón blanco.
    Description: In shrimp larvae production it has been found that mature females have a different reproductive potential, this in spite of using the same maturation conditions on all females, and of all being of the same age and similar size. A large percentage (75%) of the females never spawns or produce only one and unviable spawn, whereas a small percentage (25%) of the females have the capacity to spawn multiple times and they are responsible for most of the larvae produced (50% - 70%). In a commercial setting, it has been reported that multiple spawners can have up to 25 spawns in a three-month period. Unproductive females have a high cost for producers because of the feeding and space these females utilize without producing quality spawns, reason why it has been suggested that only females with multiple spawning capability should be used to improve production. The use of multiple spawners would result in a larger number of spawns per female per area, increasing thus the yield per tank. However, distinguishing multiple spawners from other females has proven to be difficult, and the establishment of criteria and methodologies that allow for the identification of those females has been identified as a priority in shrimp larvae production. However, because until now the available information on the physiological condition of females with multiple spawning capabilities, and the larvae they produce has been conflicting, it was first necessary to define if the physiological condition of multiple spawners and the quality of the larvae they produce was not affected negatively by that capability. Once that was established, two strategies were proposed to identify multiple spawning capabilities of females. The first one was to find predictive criteria of a good reproductive potential, and the second one was to define if those predictive criteria of a multiple spawning capability were genetically determined, and had sufficient genetic variance such that genetic improvement programs can be applied. To evaluate the effects of multiple spawning on physiological condition of the females and the quality of the offspring they produced, productive, biochemical, morphological, and histological approaches were used. It was found that multiple spawner females have a shorter latency to first spawn after being ablated, have a larger weight, length, and condition index than females never spawning or spawning only once. It was also determined that the biochemical composition of the hemolymph, hepatopancreas, and ovaries is not affected by multiple spawns when compared with single spawns. Therefore, it was concluded that multiple spawners can satisfy their gonads energetic demands without affecting reserves, and that their capacity to assimilate, accumulate, and mobilize reserves is sufficient to sustain the metabolic demand associated with multiple spawning. Most importantly, it was also found that these females can transfer their reserves optimally to the eggs they produce irrespectively of the spawn order. That is, eggs from the fourth or more spawns a multiple spawner female had, had large concentrations of proteins, lipids, triacylglycerides, fatty acids, and vitellin. Furthermore, it was found that the percent fertilization and hatching, the total number of eggs and nauplii, and the survival during larvae culture and that to stress tests did not decrease in progeny produced by consecutive spawns. It was also concluded that contrary to the lack of a negative effect of multiple spawns on progeny quality, there is an effect on shrimp larvae production resulting from what is named ‘time in tanks or production’. This effect is a result of the sampling of females with different reproductive capabilities in a given point of time during reproduction in a hatchery, and does not necessarily indicates reproductive exhaustion of the females, because unproductive females do not even have the opportunity to become ‘reproductively exhausted’ as they never spawn, or spawn only one time during the time kept in the reproductive tanks. Once it was determined that multiple spawners and their progeny were not affected negatively by the consecutive spawning, some of the variables analyzed were evaluated for their predictive capability regarding multiple spawning capacities. It was found that the number of days to first spawn after ablation was significantly shorter for females with four or more spawns, and that females spawning during the first 10 days after ablation were those with a large probability of producing multiple spawns later. However, because not all females spawning within the first 10 days after ablation are in fact multiple spawners, other predictive characteristics were necessary to identify multiple spawners. Total weight and length of females were one of the first characteristics evaluated, finding that those females with the larger number of spawns in approximately 30 d were those females which at ablation were the heaviest, had the largest condition index, and during their first spawn produced the larger number of eggs. It was further questioned if the quality of the first spawn of females differed between multiple spawners as that seen in one or few times spawners. If so, this would provide with additional predictive characteristics to select multiple spawners since an early time in the reproduction tanks. It was found that in fact, the first spawn of multiple