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Bacterial physiology: Hip persisters (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 526 (2015). doi:10.1038/nrmicro3538 Author: Cláudio Nunes-Alves Persisters are dormant bacterial populations that contribute to multidrug tolerance (MDT) because they are able to escape treatment with most antibiotics, which target metabolically active cells. A new study now characterizes the molecular basis for persister generation involving HipA, a kinase that inhibits protein synthesis

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Unveiling the pathogen behind the vacuole (2015)

Peter Liehl; Vanessa Zuzarte-Luis; Maria M. Mota

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 589 (2015). doi:10.1038/nrmicro3504 Authors: Peter Liehl, Vanessa Zuzarte-Luis & Maria M. Mota Many clinically relevant pathogens, including certain bacteria and protozoan parasites, have developed an intracellular lifestyle that enables them to nestle in customized vacuoles. Although these pathogens are protected from extracellular defences, recent findings indicate that host cells have evolved multiple strategies to unmask the pathogen

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Structural biology: CRISPR preorders for Cas (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-08-12

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 459 (2015). doi:10.1038/nrmicro3547 Author: Naomi Attar In type II CRISPR−Cas adaptive immunity systems, a CRISPR RNA (crRNA) forms a hybrid structure with a trans-activating crRNA (tracrRNA) that, together with recognition of a protospacer adjacent motif (PAM), guides the Cas9 endonuclease protein to foreign DNA. Jiang et al. solved a

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Sexual development in Plasmodium parasites: knowing when it's time to commit (2015)

Gabrielle A. Josling; Manuel Llinás

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 573 (2015). doi:10.1038/nrmicro3519 Authors: Gabrielle A. Josling & Manuel Llinás Malaria is a devastating infectious disease that is caused by blood-borne apicomplexan parasites of the genus Plasmodium. These pathogens have a complex lifecycle, which includes development in the anopheline mosquito vector and in the liver and red blood cells of mammalian hosts, a process

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Bacterial protein networks: properties and functions (2015)

Athanasios Typas; Victor Sourjik

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 559 (2015). doi:10.1038/nrmicro3508 Authors: Athanasios Typas & Victor Sourjik Distinct cellular functions are executed by separate groups of proteins, organized into complexes or functional modules, which are ultimately interconnected in cell-wide protein networks. Understanding the structures and operational modes of these networks is one of the next great challenges in biology, and microorganisms are

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Microbiome: An encrypted growth signature (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 527 (2015). doi:10.1038/nrmicro3544 Author: Naomi Attar Most metagenomic analysis methods are based on the relative abundance of a marker gene or of sets of genes in functional pathways. However, these methods offer a static view of microbial composition and provide no information on growth dynamics. Korem et al. devised a

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The yin and yang of hepatitis C: synthesis and decay of hepatitis C virus RNA (2015)

You Li; Daisuke Yamane; Takahiro Masaki; Stanley M. Lemon

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 544 (2015). doi:10.1038/nrmicro3506 Authors: You Li, Daisuke Yamane, Takahiro Masaki & Stanley M. Lemon Hepatitis C virus (HCV) is an unusual RNA virus that has a striking capacity to persist for the remaining life of the host in the majority of infected individuals. In order to persist, HCV must balance viral RNA synthesis and decay in infected cells. In

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Techniques & applications: A first genome assembly for nanopore sequencing (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-08-12

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 459 (2015). doi:10.1038/nrmicro3536 Author: Naomi Attar The 'MinION' nanopore sequencer works by applying an ionic current across an electrically resistant membrane permeabilized by protein nanopores. The sequence of DNA molecules passing through each nanopore is determined by measuring changes to this current. Nanopore sequencers can vastly increase the permissible length of

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Bacterial toxins: Toxins actin(g) up (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 526 (2015). doi:10.1038/nrmicro3539 Author: Cláudio Nunes-Alves Several bacterial pathogens, including Vibrio cholerae, use toxins containing actin crosslinking domains (ACDs) to interfere with the ability of the host cell to polymerize actin. The toxicity of ACD-containing toxins is thought to arise via sequestration of bulk amounts of actin as non-functional oligomers,

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Structural biology: T6SS cases its own tail (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 527 (2015). doi:10.1038/nrmicro3543 Author: Naomi Attar The bacterial type VI secretion system (T6SS) is a nanomachine that punctures the membranes of competing bacteria and, during pathogenesis, those of host cells. In addition to the tail, which is composed of a contractile sheath and a tipped arrow that punctures the membrane of

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Antimicrobials: Novel antibodies defeat dengue virus (2015)

Sarah Crunkhorn

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 525 (2015). doi:10.1038/nrmicro3542 Author: Sarah Crunkhorn Two recent studies report the development of monoclonal antibodies directed against novel epitopes within the viral envelope protein of dengue virus that prevent severe infection in mouse models.

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Bacterial genomics: Evolution of hypervirulence in Klebsiella (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 527 (2015). doi:10.1038/nrmicro3545 Author: Naomi Attar Hypervirulent Klebsiella pneumoniae is a globally emerging pathogen that causes pyogenic liver abscesses. Hypervirulent strains are restricted to capsular serotypes K1 and K2 and are particularly associated with the clonal complex K1 CC23. To understand the evolution of hypervirulence, Struve et al. sequenced

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Staphylococcal manipulation of host immune responses (2015)

Vilasack Thammavongsa; Hwan Keun Kim; Dominique Missiakas; Olaf Schneewind

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 529 (2015). doi:10.1038/nrmicro3521 Authors: Vilasack Thammavongsa, Hwan Keun Kim, Dominique Missiakas & Olaf Schneewind Staphylococcus aureus, a bacterial commensal of the human nares and skin, is a frequent cause of soft tissue and bloodstream infections. A hallmark of staphylococcal infections is their frequent recurrence, even when treated with antibiotics and surgical intervention, which demonstrates the bacterium's ability to

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Microbial ecology: Sorting out viral dark matter (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 526 (2015). doi:10.1038/nrmicro3541 Author: Denise Waldron This study uses a new tool, VirSorter, to search for virus genomes within all publicly available bacterial and archaeal genomic datasets and finds 264 new candidate viral genera.

