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  • 1
    facet.materialart.
    Unknown
    Biological and Chemical Oceanography Data Management Office (BCO-DMO). Contact: bco-dmo-data@whoi.edu
    Publication Date: 2022-10-31
    Description: Dataset: Coral physiological and δ15N isotopic measurements.
    Description: Experimental coral physiological and δ15N isotopic measurements in October 2012 at Reef Systems Coral Farm, Ohio. For a complete list of measurements, refer to the full dataset description in the supplemental file 'Dataset_description.pdf'. The most current version of this dataset is available at: https://www.bco-dmo.org/dataset/839920
    Description: NSF Emerging Frontiers Division (NSF EF) EF-1041124
    Keywords: Coral calcification ; Photosynthesis ; Carbon budgets ; Chlorophyll a ; Protein ; Carbohydrates ; Lipids ; Energy reserves ; Nitrogen isotopes
    Repository Name: Woods Hole Open Access Server
    Type: Dataset
    Location Call Number Expected Availability
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  • 2
    Publication Date: 2022-05-27
    Description: © The Author(s), 2021. This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License. The definitive version was published in Gosselin, K. M., Nelson, R. K., Spivak, A. C., Sylva, S. P., Van Mooy, B. A. S., Aeppli, C., Sharpless, C. M., O’Neil, G. W., Arrington, E. C., Reddy, C. M., & Valentine, D. L. Production of two highly abundant 2-methyl-branched fatty acids by blooms of the globally significant marine cyanobacteria Trichodesmium erythraeum. ACS Omega, 6(35), (2021): 22803–22810, https://doi.org/10.1021/acsomega.1c03196.
    Description: The bloom-forming cyanobacteria Trichodesmium contribute up to 30% to the total fixed nitrogen in the global oceans and thereby drive substantial productivity. On an expedition in the Gulf of Mexico, we observed and sampled surface slicks, some of which included dense blooms of Trichodesmium erythraeum. These bloom samples contained abundant and atypical free fatty acids, identified here as 2-methyldecanoic acid and 2-methyldodecanoic acid. The high abundance and unusual branching pattern of these compounds suggest that they may play a specific role in this globally important organism.
    Description: This work was funded with grants from the National Science Foundation grants OCE-1333148, OCE-1333162, and OCE-1756254 and the Woods Hole Oceanographic Institution (IR&D). GCxGC analysis made possible by WHOI’s Investment in Science Fund.
    Keywords: Lipids ; Alkyls ; Bacteria ; Genetics ; Chromatography
    Repository Name: Woods Hole Open Access Server
    Type: Article
    Location Call Number Expected Availability
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  • 3
    Publication Date: 2022-03-06
    Description: This work presents the data on the content of cadmium and arsenic in the viscera (visceral mass) of the veined rapa whelk Rapana venosa caught in the Azov Sea (Kerch Strait) and the Black Sea (Feodosia Gulf). In the viscera of the individuals from the Azov Sea, cadmium content was 8.6 mg/kg, and for the individuals from the Black Sea, this value was 3.5, with the allowable level 2.0 mg/kg as stipulated by TR CU 021/2011. Cadmium content in various internal organs of the investigated veined rapa whelk individuals varied. The highest content of cadmium (48 mg/kg) was recorded in the kidney of the individuals caught in the Azov Sea; cadmium content in the digestive gland also exceeded the allowable level. Arsenic content in the viscera of the individuals from the Azov Sea exceeded the allowable level by 7.8 %; this value was significantly lower for the Black Sea (0.1 mg/kg, while the established norm is 5.0 mg/kg). In several organs of the individuals from the Azov Sea (namely, the kidney, ovaries/testes, and digestive gland), arsenic content was within the normal values established by the regulations. The product derived from veined rapa whelk through enzymolysis and subsequent concentration by evaporation, was characterized by increased content of cadmium and arsenic. In terms of cadmium and arsenic content, ovaries and testes of the investigated individuals proved to be safe for consumption; their yield amounts to 10.9 % out of the entire visceral mass, and it is possible to use them as a source of valuable nutrients.
