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Anomalous critical fields in quantum critical superconductors (2014)

C. Putzke; P. Walmsley; J. D. Fletcher; L. Malone; D. Vignolles; C. Proust; S. Badoux; P. See; H. E. Beere; D. A. Ritchie; S. Kasahara; Y. Mizukami; T. Shibauchi; Y. Matsuda; A. Carrington

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-07

Beschreibung: Article Superconductivity in the iron pnictides is believed to be related to quantum critical fluctuations. Putzke et al. observe unexpected anomalies in the critical fields of BaFe 2 (As 1−x P x ) 2 that emerge close to its magnetic critical point, which they argue is a generic feature of quantum critical superconductivity. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6679 Authors: C. Putzke, P. Walmsley, J. D. Fletcher, L. Malone, D. Vignolles, C. Proust, S. Badoux, P. See, H. E. Beere, D. A. Ritchie, S. Kasahara, Y. Mizukami, T. Shibauchi, Y. Matsuda, A. Carrington

Digitale ISSN: 2041-1723

Thema: Biologie , Chemie und Pharmazie , Allgemeine Naturwissenschaft , Physik

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microTSS: accurate microRNA transcription start site identification reveals a significant number of divergent pri-miRNAs (2014)

Georgios Georgakilas; Ioannis S. Vlachos; Maria D. Paraskevopoulou; Peter Yang; Yuhong Zhang; Aris N. Economides; Artemis G. Hatzigeorgiou

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article microRNAs are short non-coding RNAs that post-transcriptionally regulate gene expression for which the identification of promoter and primary transcripts (pri-miRNAs) has been difficult. Here the authors describe microTSS, an algorithm that supports the precise identification of intergenic pri-miRNA transcription start sites. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6700 Authors: Georgios Georgakilas, Ioannis S. Vlachos, Maria D. Paraskevopoulou, Peter Yang, Yuhong Zhang, Aris N. Economides, Artemis G. Hatzigeorgiou

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Transcriptome analysis reveals dysregulation of innate immune response genes and neuronal activity-dependent genes in autism (2014)

Simone Gupta; Shannon E. Ellis; Foram N. Ashar; Anna Moes; Joel S. Bader; Jianan Zhan; Andrew B. West; Dan E. Arking

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article Autism spectrum disorder (ASD) is a common, highly heritable neurodevelopmental condition characterized by marked genetic heterogeneity. In this study, the authors use RNA sequencing analyses to characterize differences in the transcriptome between autistic and typically developing brains. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6748 Authors: Simone Gupta, Shannon E. Ellis, Foram N. Ashar, Anna Moes, Joel S. Bader, Jianan Zhan, Andrew B. West, Dan E. Arking

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All-organic optoelectronic sensor for pulse oximetry (2014)

Claire M. Lochner; Yasser Khan; Adrien Pierre; Ana C. Arias

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article Pulse oximetry is a non-invasive means for measuring blood oxygen saturation and pulse rate, with typical sensors based on rigid electronics. Here, the authors develop a pulse oximeter based solely on organic materials, allowing flexible devices and hence increasing the potential sensing locations on the body. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6745 Authors: Claire M. Lochner, Yasser Khan, Adrien Pierre, Ana C. Arias

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Laser-induced porous graphene films from commercial polymers (2014)

Jian Lin; Zhiwei Peng; Yuanyue Liu; Francisco Ruiz-Zepeda; Ruquan Ye; Errol L. G. Samuel; Miguel Jose Yacaman; Boris I. Yakobson; James M. Tour

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article The straightforward and scalable synthesis and patterning of graphene-based nanomaterials remains a technological challenge. Here, the authors use a CO 2 infrared laser, under ambient conditions, to directly produce and pattern porous graphene films with three-dimensional networks from commercial polymer films. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6714 Authors: Jian Lin, Zhiwei Peng, Yuanyue Liu, Francisco Ruiz-Zepeda, Ruquan Ye, Errol L. G. Samuel, Miguel Jose Yacaman, Boris I. Yakobson, James M. Tour