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Vaccines: A protective Ebola vaccine (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-08-15

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 526 (2015). doi:10.1038/nrmicro3540 Author: Cláudio Nunes-Alves The Ebola epidemic in West Africa is still ongoing, but a new study reports that a ring vaccination strategy — in which contacts, and contacts of contacts, of an infected patient are vaccinated — using rVSV-ZEBOV was successful in preventing infection. The vaccine consists of

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Fungal ecology: A surprising find of far-flung fungi (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 600 (2015). doi:10.1038/nrmicro3561 Author: Naomi Attar 80% of land plants have symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi, which are named after the 'arbuscule' structures that are used for nutrient exchange. Despite their ecological importance, surveys of these fungi have been limited, as these taxa are mostly unculturable, but have pointed to an endemic

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Bacterial toxins: Pick 'n' mix toxins (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 600 (2015). doi:10.1038/nrmicro3554 Author: Naomi Attar A new study shows that variability of contact-dependent growth inhibition toxins is linked to a large repertoire of cell-entry pathways.

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Viral evolution: The history of Lassa virus (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 600 (2015). doi:10.1038/nrmicro3550 Author: Naomi Attar A new study delineates the origin and transmission pattern of Lassa virus, an important human pathogen.

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Viral infection: Stemming influenza viruses (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 599 (2015). doi:10.1038/nrmicro3553 Author: Cláudio Nunes-Alves These two studies report novel vaccination strategies to elicit antibodies that target the conserved stem region of haemagglutinin in order to generate protective immune responses against multiple influenza subtypes.

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Bacterial secretion: MIXing up T6SS effectors (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 600 (2015). doi:10.1038/nrmicro3560 Author: Naomi Attar Type VI secretion systems (T6SSs) and their effectors can function in both pathogenesis and interbacterial competition. Vibrio alginolyticus, a marine pathogen that can infect humans, encodes two T6SSs, but only a single antibacterial effector, Va02265, had been described for these systems. Of note, Va02265

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Bacterial pathogenesis: Ironing out Legionella infection (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 601 (2015). doi:10.1038/nrmicro3559 Author: Cláudio Nunes-Alves Following infection, Legionella pneumophila is able to hijack several cellular processes in order to establish the Legionella-containing vacuole (LCV), which enables bacterial replication within the host cell. However, how the bacteria acquire essential nutrients, such as iron, within the LCV is unknown. Isaac

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Bacterial evolution: To divide and conquer (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 602 (2015). doi:10.1038/nrmicro3556 Author: Denise Waldron A new study reports that the genetic diversification of Pseudomonas aeruginosa within the lungs of patients with cystic fibrosis (CF) is driven by regional isolation.

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Viral infection: Growing our knowledge of HCV replication (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 601 (2015). doi:10.1038/nrmicro3558 Author: Cláudio Nunes-Alves The study of hepatitis C virus (HCV) has been hampered by the inability to grow viral clinical isolates in cell culture. Saeed et al. postulated that this was due to the lack of essential factors in cell lines, and transduced human hepatoma cells with

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Techniques & applications: Lighting up intestinal anaerobes (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 600 (2015). doi:10.1038/nrmicro3562 Author: Naomi Attar Intestinal commensals inhabit an anaerobic environment where conventional fluorescent protein tags are not functional. Now, Kasper and colleagues use bacterial biosynthesis and click chemistry to fluorescently label the polysaccharides that are shed from the capsules of commensal bacteria. As a first step, cultures are grown

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How apicomplexans became free-riders (2015)

Christian K. Owusu; Hayley M. Bennett

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 603 (2015). doi:10.1038/nrmicro3551 Authors: Christian K. Owusu & Hayley M. Bennett This month's Genome Watch explores apicomplexan adaptation to parasitism.

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Outer-membrane vesicles from Gram-negative bacteria: biogenesis and functions (2015)

Carmen Schwechheimer; Meta J. Kuehn

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 605 (2015). doi:10.1038/nrmicro3525 Authors: Carmen Schwechheimer & Meta J. Kuehn Outer-membrane vesicles (OMVs) are spherical buds of the outer membrane filled with periplasmic content and are commonly produced by Gram-negative bacteria. The production of OMVs allows bacteria to interact with their environment, and OMVs have been found to mediate diverse functions, including promoting pathogenesis, enabling

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Microbiome: Interkingdom suppression of virulence (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 601 (2015). doi:10.1038/nrmicro3557 Author: Cláudio Nunes-Alves To understand the bacterial–fungal interactions between Pseudomonas aeruginosa and Candida albicans, Lopez-Medina et al. used a mouse model of microbial gastrointestinal colonization and dissemination. They found that co-colonization with C. albicans inhibited the virulence of P. aeruginosa, although the fungus

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Cooperative development of antimicrobials: looking back to look ahead (2015)

Carl Nathan

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 651 (2015). doi:10.1038/nrmicro3523 Author: Carl Nathan As foundations and governments mobilize to tackle antimicrobial resistance (AMR), several experiments in academic–industrial collaboration have emerged. Here, I examine two historical precedents, the Penicillin Project and the Malaria Project of the Second World War, and two contemporary examples, the Tuberculosis Drug Accelerator programme and

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Parasite biology: Malaria alters B cell lymphomagenesis (2015)

Elisabeth Kugelberg

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 602 (2015). doi:10.1038/nrmicro3555 Author: Elisabeth Kugelberg Malaria infection modifies endemic Burkitt lymphomas by inducing a prolonged expansion of germinal centre B cell numbers.