    Description: В работе приведены данные о содержании кадмия и мышьяка во внутренностях (висцеральной массе) рапаны Rapana venosa, выловленной в Азовском море (Керченский пролив) и Черном море (Феодосийский залив). Во внутренностях рапаны из Азовского моря содержание кадмия составляло 8,6 мг/кг, у рапаны из Черного моря — 3,5 мг/кг при допустимом уровне 2,0 мг/кг в соответствии с ТР ТС 021/2011. Отмечено различное содержание кадмия во внутренних органах рапаны. Почка рапаны, выловленной в Азовском море, является органом с самым высоким содержанием кадмия (48 мг/кг), несоответствие кадмия допустимому уровню установлено также в пищеварительной железе. Содержание мышьяка во внутренностях рапаны из Азовского моря на 7,8 % превышало допустимый уровень, у рапаны из Черного моря было значительно ниже — 0,1 мг/кг (норма 5,0 мг/кг). В отдельных органах рапаны из Азовского моря (почка, яичник/семенник, пищеварительная железа) содержание мышьяка отвечало установленным требованиям. Продукт, полученный в результате ферментолиза и последующего упаривания ферментолизата, характеризовался повышенным содержанием кадмия и мышьяка. Безопасными по содержанию кадмия и мышьяка являлись яичники/семенники рапаны, выход которых составлял 10,9 % от массы внутренностей. Они могут быть использованы для получения ценных нутриентов.
    Description: Published
    Description: Non Refereed
    Keywords: Rapana venosa ; Food safety ; Lipids ; Visceral mass ; Enzymolysis ; Kidneys ; Ovaries ; Cadmium ; Безопасность питания ; Жиры ; Почки ; Кадмий ; Ферментолиз ; Висцеральная масса ; ASFA_2015::P::Processing fishery products ; ASFA_2015::M::Marine molluscs ; ASFA_2015::A::Arsenic
    Repository Name: AquaDocs
    Type: Journal Contribution
    Format: pp.95-102
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  • 4
    Electronic Resource
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    Springer
    Calcified tissue international 14 (1974), S. 275-281 
    ISSN: 1432-0827
    Keywords: Calcification ; Cartilage ; Lipids ; Membranes ; Vesicles
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology , Medicine , Physics
    Description / Table of Contents: Résumé Les vésicules matricielles sont des particules extracellulaires, entourées par une membrane, qui sont nombreuses dans la matrice du cartilage en voie de calcification et qui sont en rapport morphologique avec le dépôt minéral. Les vésicules matricielles et les cellules de l'épiphyse d'os longs d'embryons de veaux sont libérées par digestion grâce à la collagénase et séparées par centrifugation différentielle. Les vésicules ainsi obtenues sont riches en lipides et contiennent significativement plus de sphingomyéline et phosphatidyl sérine que les fractions cellulaires. Le rapport moles de cholestérol sur moles de phospholipides totaux est plus élevé dans les vésicules que dans les cellules; ce résultat est en accord avec l'origine des vésicules au niveau des membranes cellulaires des chondrocytes.
    Abstract: Zusammenfassung Matrixvesikel sind extrazelluläre, membrangebundene Teilchen, welche in der Matrix von verkalkendem Knorpel gehäuft vorkommen und welche in morphologischem Zusammenhang mit der Mineralablagerung in diesem Gewebe stehen. Matrixvesikel und Epiphysenzellen aus Röhrenknochen von Kalbsembryonen wurden mittels Collagenaseverdauung freigesetzt und durch Differential-Zentrifugierung getrennt. Die Vesikelpräparate waren reich an Lipidien und enthielten bedeutend mehr Sphingomyelin und Phosphatidylserin als die Zellfraktionen. Das molare Verhältnis Cholesterol/Gesamtlipide war in den Vesikeln höher als in den Zellen; dieser Befund stimmt mit der Tatsache überein, daß die Vesikel ihren Ursprung in den Plasmamembranen der Chondrozyten haben.