spawners had a large percent fertilization, larger egg diameter, a tendency for a larger number of eggs, and larger concentrations of vitellin and triacylglycerides in those eggs. In as much as these predictive criteria can be used immediately by hatcheries to reduce costs associated with the keeping of unproductive females, improvement of the multiple spawning capability can be systematically done through the establishment of a genetic improvement program. However, the question of whether those predictive criteria were genetically determined, or had sufficient genetic variance in the population evaluated had to be answered first. This was achieved through the estimation of the parameter known as ‘heritability’ for those characteristics defined as predictive of a multiple spawning capability; days for first spawn to occur, total number of eggs and their mean diameter, and vitellin, proteins, triacylglycerides, and lipids concentration in first spawned eggs. Moderate to large heritabilities were found for days to first spawn (h2 = 0.41 to 0.54) and for vitellin and triacylglycerides concentration in eggs (h2 = 0.28 to 0.47 and h2 = 0.20 to 0.35, respectively), and insignificant to low heritabilities were found for number and diameter of eggs (h2 = 0.09 to 0.17 and h2 = 0 to 0.07), and for lipids and proteins in eggs (h2 = 0 and h2 = 0.13 to 0.18). In all these estimates, the lower estimate was obtained without the use of covariates, and the larger estimate was obtained after using covariates appropriate to each of those traits. The increase in heritabilities in all cases by the use of the covariate might be a result of the inclusion of the genetic variance (and genetic covariance) of the trait used as a covariate in the genetic variance of the trait being evaluated. Because selection would produce the largest response on traits with the largest heritabilities, these results suggest it will be better to use the traits corrected by their covariate in a selection program. However, because there are also genetic covariances between the direct traits and those used as covariate, it would be important to monitor the correlated responses in the traits used as covariates. Irrespective of which traits are used, these results provide with the first estimates of heritability for reproductive traits in penaeid shrimp, and with the first indication that selection might improve the reproductive quality of shrimp at adult sizes. However, the next question was: given that there is genetic variability present at adult or reproduction age, is there also genetic variability in traits measuring gonad development at the onset of gametogenesis?. If so, the next question was, can the reproductive performance at adult ages can be predicted from females early reproductive stages ?. To answer those questions gonad development was assessed in the same population than before, but at an age of 7 months, when the females weighted between 17 and 21 g. All females were in early developmental stages, with the most advanced type of oocyte being a few vitellogenic ones in some females, and mostly previtellogenic oocytes in all females. Heritabilities were estimated for total numbers of oocytes, numbers of previtellogenic oocytes, number of vitellogenic oocytes, and two derived traits; oocytes mean diameter (the weighted mean of all oocytes types present in the ovary) and ovary maturity (the total area occupied by all the oocytes in the ovary). It was found that both of the derived traits, oocytes mean diameter and ovary maturity had large heritabilities (h2 = 0.71 and h2 = 0.57), whereas the heritabilities for total number of oocytes, numbers of previtellogenic or vitellogenic were all zero. However, even if the heritabilities estimated for numbers of oocytes were all zero, it was found that there was a correlation between the traits measured at early ages with reproductive traits measured in adults. That is, the number of vitellogenic oocytes, the mean oocytes diameter, and the ovary maturity were larger for families which in adult age had the largest fecundity and the largest number of spawns, and that those families with the largest mean oocytes diameter and ovary maturity were those families that in adult age spawned first, that is, had the shortest latency to first spawn. These results indicate that traits measured earlier than the age of spawning can be used to improve the reproductive quality in adult shrimp. However, because this requires sacrificing the organisms, and time-consuming histological analyses, other traits are necessary to be able to predict reproductive performance before actually placing the females in reproductive laboratories. At this respect, one candidate trait is the concentration of vitellogenin in hemolymph of females before ablation, as it was also found in the last study of this thesis that females with the largest vitellogenic concentration in hemolymph before ablation were those that after ablated had the largest gonad maturity. The evaluation of the existence of genetic variation for this last traits is pending, but will be carried on shortly.
    Description: CONACYT
    Description: Múltiples-desoves, vitelina, triglicéridos, heredabilidad,correlaciones-genéticas,gametogénesis
    Keywords: Genetics ; Crustacean culture ; Reproduction ; Crustacean culture ; Reproduction ; Genetics
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations
    Format: 270pp.