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Structure and function of Fic proteins (2015)

Craig R. Roy; Jacqueline Cherfils

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 631 (2015). doi:10.1038/nrmicro3520 Authors: Craig R. Roy & Jacqueline Cherfils Fic proteins are a family of proteins characterized by the presence of a conserved FIC domain that is involved in the modification of protein substrates by the addition of phosphate-containing compounds, including AMP and other nucleoside monophosphates, phosphocholine and phosphate. Fic proteins are widespread in

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A new perspective on lysogeny: prophages as active regulatory switches of bacteria (2015)

Ron Feiner; Tal Argov; Lev Rabinovich; Nadejda Sigal; Ilya Borovok; Anat A. Herskovits

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 641 (2015). doi:10.1038/nrmicro3527 Authors: Ron Feiner, Tal Argov, Lev Rabinovich, Nadejda Sigal, Ilya Borovok & Anat A. Herskovits Unlike lytic phages, temperate phages that enter lysogeny maintain a long-term association with their bacterial host. In this context, mutually beneficial interactions can evolve that support efficient reproduction of both phages and bacteria. Temperate phages are integrated into the bacterial chromosome as large DNA insertions

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Through the wall: extracellular vesicles in Gram-positive bacteria, mycobacteria and fungi (2015)

Lisa Brown; Julie M. Wolf; Rafael Prados-Rosales; Arturo Casadevall

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Publikationsdatum: 2015-09-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 620 (2015). doi:10.1038/nrmicro3480 Authors: Lisa Brown, Julie M. Wolf, Rafael Prados-Rosales & Arturo Casadevall Extracellular vesicles (EVs) are produced by all domains of life. In Gram-negative bacteria, EVs are produced by the pinching off of the outer membrane; however, how EVs escape the thick cell walls of Gram-positive bacteria, mycobacteria and fungi is still unknown. Nonetheless, EVs have been

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Bacterial pathogenesis: Copycat Burkholderia make a move (2015)

Andrea Du Toit

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 330 (2015). doi:10.1038/nrmicro3488 Author: Andrea Du Toit Mechanistic differences in the way different Burkholderia species manipulate host actin-polymerizing proteins to drive actin-based motility influence the outcome of infection.

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Host response: Sifting out virulent bacteria (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 330 (2015). doi:10.1038/nrmicro3499 Author: Naomi Attar A new study shows that the selective elimination of virulent Citrobacter rodentium is achieved by the specific targeting of LEE virulence factors by IgG.

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Viral infection: New options to fight Ebola (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 327 (2015). doi:10.1038/nrmicro3492 Author: Cláudio Nunes-Alves Several recent studies are expanding our options to prevent and treat Ebolavirus, including new vaccine candidates and short interfering RNAs that target the viral genome.

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Archaeal evolution: Bridging the gap (2015)

Naomi Attar

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 328 (2015). doi:10.1038/nrmicro3501 Author: Naomi Attar Eukaryotes are thought to have arisen via the engulfment of a proto-mitochondrion by an archaeon, suggesting that many features of the eukaryotic cell were present in the archaeal ancestor. However, known archaea lack certain eukaryotic hallmarks of cellular complexity, such as an endomembrane system and

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Bacterial physiology: Alternative ways to flip out (2015)

Claudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 328 (2015). doi:10.1038/nrmicro3500 Author: Claudio Nunes-Alves Previous work in Escherichia coli has provided evidence that MurJ is the flippase responsible for transport of the cell wall precursor lipid II across the cytoplasmic membrane. However, deletion of MurJ paralogues in Bacillus subtilis does not affect cell viability, which suggests that

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Microbial ecology: Sharing is caring (2015)

Claudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 328 (2015). doi:10.1038/nrmicro3502 Author: Claudio Nunes-Alves Zelezniak et al. developed a modelling approach termed 'species metabolic interaction analysis' (SMETANA) that maps all possible interspecies metabolic exchanges according to the genomic potential encoded by all species present in microbial communities. They analysed more than 800 communities in soil, water and human

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Parasite physiology: The missing link in artemisinin resistance (2015)

Christina Tobin Kåhrström

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 328 (2015). doi:10.1038/nrmicro3487 Author: Christina Tobin Kåhrström A new study reveals an unexpected mechanistic link between the target of the antimalarial drug artemisinin and the associated resistance mutations in Plasmodium falciparum.

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Bacterial genetics: A CRISPR sense of self (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 328 (2015). doi:10.1038/nrmicro3498 Author: Naomi Attar A new study proposes a model to explain why spacer acquisition by the CRISPR–Cas system is biased towards foreign DNA.