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Electrically tunable nonlinear plasmonics in graphene nanoislands (2014)

Joel D. Cox; F. Javier García de Abajo

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-13

Beschreibung: Article Plasmons in metallic nanostructures provide light enhancement that amplifies their nonlinear optical response. This study shows that graphene nanoislands also give rise to an amplified nonlinear polarizability that can be tuned electrically to surpass those of other nonlinear media by orders of magnitude. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6725 Authors: Joel D. Cox, F. Javier García de Abajo

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Structural insights into 5′ flap DNA unwinding and incision by the human FAN1 dimer (2014)

Qi Zhao; Xiaoyu Xue; Simonne Longerich; Patrick Sung; Yong Xiong

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-13

Beschreibung: Article FAN1 is a structure-specific nuclease that plays a major role in eliminating highly cytotoxic interstrand DNA crosslinks. Here, Zhao et al . present several crystal structures of FAN1 in complex with DNA substrates and biochemical analyses that establish how FAN1 functions to resolve interstrand DNA crosslinks. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6726 Authors: Qi Zhao, Xiaoyu Xue, Simonne Longerich, Patrick Sung, Yong Xiong

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Spartan deficiency causes genomic instability and progeroid phenotypes (2014)

Reeja S. Maskey; Myoung Shin Kim; Darren J. Baker; Bennett Childs; Liviu A. Malureanu; Karthik B. Jeganathan; Yuka Machida; Jan M. van Deursen; Yuichi J. Machida

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-13

Beschreibung: Article Spartan/DVC1 is a translesion synthesis regulator with important roles in cellular DNA damage tolerance. Here, the authors report that Spartan is essential for DNA lesion bypass and that Spartan insufficiency in mice causes chromosomal instability, cellular senescence and early onset of age-related phenotypes. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6744 Authors: Reeja S. Maskey, Myoung Shin Kim, Darren J. Baker, Bennett Childs, Liviu A. Malureanu, Karthik B. Jeganathan, Yuka Machida, Jan M. van Deursen, Yuichi J. Machida

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Geochemistry of silicate-rich rocks can curtail spreading of carbon dioxide in subsurface aquifers (2014)

S. S. S. Cardoso; J. T. H. Andres

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-13

Beschreibung: Article Carbon sequestration will be vital in mitigating future climate change, and understanding how CO 2 behaves in aquifers is important for developing technologies. Here, the authors suggest that silicate-rich rocks inhibit the transport of CO 2 , which may have consequences for future engineered storage facilities. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6743 Authors: S. S. S. Cardoso, J. T. H. Andres

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MORC1 represses transposable elements in the mouse male germline (2014)

William A. Pastor; Hume Stroud; Kevin Nee; Wanlu Liu; Dubravka Pezic; Sergei Manakov; Serena A. Lee; Guillaume Moissiard; Natasha Zamudio; Déborah Bourc’his; Alexei A. Aravin; Amander T. Clark; Steven E. Jacobsen

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-14

Beschreibung: Article The Microrchidia (Morc) family of GHKL ATPases are important repressors of transposons and other DNA-methylated and silent genes in A. thaliana . Here, the authors show that MORC1 is responsible for repression and methylation of specific classes of transposons in the mouse male germline. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6795 Authors: William A. Pastor, Hume Stroud, Kevin Nee, Wanlu Liu, Dubravka Pezic, Sergei Manakov, Serena A. Lee, Guillaume Moissiard, Natasha Zamudio, Déborah Bourc’his, Alexei A. Aravin, Amander T. Clark, Steven E. Jacobsen

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Clusterin facilitates stress-induced lipidation of LC3 and autophagosome biogenesis to enhance cancer cell survival (2014)

Fan Zhang; Masafumi Kumano; Eliana Beraldi; Ladan Fazli; Caigan Du; Susan Moore; Poul Sorensen; Amina Zoubeidi; Martin E. Gleave