    Location Call Number Expected Availability
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  • 6
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: Enmarcado dentro de un programa de mejoramiento genético de camarón blanco (Litopenaeus vannamei) y con fines de evaluar la variabilidad genética dentro de dicho programa, se identificaron marcadores moleculares tipo microsatélites, abarcando desde su secuenciación, caracterización, diseño de iniciadores, optimización del PCR y análisis de ajuste a una herencia mendeliana. Para caracterizar a los microsatélites se construyó una genoteca parcial Sau3A1 con aproximadamente 2000 clonas. Para identificar a los microsatélites se siguieron dos estrategias: A) secuenciado directo de clonas y B) secuenciado de clonas que hibridaran positivamente con dos sondas biotiniladas (CT)10 y (GT)10. Los microsatélites identificados fueron principalmente dinucleótidos, 58.82 % (1/0.42 kb), seguidos de trinucleótidos, 27.73 % (1/0.88 kb), tetranucleótidos, 9.25 % (1/2.7 kb), y pentanucleótidos, 4.2 % (1/5.84 kb). El microsatélite (CT)n fue el mas abundante seguido de (GT)n, coincidiendo con un reporte previo para esta misma especie, a pesar de que en Penaeus monodon, y en la mayoría de los artrópodos y vertebrados, el dinucleótido (GT)n es el mas abundante. La elevada presencia de una región previamente reportada de un satelite/microsatélite (PVS1) en las clonas (43.33 %), y por ende en el genoma de L. vannamei (1/0.8 kb) disminuyó la probabilidad de identificar nuevas regiones microsatélites, por lo que se propone conformar librerías de DNA genómico cortando con enzimas de restricción (ej. HaeIII, AluI, o HincII, vector SmaI) que no reconozcan tal región. Después de secuenciar 90 clonas (29,199 pb), e identificar 119 regiones microsatélites en 56 de éstas, con una abundancia de microsatélites de 1 cada 0.25 kb, se evaluaron 25 pares de iniciadores diseñados en las zonas flanqueantes de los microsatélites para amplificarlos mediante la “reacción en cadena de la polimerasa” (PCR). Siete fueron los microsatélites amplificados, de los cuales cinco presentaron claros patrones de bandeo. Los cinco microsatélites amplificados exitosamente por PCR tienen un elevado potencial para la evaluación de variabilidad genética en poblaciones naturales de L. vannamei. De los dos microsatélites más polimórficos (Pvan1758 y Pvan1815) se optimizó la reacción de PCR hasta interpretar correctamente sus diferentes variantes alélicas y genotipos individuales. Ambos loci-microsatélites analizados (Pvan1758 y Pvan1815) se ajustaron a una herencia mendeliana, al evaluar su segregación alélica en la progenie de tres familias, corroborando con el genotipo materno y logrando inferir el genotipo paterno. En el locus Pvan1815, se observaron alelos nulos, lo cual se resolvió al manejar condiciones menos astringentes en el PCR (mayor concentración de MgCl2). Lo anterior aumentó la confiabilidad de estos microsatélites para su posterior aplicación. Los microsatélites Pvan1758 y Pvan1815 se usaron para evaluar la variabilidad genética a lo largo de tres generaciones de camarón cultivado siguiendo una estructura familiar. A partir de organismos de una línea domesticada de Los Melagos Son.-Venezuela (MV) (G0 o población fundadora) se produjeron dos generaciones consecutivas (G1 y G2) de camarón blanco. El propósito de este estudio fue monitorear la variabilidad genética desde la población fundadora hasta la segunda generación, para establecer si los niveles de variabilidad eran los adecuados para proseguir con un programa de selección a largo plazo. La variabilidad genética evaluada en términos de heterocigosidad, tanto observada (Ho) como esperada (He) no cambió significativamente a lo largo de las generaciones (Ho = 0.65 - 0.72; He = 0.77 - 0.71) situándose alrededor del valor observado (Ho) promedio reportado para especies silvestres (0.666) y por arriba del reportado en especies cultivadas (0.594). La variabilidad genética evaluada en número de alelos (nA) mostró un ligero aumento debido a la ganancia de alelos raros, en tanto que en el número de alelos efectivos (ne) se observó una reducción del 16.6 % de G0 a G2. El número de alelos (nA = 7.5 – 10) y el número efectivo de alelos (ne = 4.16 – 3.47) se situó por debajo de lo observado en poblaciones silvestres pero por arriba de lo reportado en poblaciones cultivadas. Se observaron diferencias en frecuencias alélicas en generaciones consecutivas en uno (G0-G1) o ambos loci (G1-G2), debido al aumento y disminución de ciertas variantes alélicas, lo cual puede ser atribuido a la contribución de los machos MV, que en la G0 no fue incluida en el análisis y en la G2 representó una nueva introducción de variabilidad. A pesar de unos niveles de