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Bacterial genetics: An ancient mycobacterial proofreader (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 329 (2015). doi:10.1038/nrmicro3493 Author: Andrea Du Toit In Escherichia coli, DNA proofreading is performed by the dnaQ-encoded 3′–5′ exonuclease; however, a new study now shows that the dnaQ homologue in Mycobacterium tuberculosis does not have a role in replication fidelity. Instead, the polymerase and histidinol phosphatase (PHP) domain

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Bacterial physiology: Migration is a group effort (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 329 (2015). doi:10.1038/nrmicro3494 Author: Andrea Du Toit To survive in the environment, the soil-dwelling bacterium Bacillus subtilis must overcome several challenges, including flagellum-independent migration over solid surfaces. Kolter and colleagues show that B. subtilis forms multicellular structures that facilitate collective cell migration. The authors found that during colony expansion, cells

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Techniques & applications: Expanding the toolbox to study Chlamydia (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 329 (2015). doi:10.1038/nrmicro3495 Author: Andrea Du Toit Routine genetic manipulation approaches are currently limited in Chlamydia. Here, Kokes et al. generated a collection of chemically mutagenized Chlamydia trachomatis strains and identified the induced single-nucleotide variants (SNVs) using whole-genome sequencing. The authors describe the use of this library in a

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Secretion systems in Gram-negative bacteria: structural and mechanistic insights (2015)

Tiago R. D. Costa; Catarina Felisberto-Rodrigues; Amit Meir; Marie S. Prevost; Adam Redzej; Martina Trokter; Gabriel Waksman

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 343 (2015). doi:10.1038/nrmicro3456 Authors: Tiago R. D. Costa, Catarina Felisberto-Rodrigues, Amit Meir, Marie S. Prevost, Adam Redzej, Martina Trokter & Gabriel Waksman Bacteria have evolved a remarkable array of sophisticated nanomachines to export various virulence factors across the bacterial cell envelope. In recent years, considerable progress has been made towards elucidating the structural and molecular mechanisms of the six secretion systems (types I–VI) of Gram-negative bacteria, the

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Sequencing and beyond: integrating molecular 'omics' for microbial community profiling (2015)

Eric A. Franzosa; Tiffany Hsu; Alexandra Sirota-Madi; Afrah Shafquat; Galeb Abu-Ali; Xochitl C. Morgan; Curtis Huttenhower

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 360 (2015). doi:10.1038/nrmicro3451 Authors: Eric A. Franzosa, Tiffany Hsu, Alexandra Sirota-Madi, Afrah Shafquat, Galeb Abu-Ali, Xochitl C. Morgan & Curtis Huttenhower High-throughput DNA sequencing has proven invaluable for investigating diverse environmental and host-associated microbial communities. In this Review, we discuss emerging strategies for microbial community analysis that complement and expand traditional metagenomic profiling. These include novel DNA sequencing strategies for identifying strain-level microbial variation and community

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Using dispersants after oil spills: impacts on the composition and activity of microbial communities (2015)

Sara Kleindienst; John H. Paul; Samantha B. Joye

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 388 (2015). doi:10.1038/nrmicro3452 Authors: Sara Kleindienst, John H. Paul & Samantha B. Joye Dispersants are globally and routinely applied as an emergency response to oil spills in marine ecosystems with the goal of chemically enhancing the dissolution of oil into water, which is assumed to stimulate microbially mediated oil biodegradation. However, little is known about how dispersants affect

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The interplay between nucleoid organization and transcription in archaeal genomes (2015)

Eveline Peeters; Rosalie P. C. Driessen; Finn Werner; Remus T. Dame

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 333 (2015). doi:10.1038/nrmicro3467 Authors: Eveline Peeters, Rosalie P. C. Driessen, Finn Werner & Remus T. Dame The archaeal genome is organized by either eukaryotic-like histone proteins or bacterial-like nucleoid-associated proteins. Recent studies have revealed novel insights into chromatin dynamics and their effect on gene expression in archaeal model organisms. In this Progress article, we discuss the interplay between chromatin proteins, such

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Antibiotic resistance genes in the environment: prioritizing risks (2015)

Johan Bengtsson-Palme; D. G. Joakim Larsson

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 396 (2015). doi:10.1038/nrmicro3399-c1 Authors: Johan Bengtsson-Palme & D. G. Joakim Larsson In a recent Opinion article (What is a resistance gene? Ranking risks in resistomes. Nature Rev. Microbiol.13, 116–123 (2015)), Martínez et al. outline the obstacles associated with determining the risks presented by antibiotic resistance genes in environmental microbial communities in

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Prioritizing risks of antibiotic resistance genes in all metagenomes (2015)

José L. Martínez; Teresa M. Coque; Fernando Baquero

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 396 (2015). doi:10.1038/nrmicro3399-c2 Authors: José L. Martínez, Teresa M. Coque & Fernando Baquero We have read with interest the Correspondence on our Opinion article (What is a resistance gene? Ranking risks in resistomes. Nature Rev. Microbiol.13, 116–123 (2015)) by Bengtsson-Palme and Larsson (Antibiotic resistance genes in the environment: prioritizing risks Nature Rev. Microbiol.http://dx.doi.org/10.1038/nrmicro3399-c1

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An evolutionary link between capsular biogenesis and surface motility in bacteria (2015)

Rym Agrebi; Morgane Wartel; Céline Brochier-Armanet; Tâm Mignot

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 396 (2015). doi:10.1038/nrmicro3489 Author: Rym Agrebi, Morgane Wartel, Céline Brochier-Armanet & Tâm Mignot Nature Reviews Microbiology13, 318–326 (2015)In the above article, the credit lines for Figure 2a,d and Figure 4 were incorrect and have been corrected online. We apologize to the readers for any misunderstanding caused.

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There's no place like home (2015)

Alison E. Mather

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 331 (2015). doi:10.1038/nrmicro3497 Author: Alison E. Mather This month's Genome Watch looks at how the combination of household contact sampling and whole-genome sequencing has provided insight into the sources and transmission patterns of methicillin-resistant Staphylococcus aureus clone USA300.