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-14

Beschreibung: Article The induction of autophagy under stress conditions such as chemotherapy is a contributing factor towards resistance to anticancer therapy. Here, Zhang et al . identify the molecular chaperone clusterin as an adaptor that facilitates lipidation of LC3 and autophagosome biogenesis. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6775 Authors: Fan Zhang, Masafumi Kumano, Eliana Beraldi, Ladan Fazli, Caigan Du, Susan Moore, Poul Sorensen, Amina Zoubeidi, Martin E. Gleave

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Phosphorylation of LRRK2 by casein kinase 1α regulates trans-Golgi clustering via differential interaction with ARHGEF7 (2014)

Ruth Chia; Sara Haddock; Alexandra Beilina; Iakov N. Rudenko; Adamantios Mamais; Alice Kaganovich; Yan Li; Ravindran Kumaran; Michael A. Nalls; Mark R. Cookson

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article The kinase LRRK2 is implicated in Parkinson’s disease progression and is known to be phosphorylated. Chia et al. show that this phosphorylation is mediated by the kinase CK1a, and is required for the recruitment of LRRK2 to Golgi-derived vesicles, suggesting a role for this protein in Golgi maintenance. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6827 Authors: Ruth Chia, Sara Haddock, Alexandra Beilina, Iakov N. Rudenko, Adamantios Mamais, Alice Kaganovich, Yan Li, Ravindran Kumaran, Michael A. Nalls, Mark R. Cookson

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Control of membrane gaps by synaptotagmin-Ca2+ measured with a novel membrane distance ruler (2014)

Chao-Chen Lin; Jan Seikowski; Angel Pérez-Lara; Reinhard Jahn; Claudia Höbartner; Peter Jomo Walla

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Synaptotagmin-1 (syt-1) triggers fast synchronous neurotransmission mediated by fusion of synaptic vesicles with presynaptic membranes. Here Lin et al. use inter-membrane FRET combined with DNA rulers as calibration standards to quantify Ca 2+ -induced changes in membrane distances mediated by syt-1. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6859 Authors: Chao-Chen Lin, Jan Seikowski, Angel Pérez-Lara, Reinhard Jahn, Claudia Höbartner, Peter Jomo Walla

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Direct evidence for BBSome-associated intraflagellar transport reveals distinct properties of native mammalian cilia (2014)

Corey L. Williams; Jeremy C. McIntyre; Stephen R. Norris; Paul M. Jenkins; Lian Zhang; Qinglin Pei; Kristen Verhey; Jeffrey R. Martens

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Loss of olfactory function is one of the many symptoms of the ciliopathy Bardet–Biedl syndrome. Williams et al . show that Bardet–Biedl proteins are components of intraflagellar transport particles within cilia, and directly visualize their trafficking in native mammalian olfactory neurons. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6813 Authors: Corey L. Williams, Jeremy C. McIntyre, Stephen R. Norris, Paul M. Jenkins, Lian Zhang, Qinglin Pei, Kristen Verhey, Jeffrey R. Martens

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A chromatin activity-based chemoproteomic approach reveals a transcriptional repressome for gene-specific silencing (2014)

Cui Liu; Yanbao Yu; Feng Liu; Xin Wei; John A. Wrobel; Harsha P. Gunawardena; Li Zhou; Jian Jin; Xian Chen

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Immune cell pro-inflammatory gene expression is suppressed following prolonged stimulation. Using a chemoproteomic approach, the authors show that methyltransferase G9a forms a protein complex that promotes the transcriptional repressor activity of c-Myc to repress inflammation-induced gene expression. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6733 Authors: Cui Liu, Yanbao Yu, Feng Liu, Xin Wei, John A. Wrobel, Harsha P. Gunawardena, Li Zhou, Jian Jin, Xian Chen

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Low MITF/AXL ratio predicts early resistance to multiple targeted drugs in melanoma (2014)