variabilidad genética aceptables en términos de heterocigosidad, los cambios en el número de alelos efectivos (ne) muestran una tendencia previa a permanecer 3 a 4 alelos en ambos loci, lo cual parece indicar que la población fundadora MV ya mostraba una reducción de variabilidad genética, la cual puede ser corregida durante las etapas tempranas del programa de crianza al introducir nuevos organismos con variabilidad genética diferente. Para incrementar la variabilidad genética en G3, varios individuos del programa fueron apareados con reproductores de una línea colombiana. Un análisis preliminar de los reproductores colombianos (n = 23) reveló valores superiores de variabilidad (nA = 10, ne = 6.85, Ho = 0.74, He = 0.87), diferentes frecuencias alélicas, y dos alelos exclusivos en ambos microsatélites que permitirá distinguir entre líneas. El monitoreo de la variabilidad genética demostró ser útil y deberá continuar en este y otros programas, especialmente antes y después de que la selección sea aplicada. La inclusión de otros marcadores genéticos será útil, no solamente para complementar las evaluaciones de variabilidad genética, sino también para el seguimiento de pedigríes y posible asociación con características importantes a nivel de producción (QTLs).
    Description: As an integral part of a genetic breeding program of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) the genetic variability was evaluated with molecular markers, specifically microsatellites identified de novo, including their characterization, sequencing, primers design, PCR optimization, and agreement to Mendelian inheritance expectations. A Sau3A1 partial genomic library with 2000 clones was produced. Two strategies were followed to identify microsatellites: A) direct sequencing of clones, and B) sequencing of positive clones to biotinylated probes (CT)10 and (GT)10. The most abundant identified microsatellites were dinucleotides, 58.82 % (1/0.042 kb), followed by trinucleotides, 27.73 % (1/0.88 kb), tetranucleotides, 9.25 % (1/2.7 kb), and pentanucleotides, 4.2 % (1/5.84 kb). The most abundant microsatellite was (CT)n followed by (GT)n, in agreement with a previous report in L. vannamei and contrasting with Penaeus monodon and most of the arthropods species where (GT)n is the most abundant dinucleotide. There was a previously reported satellite/microsatellite region (PVS1) in 43.33 % of the clones, resulting in a high abundance in the L. vannamei genome (1/0.8 kb). Because the presence of this microsatellite in the shrimp genome reduces the possibility of finding new microsatellites, we propose the construction of libraries by cutting with restriction enzymes that do not recognize any sequence in the PVS1 region (i.e. HaeIII, AluI, or HincII, vector SmaI). After sequencing 90 clones (29,199 bp), and identifying 119 microsatellite regions in 56 clones, an abundance of one microsatellite per 0.25 kb, the amplification by PCR of 25 designed primers pairs was evaluated. Seven microsatellites were amplified, and the banding pattern was clearly interpreted in five of them. These microsatellites have a high potential in genetic variation studies of populations of L. vannamei. The PCR amplification of the most polymorphic microsatellites (Pvan1758 y Pvan1815) was optimized to identify alleles and genotypes. Both microsatellites agreed with Mendelian expectations when the offsprings of three families were evaluated. The maternal genotype was verified and the paternal was inferred. The locus Pvan1815 showed null alleles, which were resolved decreasing the stringency of the PCR reaction increasing MgCl2 concentration. These analyses and modifications increased the confidence in the use of these microsatellites in genetic variation studies. Genetic diversity in a shrimp-breeding program with an established pedigree was monitored for three generations by Pvan1578 and Pvan1815 microsatellites. Two consecutive generations were produced (G1 and G2) using as a founder stock (G0) a captive population in domestication from Los Melagos, Son.