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Advances in molecular genetic systems in malaria (2015)

Tania F. de Koning-Ward; Paul R. Gilson; Brendan S. Crabb

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Publikationsdatum: 2015-05-16

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 373 (2015). doi:10.1038/nrmicro3450 Authors: Tania F. de Koning-Ward, Paul R. Gilson & Brendan S. Crabb Robust tools for analysing gene function in Plasmodium parasites, which are the causative agents of malaria, are being developed at an accelerating rate. Two decades after genetic technologies for use in Plasmodium spp. were first described, a range of genetic tools are now

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Parasite physiology: Propelling artemisinin resistance (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-01-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 66 (2015). doi:10.1038/nrmicro3423 Author: Cláudio Nunes-Alves Two new studies elucidate how K13-propeller mutations in Plasmodium falciparum confer resistance to artemisinin.

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Bacterial genetics: Metalloregulatory riboswitches (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 249 (2015). doi:10.1038/nrmicro3478 Author: Andrea Du Toit Three new studies show that bacteria use selective transition metal-sensing riboswitches to balance the intracellular levels of potentially toxic metal ions.

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Microbiome: Taking advantage of quorum sensing (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 252 (2015). doi:10.1038/nrmicro3477 Author: Cláudio Nunes-Alves A new study shows how altering the levels of quorum sensing signals can modulate the composition of the antibiotic-treated gut microbiota.

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Bugs full of viruses (2015)

Astrid Gall

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 253 (2015). doi:10.1038/nrmicro3479 Author: Astrid Gall This month's Genome Watch highlights how high-throughput sequencing has provided new insights into the diversity, evolution and genome organization of arthropod viruses.

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Structural biology: Where to make the cut (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 251 (2015). doi:10.1038/nrmicro3483 Author: Andrea Du Toit The CRISPR–Cas system is an archaeal and bacterial adaptive immune system that provides sequence-specific defence against foreign nucleic acids. Whereas type I and type II systems recognize and cleave double-stranded DNA, the type III complex (known as Cmr) targets single-stranded RNA (ssRNA), and comprises six

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Microbiome: A gut instinct for recovery (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 398 (2015). doi:10.1038/nrmicro3513 Author: Naomi Attar Childhood diarrhoea is associated with infection of the gut by pathogens such as Vibrio cholerae and enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), but how the gut microbiota recovers post infection is incompletely understood. David et al. analysed the microbiome of rectal samples from 13

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Bacterial physiology: Linking cell differentiation and growth (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 398 (2015). doi:10.1038/nrmicro3505 Author: Cláudio Nunes-Alves This study identifies cyclic diguanylate (c-di-GMP) as a crucial regulator of both cell morphogenesis and chromosome replication in Caulobacter crescentus.

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Marine microbiology: Deep sequencing of the global oceans (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 397 (2015). doi:10.1038/nrmicro3509 Author: Cláudio Nunes-Alves Five studies report the initial findings of the international Tara Oceans consortium, which describe the microbial composition of the global oceans and the ecological factors that govern community structure in these ecosystems.

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Parasite biology: Punching through vacuolar membranes (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 398 (2015). doi:10.1038/nrmicro3511 Author: Naomi Attar Some apicomplexan parasites, including Toxoplasma gondii and Plasmodium falciparum, replicate within parasitophorous vacuoles (PVs) after invading the host cell. Amino acids and other metabolites that are essential for parasite growth are delivered to the PV by transport through its membrane, which is made

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Viral evolution: Global patterns of influenza circulation (2015)

Christina Tobin Kåhrström

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 399 (2015). doi:10.1038/nrmicro3518 Author: Christina Tobin Kåhrström Understanding the factors that influence the circulation of seasonal influenza viruses is a major public health challenge. By analysing 9,604 viral haemagglutinin (HA) sequences from the 2 influenza A subtypes H1N1 and H3N2, and the 2 influenza B viruses Yamagata and Victoria (all of which

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Bacterial pathogenesis: Message in a bottle (2015)

Olive Leavy

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 400 (2015). doi:10.1038/nrmicro3510 Author: Olive Leavy Outer membrane vesicles access intestinal macrophages in a sulfatase-dependent manner where they induce inflammation in susceptible hosts.

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Microbial ecology of Antarctic aquatic systems (2015)

Ricardo Cavicchioli

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 691 (2015). doi:10.1038/nrmicro3549 Author: Ricardo Cavicchioli The Earth's biosphere is dominated by cold environments, and the cold biosphere is dominated by microorganisms. Microorganisms in cold Southern Ocean waters are recognized for having crucial roles in global biogeochemical cycles, including carbon sequestration, whereas microorganisms in other Antarctic aquatic biomes are not as

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Genetic code flexibility in microorganisms: novel mechanisms and impact on physiology (2015)

Jiqiang Ling; Patrick O'Donoghue; Dieter Söll

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 707 (2015). doi:10.1038/nrmicro3568 Authors: Jiqiang Ling, Patrick O'Donoghue & Dieter Söll The genetic code, initially thought to be universal and immutable, is now known to contain many variations, including biased codon usage, codon reassignment, ambiguous decoding and recoding. As a result of recent advances in the areas of genome sequencing, biochemistry, bioinformatics and structural biology, our

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Microbiome: Early life dysbiosis increases asthma risk (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 660 (2015). doi:10.1038/nrmicro3574 Author: Naomi Attar Mouse models have pointed to a role for dysbiosis of the gut microbiota during early life in the aetiology of asthma. Arrieta et al. surveyed 319 children from a 3-year longitudinal study and found that a similar phenomenon occurs in humans. 16S rRNA profiling

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Techniques & applications: Cpf1 makes for a CRISPR cut (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 660 (2015). doi:10.1038/nrmicro3576 Author: Naomi Attar The CRISPR−Cas protein Cas9 — together with its companion CRISPR RNA (crRNA) and trans-activating crRNA (tracrRNA) — has been developed as a tool for genome engineering, owing to its readily programmable ability to cleave any desired DNA sequence. Now, Zetsche et al. establish

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Viral pathogenesis: HIV-1 Nef targets restriction factors (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 660 (2015). doi:10.1038/nrmicro3573 Author: Cláudio Nunes-Alves Two new studies show that the HIV-1 accessory protein Nef enhances virion infectivity by targeting the restriction factors SERINC3 and SERINC5.