Judith Müller; Oscar Krijgsman; Jennifer Tsoi; Lidia Robert; Willy Hugo; Chunying Song; Xiangju Kong; Patricia A. Possik; Paulien D. M. Cornelissen-Steijger; Marnix H Geukes Foppen; Kristel Kemper; Colin R. Goding; Ultan McDermott; Christian Blank; John Haanen; Thomas G. Graeber; Antoni Ribas; Roger S. Lo; Daniel S. Peeper

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Increased expression of MITF transcription factor is thought to promote melanoma progression and kinase inhibitor resistance. Here Muller et al . show that MITF loss is also common in melanomas and confers kinase inhibitor resistance due to upregulation of AXL and other receptor tyrosine kinases. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6712 Authors: Judith Müller, Oscar Krijgsman, Jennifer Tsoi, Lidia Robert, Willy Hugo, Chunying Song, Xiangju Kong, Patricia A. Possik, Paulien D. M. Cornelissen-Steijger, Marnix H Geukes Foppen, Kristel Kemper, Colin R. Goding, Ultan McDermott, Christian Blank, John Haanen, Thomas G. Graeber, Antoni Ribas, Roger S. Lo, Daniel S. Peeper

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Propagation style controls lava–snow interactions (2014)

B. R. Edwards; A. Belousov; M. Belousova

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article How volcanoes and the cryosphere interact is of interest for understanding hazard mitigation at ice-clad volcanoes and for paleoclimate studies. Here, the authors provide quantitative details from an eruption in Kamchatka, demonstrating that two kinds of lava, ′a′a and pahoehoe, produced different snowpack responses. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6666 Authors: B. R. Edwards, A. Belousov, M. Belousova

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Manifestation of unconventional biexciton states in quantum dots (2014)

Gerald Hönig; Gordon Callsen; Andrei Schliwa; Stefan Kalinowski; Christian Kindel; Satoshi Kako; Yasuhiko Arakawa; Dieter Bimberg; Axel Hoffmann

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Artificial atoms usually constitute an orbital structure for trapped charge carriers. Here, Hönig et al . demonstrate that polarization fields and large charge carrier masses can dilute the common orbital conception and find a hybrid-biexciton molecule that enables anomalous spin configurations. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6721 Authors: Gerald Hönig, Gordon Callsen, Andrei Schliwa, Stefan Kalinowski, Christian Kindel, Satoshi Kako, Yasuhiko Arakawa, Dieter Bimberg, Axel Hoffmann

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Bacteria can mobilize nematode-trapping fungi to kill nematodes (2014)

Xin Wang; Guo-Hong Li; Cheng-Gang Zou; Xing-Lai Ji; Tong Liu; Pei-Ji Zhao; Lian-Ming Liang; Jian-Ping Xu; Zhi-Qiang An; Xi Zheng; Yue-Ke Qin; Meng-Qing Tian; You-Yao Xu; Yi-Cheng Ma; Ze-Fen Yu; Xiao-Wei Huang; Shu-Qun Liu; Xue-Mei Niu; Jin-Kui Yang; Ying Huang; Ke-Qin Zhang

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Certain soil fungi form specialized cellular structures or 'traps' to feed on nematodes, which in turn eat bacteria. Here, the authors show that urea released from bacteria induces trap formation in the fungi and this promotes nematode elimination. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6776 Authors: Xin Wang, Guo-Hong Li, Cheng-Gang Zou, Xing-Lai Ji, Tong Liu, Pei-Ji Zhao, Lian-Ming Liang, Jian-Ping Xu, Zhi-Qiang An, Xi Zheng, Yue-Ke Qin, Meng-Qing Tian, You-Yao Xu, Yi-Cheng Ma, Ze-Fen Yu, Xiao-Wei Huang, Shu-Qun Liu, Xue-Mei Niu, Jin-Kui Yang, Ying Huang, Ke-Qin Zhang

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BMP signalling regulates the pre-implantation development of extra-embryonic cell lineages in the mouse embryo (2014)