- Venezuela (MV line). The main goal was to monitor these generations to establish levels of genetic variation and proceed with a selection program. The amount of genetic variation, expressed as observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (He) did not change significantly through generations (Ho = 0.65 - 0.72; He = 0.77 - 0.71) with an average Ho around that reported for wild stocks (0.666) and higher than that observed in cultured stocks (0.594). The genetic variation expressed in number of alleles (nA) increased through the gain of rare alleles. Nevertheless, the mean number of effective alleles (ne) decreased 16.6% from G0 to G2. The average number of alleles at G0 and G2 (7.5 and 10), and the average number of effective alleles (4.16 and 3.47) were less variable than those from wild populations, but higher than those from inbred stocks. There were significant differences in allele frequencies in one (G0-G1) or both (G1-G2) microsatellites, caused by a significant frequency increase or decrease of certain alleles through the contribution of the newly introduced MV male breeders. The MV male variability was not included in G0 but was already considered at the G2 as a new introduction of variability. In spite of the acceptable genetic variation in heterozygosity, the decreased effective number of alleles (ne) through generations highlights the previous trend of 3-4 alleles at both loci to dominate. These reduced ne might indicate that a certain reduction in variability already existed in the initial MV line used as broodstock, which could be corrected during this early stages of the breeding program by introducing new and different organisms. To increase the genetic variation at a G3, several individuals in the breeding program were mated with breeders from a Colombia line. A preliminary analysis of the Colombian breeders (n = 23) revealed higher values of variability (nA = 10, ne = 6.85, Ho = 0.74, He = 0.87), different allele frequencies, and two exclusive alleles in both microsatellites that allow the distinction between the lines. The monitoring of genetic variability has proved useful and should be maintained in this and other breeding programs, especially before and after selection is applied. The inclusion of other genetic markers will be useful, not only to complement the evaluations of genetic variability, but also for pedigree assessments and possible association with productive traits.
    Description: CONACyT (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología)
    Description: Litopenaeus vannamei; microsatélites; PCR; variabilidad genética
    Keywords: Genetics ; Aquatic animals ; Genetics ; Aquatic animals
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations
    Format: 132
    Location Call Number Expected Availability
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  • 7
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: La producción de triploides mediante la manipulación de ploidías por métodos químicos ha demostrado ser un éxito en la producción comercial de varias especies, siendo el caso más conocido el del ostión japonés Crassostrea gigas. La ventaja de los triploides de moluscos sobre los organismos diploides se debe a su alta tasa de crecimiento, resultado de ser total o parcialmente estériles. Los triploides son incapaces de realizar la meiosis I debido a que sus cromosomas (impares) no pueden completar la sinapsis durante la profase, fallan en la producción de gametos y la energía que sería utilizada para la gametogénesis se invierte alternativamente en crecimiento somático. Actualmente la investigación en este campo se enfoca hacia mejorar el éxito en la producción de triploides, evaluando métodos alternos a los utilizados a la fecha (químicos ó físicos). Entre esos métodos se encuentra el que involucra apareamientos entre organismos tetraploides y diploides, produciéndose un triploide ‘biológico’. Sin embargo, para poder llegar a aplicar este método, el desarrollo de organismos tetraploides es necesario. Los organismos tetraploides pueden ser teóricamente producidos por la inhibición de la primera división celular, o por medio de técnicas de desactivación del ADN del esperma seguida por la inhibición de ambos cuerpos polares, o por inhibición del primer cuerpo polar en huevos derivados de organismos triploides y fecundados con esperma haploide. En este trabajo se evaluó la producción de poliploides de abulón rojo H. rufescens por varios métodos. La presunta existencia de híbridos de abulón entre las especies H. rufescens y H. fulgens en una granja comercial (BC Abalone) fue evaluada tanto en su veracidad como en la producción de alopoliploides de abulón. Utilizando hembras presuntas híbridas, se obtuvieron postlarvas triploides al inhibir la extrusión del segundo cuerpo polar con citocalacina B y se evaluaron dos métodos para la obtención de tetraploides: por medio de la inhibición de la primera división celular la cual no fue efectiva para la producción de larvas viables, y la ginogénesis combinada con la inhibición del primer cuerpo polar, siendo este último un método raramente utilizado y que permitiría teóricamente la producción rápida de tetraploides. Con este método se obtuvieron altos porcentajes de tetraploides, los cuales sin embargo no sobrevivieron más allá de larva trocófora. Una vez realizados los experimentos de inducción a la poliploidía, se realizó la evaluación genética de las hembras presuntas híbridas