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Filovirus pathogenesis and immune evasion: insights from Ebola virus and Marburg virus (2015)

Ilhem Messaoudi; Gaya K. Amarasinghe; Christopher F. Basler

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 663 (2015). doi:10.1038/nrmicro3524 Authors: Ilhem Messaoudi, Gaya K. Amarasinghe & Christopher F. Basler Ebola viruses and Marburg viruses, members of the filovirus family, are zoonotic pathogens that cause severe disease in people, as highlighted by the latest Ebola virus epidemic in West Africa. Filovirus disease is characterized by uncontrolled virus replication and the activation of host responses that

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Microbiome: In transit (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 659 (2015). doi:10.1038/nrmicro3572 Author: Denise Waldron Dey et al. show that gut motility is affected by different combinations of microbiota and diet, and that turmeric affects intestinal transit, through a mechanism that involves bile acid secretion and Ret signalling.

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Viral evolution: Waking a sleeping giant (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 660 (2015). doi:10.1038/nrmicro3575 Author: Naomi Attar The discovery of giant viruses has recast ideas on what constitutes a virus. Although diverse in many respects, all giant viruses have an extremely large virion (up to 1.5 μm) and genome (up to 2.8 Mb). Legendre et al. recently described a giant virus,

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Microbial ecology: Wired communities (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 661 (2015). doi:10.1038/nrmicro3577 Author: Denise Waldron Microbial consortia of sulfate-reducing bacteria metabolically coupled to methane-oxidizing archaea have important roles in nature. McGlynn et al. assessed the influence of interspecies spatial arrangements on biosynthetic activity in such consortia from deep-sea sediment incubations, using FISH, NanoSIMS and isotype probing. Interestingly, the biosynthetic

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Viral infection: Phages' box of tricks for CRISPR (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 660 (2015). doi:10.1038/nrmicro3571 Author: Naomi Attar A new study characterizes three anti-CRISPR proteins to provide the first mechanistic insights into phage evasion of CRISPR–Cas immunity.

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Microbial ecology of the cryosphere: sea ice and glacial habitats (2015)

Antje Boetius; Alexandre M. Anesio; Jody W. Deming; Jill A. Mikucki; Josephine Z. Rapp

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 677 (2015). doi:10.1038/nrmicro3522 Authors: Antje Boetius, Alexandre M. Anesio, Jody W. Deming, Jill A. Mikucki & Josephine Z. Rapp The Earth's cryosphere comprises those regions that are cold enough for water to turn into ice. Recent findings show that the icy realms of polar oceans, glaciers and ice sheets are inhabited by microorganisms of all three domains of life, and that temperatures below 0

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Antimicrobials: Triple therapy for MRSA (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 661 (2015). doi:10.1038/nrmicro3579 Author: Denise Waldron Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is becoming increasingly resistant to the most recently developed antibiotics. Now, Gonzales et al. identify a new potential therapy against multidrug-resistant MRSA comprising a combination of the clinically approved β-lactams meropenem, piperacillin and tazobactam (ME/PI/TZ). This triple combination acts

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An updated evolutionary classification of CRISPR–Cas systems (2015)

Kira S. Makarova; Yuri I. Wolf; Omer S. Alkhnbashi; Fabrizio Costa; Shiraz A. Shah; Sita J. Saunders; Rodolphe Barrangou; Stan J. J. Brouns; Emmanuelle Charpentier; Daniel H. Haft; Philippe Horvath; Sylvain Moineau; Francisco J. M. Mojica; Rebecca M. Terns; Michael P. Terns; Malcolm F. White; Alexander F. Yakunin; Roger A. Garrett; John van der Oost; Rolf Backofen; Eugene V. Koonin

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 722 (2015). doi:10.1038/nrmicro3569 Authors: Kira S. Makarova, Yuri I. Wolf, Omer S. Alkhnbashi, Fabrizio Costa, Shiraz A. Shah, Sita J. Saunders, Rodolphe Barrangou, Stan J. J. Brouns, Emmanuelle Charpentier, Daniel H. Haft, Philippe Horvath, Sylvain Moineau, Francisco J. M. Mojica, Rebecca M. Terns, Michael P. Terns, Malcolm F. White, Alexander F. Yakunin, Roger A. Garrett, John van der Oost, Rolf Backofen & Eugene V. Koonin The evolution of CRISPR–cas loci, which encode adaptive immune systems in archaea and bacteria, involves rapid changes, in particular numerous rearrangements of the locus architecture and horizontal transfer of complete loci or individual modules. These dynamics complicate straightforward phylogenetic classification, but here we

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Viral infection: An endogenous retrovirus contributes to ALS (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 661 (2015). doi:10.1038/nrmicro3578 Author: Denise Waldron A new study by Li et al. implicates the normally latent human endogenous retrovirus HERV-K in the pathogenesis of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Using RT-PCR and immunostaining, the authors detected the expression of HERV-K in post-mortem brain tissue samples from patients with sporadic ALS.

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True Blood: dengue virus evolution (2015)

Rachael Wash; Carmen Diaz Soria

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Publikationsdatum: 2015-10-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 662 (2015). doi:10.1038/nrmicro3570 Authors: Rachael Wash & Carmen Diaz Soria This month's Genome Watch highlights insights into different selection pressures in dengue virus evolution.