Sarah J. L. Graham; Krzysztof B. Wicher; Agnieszka Jedrusik; Guoji Guo; Wishva Herath; Paul Robson; Magdalena Zernicka-Goetz

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article BMP signalling is important in early post-implantation embryonic development. Here the authors perform mRNA sequencing of inside and outside cells of pre-implantation mouse embryos and show that BMP signalling is critical for the development of the two extra-embryonic lineages at this early stage. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6667 Authors: Sarah J. L. Graham, Krzysztof B. Wicher, Agnieszka Jedrusik, Guoji Guo, Wishva Herath, Paul Robson, Magdalena Zernicka-Goetz

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High quality-factor optical nanocavities in bulk single-crystal diamond (2014)

Michael J. Burek; Yiwen Chu; Madelaine S. Z. Liddy; Parth Patel; Jake Rochman; Srujan Meesala; Wooyoung Hong; Qimin Quan; Mikhail D. Lukin; Marko Lončar

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Single-crystal diamond is a promising material for applications in classical and quantum optics, but the lack of scalable fabrication remains an issue. Here, Burek et al . adapt angle-etching nanofabrication techniques to realize ring resonators and photonic crystal cavities in single crystal diamond with quality factors in excess of 10 5 . Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6718 Authors: Michael J. Burek, Yiwen Chu, Madelaine S. Z. Liddy, Parth Patel, Jake Rochman, Srujan Meesala, Wooyoung Hong, Qimin Quan, Mikhail D. Lukin, Marko Lončar

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A dynamic supramolecular polymer with stimuli-responsive handedness for in situ probing of enzymatic ATP hydrolysis (2014)

Mohit Kumar; Patrick Brocorens; Claire TonneléDavid Beljonne; Mathieu Surin; Subi J. George

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Interesting changes in physical and optical properties can result from the binding of small molecules to supramolecular polymers. Here, the authors present an ATP assay, using a supramolecular helix to switch between left- and right-handed conformations on binding different adenosine phosphates. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6793 Authors: Mohit Kumar, Patrick Brocorens, Claire Tonnelé, David Beljonne, Mathieu Surin, Subi J. George

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Transposable element islands facilitate adaptation to novel environments in an invasive species (2014)

Lukas Schrader; Jay W. Kim; Daniel Ence; Aleksey Zimin; Antonia Klein; Katharina Wyschetzki; Tobias Weichselgartner; Carsten Kemena; Johannes Stökl; Eva Schultner; Yannick Wurm; Christopher D. Smith; Mark Yandell; Jürgen Heinze; Jürgen Gadau; Jan Oettler

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Genetic variation is key to species evolution. Here the authors sequence two phenotypically distinct populations of the ant Cardiocondyla obscurior , and find accumulations of transposable elements correlating with genetic variation that may have a role in differentiation, adaptation and speciation. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6495 Authors: Lukas Schrader, Jay W. Kim, Daniel Ence, Aleksey Zimin, Antonia Klein, Katharina Wyschetzki, Tobias Weichselgartner, Carsten Kemena, Johannes Stökl, Eva Schultner, Yannick Wurm, Christopher D. Smith, Mark Yandell, Jürgen Heinze, Jürgen Gadau, Jan Oettler

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A recoverable state of axon injury persists for hours after spinal cord contusion in vivo (2014)

Philip R. Williams; Bogdan-Nicolae Marincu; Catherine D. Sorbara; Christoph F. Mahler; Adrian-Minh Schumacher; Oliver Griesbeck; Martin Kerschensteiner; Thomas Misgeld

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article A potential therapeutic strategy for spinal cord injury (SCI) is to maintain continuity of damaged axons after contusion, but the viability of such strategies depends on the degree to which initially injured axons can recover. Here the authors use morphological and molecular in vivo imaging after contusion SCI in mice, to show that injured axons persist in a metastable state for hours. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6683 Authors: Philip R. Williams, Bogdan-Nicolae Marincu, Catherine D. Sorbara, Christoph F. Mahler, Adrian-Minh Schumacher, Oliver Griesbeck, Martin Kerschensteiner, Thomas Misgeld