mediante análisis de cuatro enzimas. Las alozimas a utilizar fueron seleccionadas sobre la base de un análisis preliminar de cada una de las especies puras por la presencia de diferentes formas alélicas en cada una de las dos especies. Este análisis reveló que sólo una de las presuntas hembras híbridas utilizadas en los experimentos de inducción a la poliploidía fue en realidad híbrida. Estos resultados destacan la importancia de una certificación genética cuando se realizan hibridaciones entre especies, ya que se presumía que existía un lote de abulones 100% híbridos en la granja comercial, habiéndose encontrado que solamente el 25% fueron en realidad híbridos. En cuanto a la única hembra híbrida utilizada en los experimentos de poliploidía, no se obtuvo progenie indicando que existen problemas de viabilidad en los huevos producidos por hembras híbridas, y que existe una necesidad de mayores estudios. Adicionalmente a las alozimas, se evaluó la citometría de flujo como otro método para la certificación genética, demostrándose que este método no fue capaz de distinguir inequívocamente a los individuos híbridos ya que el intervalo de confianza de la media del pico de fluorescencia obtenida para los híbridos se superpone en la media de una u otra de las especies parentales. Otro aspecto investigado para el cual no existía información preliminar, fue la definición del número cromosómico de abulón rojo y de abulón azul, habiéndose encontrado que ambas especies presentan el mismo número cromosómico (2n = 36), información de alta utilidad en la evaluación de éxito en inducciones a la poliploidía a través de conteos cromosómicos. Adicionalmente, se obtuvieron los cariotipos de las dos especies (H. rufescens y H. fulgens), encontrando que estas presentan diferencias en índices centroméricos y longitud relativa de sus cromosomas, esto provee evidencia adicional a la existente en la bibliografía de que estas dos especies son diferentes.
    Description: Production of chemical triploids has demonstrated to be a successful method for the commercial improvement of different mollusk species, being the most known of all the Pacific oyster Crassostrea gigas. The triploid advantage results because of their larger growth rate, a consequence of the sterility induced when triploid. During gametogenesis, triploids are unable to complete meiosis I because during prophase chromosomes cannot complete synapsis and therefore fail in the production of gametes. The energy not used for gametogenesis and vitellogenesis is then channeled toward somatic growth. Today research in this field is focusing towards the improvement in the production of triploids, evaluating alternative methodologies to those associated with the production of chemical or physical triploids. Among these methods is the production of biological triploids, or the production of triploids by mating tetraploids with diploids. However, to produce biological triploids, development of tetraploid lines is necessary. Tetraploid organisms can be theoretically produced by inhibiting the first cell division or first mitosis, by combining techniques of UV sperm irradiation to deactivate DNA followed by inhibition of both polar bodies in the egg, or by inhibition of first polar body in eggs derived from triploids and fertilized with haploid sperm. In this research production of polyploid red abalone Haliotis rufescens was evaluated through different methods. The presumed existence of abalone hybrids between the species H. rufescens y H. fulgens in a commercial farm (BC Abalone) was evaluated for its veracity and for the production of allopolyploid abalone. By using the presumed hybrid females at the farm, triploids were produced by inhibiting with cytochalasin-B the second polar body in their eggs after fertilization. Two methods for the induction to tetraploidy were evaluated simultaneously: by inhibiting the first cell division (mitosis) and by combining gynogenesis methodologies (use of sperm UV irradiated and inhibition of second polar body to restore the diploid number) with additional inhibition of the first polar body. Inhibition of first cell division was not effective in producing tetraploids, resulting in unviable larvae, but the combination of gynogenesis with additional inhibition of the first polar body large percentages of tetraploids were produced, although none was found in larval stages larger than trochophore. After the induction to polyploidy experiments was completed, the evaluation of the females for their hybrid condition was done using starch electrophoresis methods. Four allozymes were selected on the basis of a preliminary analysis in each of the two species involved in the presumed hybrids, selecting four enzyme loci out of more than ten