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Bacterial evolution: Cutting out the carBs feeds a bistable switch (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 250 (2015). doi:10.1038/nrmicro3476 Author: Naomi Attar A metabolic bifurcation point functions as a bistable switch that results in phenotypic switching in a Pseudomonas fluorescens population.

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Archaeal genetics: Increasing diversity (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 251 (2015). doi:10.1038/nrmicro3482 Author: Andrea Du Toit Diversity-generating retroelements (DGRs) facilitate the rapid diversification of DNA sequences through a process involving reverse transcription and retrohoming, which generates multiple variants of a target gene. To date, DGRs have only been identified in bacteria and bacteriophages, but Paul et al. now report the

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Bacterial genetics: Pneumococci switch it up (2015)

Andrea Du Toit

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 251 (2015). doi:10.1038/nrmicro3484 Author: Andrea Du Toit Streptococcus pneumoniae isolates express one of more than 90 polysaccharide capsule variants (known as serotypes, which can be further classified into serogroups) that are the target of current vaccines. However, bacteria can change their serotype through recombination to evade vaccine-induced immunity. Croucher et al

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Parasite biology: Dual-core centrosomes power cell division (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 252 (2015). doi:10.1038/nrmicro3470 Author: Naomi Attar A new study shows that that an unusual bipartite centrosome structure coordinates replication and cytokinesis in apicomplexan parasites.

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Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options (2015)

Ana L. Flores-Mireles; Jennifer N. Walker; Michael Caparon; Scott J. Hultgren

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 269 (2015). doi:10.1038/nrmicro3432 Authors: Ana L. Flores-Mireles, Jennifer N. Walker, Michael Caparon & Scott J. Hultgren Urinary tract infections (UTIs) are a severe public health problem and are caused by a range of pathogens, but most commonly by Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Enterococcus faecalis and Staphylococcus saprophyticus. High recurrence rates and increasing antimicrobial resistance

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Recent functional insights into the role of (p)ppGpp in bacterial physiology (2015)

Vasili Hauryliuk; Gemma C. Atkinson; Katsuhiko S. Murakami; Tanel Tenson; Kenn Gerdes

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 298 (2015). doi:10.1038/nrmicro3448 Authors: Vasili Hauryliuk, Gemma C. Atkinson, Katsuhiko S. Murakami, Tanel Tenson & Kenn Gerdes The alarmones guanosine tetraphosphate and guanosine pentaphosphate (collectively referred to as (p)ppGpp) are involved in regulating growth and several different stress responses in bacteria. In recent years, substantial progress has been made in our understanding of the molecular mechanisms of (p)ppGpp metabolism and (p)ppGpp-mediated regulation.

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An evolutionary link between capsular biogenesis and surface motility in bacteria (2015)

Rym Agrebi; Morgane Wartel; Céline Brochier-Armanet; Tâm Mignot

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 318 (2015). doi:10.1038/nrmicro3431 Authors: Rym Agrebi, Morgane Wartel, Céline Brochier-Armanet & Tâm Mignot Studying the evolution of macromolecular assemblies is important to improve our understanding of how complex cellular structures evolved, and to identify the functional building blocks that are involved. Recent studies suggest that the macromolecular complexes that are involved in two distinct processes in Myxococcus xanthus

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Viral pathogenesis: HCV RNA acts as a miR-122 sponge (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 250 (2015). doi:10.1038/nrmicro3473 Author: Cláudio Nunes-Alves The liver-specific microRNA-122 (miR-122) represses translation by associating with Argonaute and binding to cellular mRNAs (ceRNAs). Notably, replication of hepatitis C virus (HCV) requires binding of miR-122 to viral genomic RNA. Now, Luna et al. show that extensive binding of miR-122 to the viral

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Parasite physiology: RIFINs promote rosette formation during malaria (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 250 (2015). doi:10.1038/nrmicro3472 Author: Cláudio Nunes-Alves Rosetting — the formation of clusters in which uninfected red blood cells (RBCs) aggregate around a central Plasmodium falciparum-infected RBC (iRBC) — promotes RBC sequestration in the microvasculature and is associated with severe malaria. The P. falciparum erythrocyte membrane protein 1 (PfEMP1) mediates

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Viral infection: CRISPR–Cas9 defence against HIV-1 (2015)

Cláudio Nunes-Alves

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 250 (2015). doi:10.1038/nrmicro3474 Author: Cláudio Nunes-Alves The CRISPR–Cas system is a defence mechanism that uses guide RNAs (gRNAs) and Cas nucleases to bind to complementary sequences in invading DNA and degrade them. Liao et al. transfected human cell lines with Cas9 and with gRNAs targeting the long terminal repeats (LTRs)

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Antimicrobials: Targeting of C. difficile made easy (2015)

Christina Tobin Kåhrström

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 250 (2015). doi:10.1038/nrmicro3481 Author: Christina Tobin Kåhrström A new study describes the development of a modified bacteriocin that specifically targets and kills the major nosocomial pathogen Clostridium difficile.