    Notes: Abstract Matrix vesicles are extracellular, membrane-bounded particles which are abundant in the matrix of calcifying cartilage and which are morphologically related to the deposition of mineral in this tissue. The matrix vesicles and cells of the epiphyses of the long bones of fetal calves were liberated by digestion with collagenase and separated by differential centrifugation. Vesicle preparations were found to be lipid-rich and to contain significantly more sphingomyelin and phosphatidyl serine than cellular fractions. The ratio, moles cholesterol to moles total phospholipid, was higher in vesicles than in cells, a finding which is consistent with vesicles having their origins in the plasma membranes of the chondrocytes.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 5
    Electronic Resource
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    Springer
    Calcified tissue international 6 (1970), S. 1-10 
    ISSN: 1432-0827
    Keywords: Bone ; Dentin ; Enamel ; Lipids ; Calcification
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology , Medicine , Physics
    Description / Table of Contents: Résumé Le but de cette étude est l'analyse des lipides des tissus calcifiés au niveau de la dentine et de l'émail bovins et de l'os cortical humain. Les lipides extraits des tissues pulvérisés sont analysés qualitativement par chromatographie sur colonne. Des échantillons ont été déminéralisés et une seconde extraction a permis de comparer les résultats obtenus avec ceux de la première analyse. Les acides gras des lipides osseux sont étudiés par chromatographie en phase gazeuse et comparés à ceux de l'os spongieux et des expaces médulaires. Les tissus calcifiés contiennent du cholestérol et ses esters, des monoglycérides, des diglycérides, des triglycérides, des acides gras libres et divers phospholipides. A part certains cas, et en particulier l'émail bovin, où l'on n'a pas pu identifier des phospholipides, ces derniers sont constitués par de la lécithine, la lyso-lécithine, l'éthanolamine de phosphatidyle, la sphingomyéline, ainsi que par des substances qui pourraient être de l'acide phosphatidique et de la cardiolipine. La sérine de phosphatidyle a pu être isolée de la dentine bovine, seulement après déminéralisation, mais a pu être extrait de l'os à la avant et, après traitement à l'EDTA. D'autres lipides sont recueillis après déminéralisation à l'EDTA et une seconde dé minéralisation. Les lipides totaux extraits sont d'environ 20.28 mg/100 grammes de dentine, 1.97 mg/100 grammes d'émail et 2005 mg/100 grammes, d'os humain. Le constituant lipidique principal de l'os cortical humain est le triglycéride et la composition en acide gras est identique à celle de l'os spongieux et de la moëlle.
    Abstract: Zusammenfassung Drei verschiedene Materialien wurden untersucht: bovines Dentin, boviner Schmelz und menschliche Corticalis. Die aus den pulverisierten Geweben extrahierten Lipide wurden qualitativ mittels Säulenchromatographie analysiert. Die Proben wurden ebenfalls demineralisiert und ein zweites Mal extrahiert, damit die Resultate mit denjenigen vor der Demineralisation verglichen werden konnten. Die Fettsäuren der Knochenlipide wurden mittels Gaschromatographie untersucht und mit den Fettsäuren der Spongiosa und des Markes verglichen. In den verkalkten Geweben fanden sich Cholesterol, Cholesterolester, Monoglyceride, Diglyceride, Triglyceride, freie Fettsäuren und verschiedene Phospholipide. Mit einigen Ausnahmen, wie z. B. in bovinem Schmelz, wo Phospholipide nicht nachgewiesen werden konnten, bestanden diese Phospholipide aus Lecithin, Lysolecithin, Phosphatidyläthanolamin, Lysophosphatidyläthanolamin, Phosphatidylinositol, Sphingomyelin und Substanzen, welche Phosphatidsäure und Cariolipin sein könnten. Aus bovinem Dentin konnte Phosphatidylserin nur nach Demineralisation extrahiert werden; aus Knochen ließ es sich jedoch sowohl vor wie nach EDTA-Behandlung entfernen. Zusätzliche Lipide wurden aus Proben gewonnen, wenn diese mit EDTA demineralisiert und ein zweites Mal extrahiert wurden. Die gesamte aus den Geweben extrahierte Lipidmenge betrug im Mittel 20,28 mg/100 g Dentin, 1,97 mg/100 g Schmelz und 2005 mg/100 g menschlichen Knochen. Der Hauptteil der Lipide aus menschlicher Corticalis bestand aus Triglyceriden und die Zusammensetzung der Fettsäuren entsprach jener im Mark und in der Spongiosa.