evaluated. In those four loci the two species had different and unique allelic forms, which would allow for their unique differentiation and the certification of hybrids when both allelic forms were present. The analyses of the females used in the polyploidy experiments indicated that only one of all used females was in fact a hybrid, and the remaining females were from the species H. rufescens. Additional males and females from the farm, not used in the experiments of polyploidy, were also analyzed to establish if they were hybrids, finding that from a presumed group with 100% hybrids, only 25% were in fact hybrids. These results show the importance of a genetic certification when hybridization experiments are performed, a certification seldom done in the literature of abalone hybridization studies. With regard to the only hybrid female utilized in the polyploid induction experiments, no viable progeny was obtained from it despite the number of eggs produced having been similar to non-hybrid females. This might be an indication of problems in hybrids meiosis processes, but further studies are necessary to understand whether and why hybrid females produce unviable eggs. Besides carrying the genetic certification by allozymes analyses, flow cytometry was evaluated to establish if through this method hybrids could be certified, by them having distinct fluorescent DNA peaks from both parental species. This was done after each female was genotyped by allozyme analyses, obtaining means and confidence intervals (CI) of the peak means of each species and the hybrids. This method allowed the differentiation of the two species by showing non overlapping CI exist for the amount of DNA in each species, but did not allow for the unique differentiation of the hybrids because the CI of the hybrids peak mean overlapped either one of the CI of the pure species. Finally, the last part investigated, and for which there was no preliminary information was the chromosome number of each of the species, red and blue abalone, having found that their share the same diploid chromosome number (2n = 36). However, karyotypes analyses of the species (H. rufescens y H. fulgens) indicated that there are differences in centromeric index and relative length of chromosomes, providing this with additional evidence to that in the literature of the fact that these are two different species.
    Description: CONACyT (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología)
    Description: Electroforesis
    Keywords: Genetics ; Fish ; Electrophoresis ; Genetics ; Fish ; Electrophoresis
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations
    Format: 132pp.
    Location Call Number Expected Availability
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  • 8
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: Le poulpe commun Octopus vulgaris représente, parmi les céphalopodes, la principale espèce exploitée par la pêche côtière surtout dans la région Sud de la Tunisie. Une analyse génétique basée sur l’approche moléculaire et de population est jugée nécessaire pour assurer une gestion crédible et durable du stock. L’analyse a porté sur le polymorphisme de l’ADN mitochondrial par séquençage d’un fragment du gène cytochrome b de taille 485pb chez 52 échantillons collectés dans deux localités différentes : îles de Galite (Nord) et Elketf –Zarzis (Sud). Les résultats obtenus montrent que sur les 52 séquences réalisées, il y’a 14 haplotypes différents dont deux partagés entre les deux localités. L’haplotype le plus représenté est rencontré chez 29 individus. Une différenciation génétique entre les deux lots a été mise en évidence (FST = 0.055 ; P〈0.05). Le détroit Siculo-Tunisien semble limiter le flux génique entre les deux rives de la Méditerranée et aurait donc agi comme une barrière biogéographique.
    Description: Among the common cephalopods, Octopus vulgaris is the main species exploited by the inshore fishing especially in the Tunisian Southern waters. Genetic analysis based on molecular and population approach is considered necessary to ensure a credible and sustainable management of the stock. The analysis focused on mitochondrial DNA polymorphism by sequencing 485pb fragment of the Cytochrome b gene in 52 samples collected from two different localities in Tunisia: Galite island (North) and Elketf-Zarzis (South ). The results showed that there were 14 different haplotypes of which two shared by the two groups. The most represented haplotype is (H2) encountered in 29 individuals. A genetic differentiation between the two groups was detected (FST = 0.055; P 〈0.05) suggesting that the Strait of Sicily limits genetic flow between the two Mediterranean areas and therefore, it would act as a biogeographic barrier.