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An ecdysone-responsive nuclear receptor regulates circadian rhythms in Drosophila (2014)

Shailesh Kumar; Dechun Chen; Christopher Jang; Alexandra Nall; Xiangzhong Zheng; Amita Sehgal

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article The mammalian circadian clock is influenced by nuclear receptors such as Rev-Erb. Here Kumar et al . show that ecdysone-induced protein 75 (E75), a fly homologue of Rev-Erb, regulates circadian rhythms in Drosophila , and demonstrate that E75 protects the clock against environmental stressors. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6697 Authors: Shailesh Kumar, Dechun Chen, Christopher Jang, Alexandra Nall, Xiangzhong Zheng, Amita Sehgal

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An epigenetic switch induced by Shh signalling regulates gene activation during development and medulloblastoma growth (2014)

Xuanming Shi; Zilai Zhang; Xiaoming Zhan; Mou Cao; Takashi Satoh; Shizuo Akira; Karl Shpargel; Terry Magnuson; Qingtian Li; Rongfu Wang; Chaochen Wang; Kai Ge; Jiang Wu

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article The Sonic hedgehog (Shh) signalling pathway plays important roles during development and its abnormal activation has been implicated in cancer. Here the authors uncover an epigenetic switch in the Shh pathway that involves the PRC2, Jmjd3/Kdm6b and Set1/MLL complexes in regulating signalling induced gene activation. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6425 Authors: Xuanming Shi, Zilai Zhang, Xiaoming Zhan, Mou Cao, Takashi Satoh, Shizuo Akira, Karl Shpargel, Terry Magnuson, Qingtian Li, Rongfu Wang, Chaochen Wang, Kai Ge, Jiang Wu

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Unravelling the multilayer growth of the fullerene C60 in real time (2014)

S. Bommel; N. Kleppmann; C. Weber; H. Spranger; P. Schäfer; J. Novak; S.V. Roth; F. Schreiber; S.H.L. Klapp; S. Kowarik

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article Despite the technological relevance of molecular thin films, there is limited understanding of their growth on a molecular level. Here, the authors characterize the relevant processes in real time and determine energy parameters using a combination of X-ray techniques and kinetic Monte Carlo simulations. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6388 Authors: S. Bommel, N. Kleppmann, C. Weber, H. Spranger, P. Schäfer, J. Novak, S.V. Roth, F. Schreiber, S.H.L. Klapp, S. Kowarik

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ZBTB20 regulates nociception and pain sensation by modulating TRP channel expression in nociceptive sensory neurons (2014)

An-Jing Ren; Kai Wang; Huan Zhang; Anjun Liu; Xianhua Ma; Qing Liang; Dongmei Cao; John N. Wood; David Z. He; Yu-Qiang Ding; Wen-Jun Yuan; Zhifang Xie; Weiping J. Zhang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article The upregulation of TRP ion channels is implicated in pain processing. In this study, the authors show that the zinc-finger protein ZBTB20 is responsible for TRP channel upregulation, and eliminating ZBTB20 from pain-sensing neurons in mouse models of pain results in the reduction of pain-like sensation. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms5984 Authors: An-Jing Ren, Kai Wang, Huan Zhang, Anjun Liu, Xianhua Ma, Qing Liang, Dongmei Cao, John N. Wood, David Z. He, Yu-Qiang Ding, Wen-Jun Yuan, Zhifang Xie, Weiping J. Zhang

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Quantum yield and excitation rate of single molecules close to metallic nanostructures (2014)

Phil Holzmeister; Enrico Pibiri; Jürgen J. Schmied; Tapasi Sen; Guillermo P. Acuna; Philip Tinnefeld

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article Metal nanostructures strongly influence fluorescence of nearby molecules, ranging from significant enhancement to total quenching. To decode the precise interactions taking place, Holzmeister et al . present a method that distinguishes the contributions to excitation, radiative and non-radiative rates. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6356 Authors: Phil Holzmeister, Enrico Pibiri, Jürgen J. Schmied, Tapasi Sen, Guillermo P. Acuna, Philip Tinnefeld