    Notes: Abstract Three different materials were studied: bovine dentin, bovine enamel, and human cortical bone. Lipids extracted from pulverized tissues were analyzed qualitatively by paper chromatography and quantitatively by column chromatography. Sample materials were also demineralized and extracted a second time so that results could be compared to those obtained prior to demineralization. Fatty acids of bone lipids were investigated by vapor phase chromatography and compared to the fatty acids of trabecular bone and bone marrow. Calcified tissues were found to contain cholesterol, cholesterol esters, monoglycerides, diglycerides, triglycerides, free fatty acids, and various phospholipids. With some exceptions, such as bovine enamel where phospholipids could not be identified, these included lecithin, lysolecithin, cephalin, lysocephalin, monophosphoinositide, sphingomyelin, and substances which might be phosphatidic acid and cardiolipin. Phosphatidylserine was extractable from bovine dentin only after demineralization, but was removable from bone both before and after EDTA treatment. Additional lipids were obtained from sample materials if they were demineralized with EDTA and extracted a second time. The total lipids extracted from the tissues averaged 20.28 mg/100 g dentin, 1.97 mg/100 g enamel, and 2,005 mg/100 g human bone. The major portion of human cortical bone lipids was triglyceride and the fatty acid composition was similar to that of marrow and trabecular bone.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 6
    Electronic Resource
    Electronic Resource
    Springer
    Archives of microbiology 99 (1974), S. 47-59 
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Mitochondria ; Protein Synthesis ; Chemostat Oxygen ; Candida parapsilosis ; Cytochromes ; Lipids ; Respiration
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Notes: Abstract Candida parapsilosis grows oxidatively under aerobic conditions and fermentatively in micro-aerobic (0.2 μM oxygen) continuous culture. The amount of unsaturated fatty acids and sterol in cells and mitochondria, and the aerobic cytochromes are decreased in micro-aerobic cultures. In aerobic cells mitochondrial protein synthesis accounts for the formation of more than one-third of the proteins of the organelles; in micro-aerobic cultures, this declines to 5%. At the same time, minor but significant differences in the nature of the protein products formed by the mitochondrial system are evident in micro-aerobic and aerobic cells.
    Type of Medium: Electronic Resource
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  • 7
    Electronic Resource
    Electronic Resource
    Springer
    Archives of microbiology 101 (1974), S. 321-335 
    ISSN: 1432-072X
    Keywords: Endomycopsis ; Yeast ; Lipids ; Neutral Lipids ; Phospholipids
    Source: Springer Online Journal Archives 1860-2000
    Topics: Biology
    Description / Table of Contents: Zusammenfassung 1. Endomycopsis vernalis wurde durch verschiedene N-Gaben (1%, 0,125% Asparagin) fettarm (Serie A) und fettreich (Serie B) gezogen. Die Lipide der mit Ultraschall behandelten Zellen wurden extrahiert. Aus fettarmen Zellen wurden 14,3, aus fetreeichen Zellen 65,1% Gesamtlipid, bezogen auf fettfreie Trockensubstanz, erhalten. 2. Neutrallipide und komplexe Lipide wurden durch Gummimembrandialyse getrennt. Der Prozentanteil der komplexen Lipide ist in beiden Serien etwa gleich (3,4, 3,1%). Der Fettreichtum N-arm gezogener Zellen beruht also auf einem erhöhten Gehalt an Neutrallipiden. 3. Bei dünnschichtchromatographischer Auftrennung der Neutrallipide wurden Di- und Triglyceride, freies Ergosterin und Ergosterinester gefunden. Ihre Mengenanteile sind von den Ernährungsbedingungen abhängig. Fettreiche Zellen zeigen vor allem einen erhöhten Gehalt an Triglyceriden und Sterinestern. 