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Living in the matrix: assembly and control of Vibrio cholerae biofilms (2015)

Jennifer K. Teschler; David Zamorano-Sánchez; Andrew S. Utada; Christopher J. A. Warner; Gerard C. L. Wong; Roger G. Linington; Fitnat H. Yildiz

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 255 (2015). doi:10.1038/nrmicro3433 Authors: Jennifer K. Teschler, David Zamorano-Sánchez, Andrew S. Utada, Christopher J. A. Warner, Gerard C. L. Wong, Roger G. Linington & Fitnat H. Yildiz Nearly all bacteria form biofilms as a strategy for survival and persistence. Biofilms are associated with biotic and abiotic surfaces and are composed of aggregates of cells that are encased by a self-produced or acquired extracellular matrix. Vibrio cholerae has been studied as a

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Mechanisms of ribosome rescue in bacteria (2015)

Kenneth C. Keiler

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In: Nature Reviews Microbiology

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 285 (2015). doi:10.1038/nrmicro3438 Author: Kenneth C. Keiler Ribosomes that stall during translation need to be rescued to ensure that the protein synthesis capacity of the cell is maintained. Stalling arises when ribosomes become trapped at the 3′ end of an mRNA, which occurs when a codon is unavailable, as this leads to

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Thema: Biologie , Medizin

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Tackling antibiotic resistance: the environmental framework (2015)

Thomas U. Berendonk; Célia M. Manaia; Christophe Merlin; Despo Fatta-Kassinos; Eddie Cytryn; Fiona Walsh; Helmut Bürgmann; Henning Sørum; Madelaine Norström; Marie-Noëlle Pons; Norbert Kreuzinger; Pentti Huovinen; Stefania Stefani; Thomas Schwartz; Veljo Kisand; Fernando Baquero; José Luis Martinez

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Publikationsdatum: 2015-04-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 310 (2015). doi:10.1038/nrmicro3439 Authors: Thomas U. Berendonk, Célia M. Manaia, Christophe Merlin, Despo Fatta-Kassinos, Eddie Cytryn, Fiona Walsh, Helmut Bürgmann, Henning Sørum, Madelaine Norström, Marie-Noëlle Pons, Norbert Kreuzinger, Pentti Huovinen, Stefania Stefani, Thomas Schwartz, Veljo Kisand, Fernando Baquero & José Luis Martinez Antibiotic resistance is a threat to human and animal health worldwide, and key measures are required to reduce the risks posed by antibiotic resistance genes that occur in the environment. These measures include the identification of critical points of control, the development of reliable surveillance

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Broad-spectrum antivirals against viral fusion (2015)

Frederic Vigant; Nuno C. Santos; Benhur Lee

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 426 (2015). doi:10.1038/nrmicro3475 Authors: Frederic Vigant, Nuno C. Santos & Benhur Lee Effective antivirals have been developed against specific viruses, such as HIV, Hepatitis C virus and influenza virus. This 'one bug–one drug' approach to antiviral drug development can be successful, but it may be inadequate for responding to an increasing diversity of viruses that cause significant

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HIV-1 and interferons: who's interfering with whom? (2015)

Tomas Doyle; Caroline Goujon; Michael H. Malim

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 403 (2015). doi:10.1038/nrmicro3449 Authors: Tomas Doyle, Caroline Goujon & Michael H. Malim The ability of interferons (IFNs) to inhibit HIV-1 replication in cell culture models has long been recognized, and the therapeutic administration of IFNα to HIV-1-infected patients who are not receiving antiretroviral therapy produces a clear but transient decrease in plasma viral load. Conversely, studies of

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Bottlenecks in HIV-1 transmission: insights from the study of founder viruses (2015)

Sarah B. Joseph; Ronald Swanstrom; Angela D. M. Kashuba; Myron S. Cohen

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 414 (2015). doi:10.1038/nrmicro3471 Authors: Sarah B. Joseph, Ronald Swanstrom, Angela D. M. Kashuba & Myron S. Cohen HIV-1 infection typically results from the transmission of a single viral variant, the transmitted/founder (T/F) virus. Studies of these HIV-1 variants provide critical information about the transmission bottlenecks and the selective pressures acting on the virus in the transmission fluid and in the recipient tissues.

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Dispersing misconceptions and identifying opportunities for the use of 'omics' in soil microbial ecology (2015)

James I. Prosser

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 439 (2015). doi:10.1038/nrmicro3468 Author: James I. Prosser Technological advances are enabling the sequencing of environmental DNA and RNA at increasing depth and with decreasing costs. Metagenomic and transcriptomic analysis of soil microbial communities and the assembly of 'population genomes' from soil DNA are therefore now feasible. Although the value of such 'omic'

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Antimicrobials: Fine-tuned antifungals (2015)

Naomi Attar

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Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 398 (2015). doi:10.1038/nrmicro3512 Author: Naomi Attar Resistance to the antifungal drug Amphotericin B (AmB) has not evolved but it is extremely toxic to humans. AmB extracts the fungal sterol ergosterol from fungal membranes and its toxicity probably results from cross-reactivity with human cholesterol. Davis et al. designed a new class

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Structural biology: Copying the bunyavirus genome (2015)

Naomi Attar

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 398 (2015). doi:10.1038/nrmicro3507 Author: Naomi Attar The structure of the La Crosse orthobunyavirus L protein suggests a new model for the replication of segmented negative-strand viral genomes.

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Microbiome: Gut bacteria feed a healthy brain (2015)

Denise Waldron

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 399 (2015). doi:10.1038/nrmicro3516 Author: Denise Waldron The tissue macrophages of the central nervous system (CNS), known as microglia, are essential for normal brain development and maintenance of the innate immune response of the CNS; however, the factors that control their maturation and activation have been unclear. Now, Erny et al.

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Bacterial physiology: Type IV pili function as mechanosensors (2015)

Christina Tobin Kåhrström

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Publikationsdatum: 2015-06-17

Beschreibung: Nature Reviews Microbiology 13, 399 (2015). doi:10.1038/nrmicro3517 Author: Christina Tobin Kåhrström Bacteria use a range of sensory systems to mount appropriate responses to their environment. A new study now shows that the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa uses its type IV pili (which are composed of pilin subunits and are mainly used for surface motility) to

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