    Description: Published
    Description: mtDNA
    Description: Octopus vulgaris
    Description: Genetic structure
    Keywords: Octopus ; Genetics ; Octopus fisheries ; Genetics
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Journal Contribution , Refereed , Article
    Location Call Number Expected Availability
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  • 9
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: El conocer la escala espacial y temporal de la variación fenotípica y genética en las especies marinas es fundamental para el entendimiento de los procesos ecológicos y evolutivos que influyen sobre la biodiversidad, proveyendo un marco explicativo para la conservación de las poblaciones de peces. La pescadilla de red (Cynoscion guatucupa, Actinopterygii, Sciaenidae), es un pez demersal, que tiene en Sudamérica una amplia distribución latitudinal, abarcando desde las costas de Río de Janeiro (Brasil) hasta las costas de la provincia de Chubut (Argentina). Habita zonas costeras y parte de la plataforma continental, en aguas marinas y estuarinas, y es la segunda, en importancia comercial de las especies costeras. La finalidad de este trabajo es efectuar un análisis comparativo desde el punto de vista de la morfometría geométrica y molecular (microsatélites) de dos sitios de alimentación de la pescadilla de red en regiones costeras de la provincia de Buenos Aires(Bahía Samborombón y “El Rincón”). Ambos sitios de pesca mostraron un exceso significativo de homocigotos debido a que probablemente los desoves estén estructurados temporal y/o espacialmente. El número efectivo (Ne) estimado para ambos sitios fue considerablemente alto. El test de AMOVA, al compararlos mostró que la principal fuente de variación se encuentra dentro de las poblaciones (99%) más que entre poblaciones (1%), no mostrando diferencias (p=0.23673). Asimismo se observó una baja diferenciación (FST = 0.0109) que podría deberse a un alto flujo génico entre las mismas, aunque se observó una heterogeneidad significativa en las frecuencias alélicas.
    Description: Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
    Description: Tesis (Licenciatura). Realizada en el Departamento de Biología, Laboratorio de Genética UNMdP- Mar del Plata, Argentina)
    Description: morfometría, genética, patrones merísticos, pescadilla de red, Cynoscion guatucupa
    Keywords: Genetics ; Morphometry ; Genetics ; Meristic counts
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Theses and Dissertations
    Format: 71
    Location Call Number Expected Availability
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  • 10
    Publication Date: 2021-05-19
    Description: FourmicrosatellitelociwereusedtoachievegeneticcharacterizationofsixstocksfromLitopenaeusvannamei usedforaquaculture inCuba:secondgenerationfromfirstintroduction(S2-1),firstgenerationfromthesecondone(S1-2),fromthethirdone(S1-3), andthefourthone(S1-4)andthecrossingsfromtwoparentalpopulation:firstgenerationfromthefirstwithfirstgeneration fromthethird(S1-1 × S1-3)andfirstgenerationfromthesecondwithfirstgenerationfromthethird(S1-2 × S1-3).66%(16/24) ofgeneticsystemsintotallociwereingeneticdisequilibrium.Thefourmicrosatellitelociwerepolymorphicforallsixstocks. MajorquantitiesofallelicvariantscorrespondtolocusPvan1758,whichisatthesametimethatonewherethereareprivate allelesfromfirstgenerationofthethird.AllFst comparisonsweresignificant.Thisindicatesbigdifferencesbetweenstocks.The highestvaluesarethoseinwhichthereispresenceofthesecondintroduction.Thisintroductionanditsdescendantsarealsomore consanguineous.
    Description: Published
    Description: Litopenaeus vannamei
    Description: Cuba
    Keywords: Genetics ; Aquaculture ; Shrimp culture
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Journal Contribution , Refereed , Article
    Location Call Number Expected Availability
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