4. Die Fettsäuren der Glyceride und der Sterinester wurden als Methylester gaschromatographisch bestimmt. Es wurden gefunden: gesättigte Säuren mit 14, 15, 16, 17 und 18 C-Atomen, die Monoensäuren 16:1 und 18:1, Linol- und Linolensäure. Hauptfettsäuren sind in allen Fällen Ölsäure (17–57%), Linolsäure (18–50%) und Palmitinsäure (10–18%). Die Di- und Triglyceride der fettarmen Zellen unterscheiden sich von den der fettreichen vor allem durch ein stärkeres Hervortreten der Linolensäure. Größere Unterschiede in Art und Menge der Fettsäuren zeigten die Sterinester der Serien A und B. 5. Die komplexen Lipide wurden dünnschichtchromatographisch identifiziert und säulenchromatographisch isoliert. Hauptanteile sind sowohl in Reihe A wie in Reihe B Phosphatidylcholin (36,5, 41,0%) und Phosphatidyläthanolamin (24,9 20,5%). In kleineren Mengen fanden sich Lysophosphatidylcholin, Lysophosphatidyläthanolamin, Phosphatidylserin, Monophosphoinositid, Diphosphatidylglycerin. Cerebrosidähnliche Substanzen werden vermutet. 6. Die Fettsäuren der Phosphatidylcholin- und der Phosphatidyläthanolamin-fraktionen wurden als Methylester gaschromatographisch bestimmt. In allen Fällen fanden sich die Säuren 16:0, 18:0, 18:1, 18:2, 18:3, außerdem in Spuren 17:0 und 16.1. Im Gegensatz zu den Neutrallipiden steht die Linolsäure stets an erster Stelle (53–83%), gefolgt von Ölsäure (8–24%) und Linolensäure (1–18%); Palmitinsäure (4–8%) und Stearinsäure (Spur-1%) treten stark zurück. Fettarme Zellen der Serie A unterscheiden sich von fettreichen der Serie B in den beiden näher untersuchten Phosphatidfraktionen vor allem durch einen höheren Anteil an Linolensäure und einen niedrigeren an Linolsäure.
    Notes: Abstract 1. Endomycopsis vernalis was cultivated on media with different N supply: series A 1%, series B 0,125% asparagine. Sonified cells were extracted and yielded 14.3% (A) and 65.3 (B) total lipids/non lipid dry matter respectively. 2. Neutral and complex lipids were separated by rubber membrane dialysis. There is no difference in the percentage of complex lipids of both series. The increase of lipids in cells grown on low N level is due to a higher content of neutral lipids. 3. Components of the neutral lipids, analysed by DC, were diglycerides, triglycerides, free and esterified ergosterol. Their percentage is influenced by the nutritional conditions. There is a significant increase of triglycerides and of sterol esters in the high lipid cells of series B. 4. Methyl esters of component fatty acids of glycerides and sterol esters were analyzed by GLC. Saturated acids C14, C15, C16, C17, C18, monoenic acids C16 and C18, linoleic and linolenic acids were found to be present. Major acids were in all cases 18:1 (17–57%), 18:2 (18–50%) and 16:0 (10–18%). Linolenic acid is higher in di-and triglycerides of low lipid cells of series A than in high lipid cells of series B. Both qualitative and quantitative differences of fatty acids were found in sterol esters of series A and B respectively. 5. The major components of complex lipids, identified by DC and isolated by CC, in both series, were phosphatidyl choline (A:36.5, B:41.0%) and phosphatidyl ethanolamine (A:24.9, B:20.5%) in addition to small amounts of lysophosphatidyl choline, lysophosphatidyl ethanolamine, phosphatidyl serine, monophosphoinositide, diphosphatidyl glycerol and, possibly cerebroside like substances. 6. Methyl esters of the fatty acids of phosphatidyl choline and ethanolamine from both series were determined by GLC. In all samples 16:0, 18:0, 18:1, 18:2 and 18:3 acids were present besides of traces of 16:1 and 17:0. In contrast to neutral lipids the major acid of phospholipids is linoleic (53–58%), followed by oleic (8–24%) and linolenic acid (1–18%). The percentages of palmitic (4–8%) and stearic acids (tr.-1%) are small. Low lipid cells of series A differ from high lipid cells of series B by an increase of linolenic, and a decrease of linoleic acids, both in phosphatidyl choline and phosphatidyl ethanolamine.
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