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Fano resonance and dipolar relaxation in lead-free relaxors (2014)

D. Wang; J. Hlinka; A. A. Bokov; Z. -G. Ye; P. Ondrejkovic; J. Petzelt; L. Bellaiche

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article Relaxor ferroelectrics are important materials that are used in electronic capacitors and other devices, although the origin of their unusual properties remains poorly understood. Here, the authors predict that Fano resonances between phonon modes could explain some properties of lead-free relaxors. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6100 Authors: D. Wang, J. Hlinka, A. A. Bokov, Z. -G. Ye, P. Ondrejkovic, J. Petzelt, L. Bellaiche

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Disproving the Peres conjecture by showing Bell nonlocality from bound entanglement (2014)

Tamás Vértesi; Nicolas Brunner

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article A longstanding question in quantum information is the validity of the disputed Peres conjecture stating that bound entangled state can never lead to Bell inequality violation. Here Vértesi and Brunner prove that the Peres conjecture is false by providing an explicit counter example. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6297 Authors: Tamás Vértesi, Nicolas Brunner

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Cotton cytochrome P450 CYP82D regulates systemic cell death by modulating the octadecanoid pathway (2014)

Longqing Sun; Longfu Zhu; Li Xu; Daojun Yuan; Ling Min; Xianlong Zhang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-07

Beschreibung: Article Oxylipin signalling is known to play important roles in plant growth, development and defence against pathogens. Here Sun et al. identify a novel cytochrome P450 in cotton and show that its suppression leads to activation of plant defence responses and alteration of oxylipin metabolism. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6372 Authors: Longqing Sun, Longfu Zhu, Li Xu, Daojun Yuan, Ling Min, Xianlong Zhang

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Gold-promoted structurally ordered intermetallic palladium cobalt nanoparticles for the oxygen reduction reaction (2014)

Kurian A. Kuttiyiel; Kotaro Sasaki; Dong Su; Lijun Wu; Yimei Zhu; Radoslav R. Adzic

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article There is substantial research into new catalysts for oxygen reduction. Here, the authors report a structurally ordered gold–palladium–cobalt intermetallic catalyst which exhibits comparable activity to platinum/carbon in both acid and alkaline media, and probe its structure-activity behaviour. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6185 Authors: Kurian A. Kuttiyiel, Kotaro Sasaki, Dong Su, Lijun Wu, Yimei Zhu, Radoslav R. Adzic

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Rectified directional sensing in long-range cell migration (2014)

Akihiko Nakajima; Shuji Ishihara; Daisuke Imoto; Satoshi Sawai

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article Cell migration is regulated by spatial and temporal information, but how the two are integrated is not well understood. Here, Nakajima et al . use dynamic microfluidics gradients to show that Ras activation at the leading edge of Dictyostelium is suppressed when chemoattractant concentration decreases over time. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6367 Authors: Akihiko Nakajima, Shuji Ishihara, Daisuke Imoto, Satoshi Sawai

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Titania single crystals with a curved surface (2014)

Shuang Yang; Bing Xing Yang; Long Wu; Yu Hang Li; Porun Liu; Huijun Zhao; Yan Yan Yu; Xue Qing Gong; Hua Gui Yang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article Thermodynamics typically favour the formation of crystals with flat facets. Here, the authors report an approach for the synthesis of curved boundaries in titania single crystals, composed of high index microfacets. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6355 Authors: Shuang Yang, Bing Xing Yang, Long Wu, Yu Hang Li, Porun Liu, Huijun Zhao, Yan Yan Yu, Xue Qing Gong, Hua Gui Yang

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Orbital Asian summer monsoon dynamics revealed using an isotope-enabled global climate model (2014)

Thibaut Caley; Didier M. Roche; Hans Renssen

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article Asian speleothem δ 18 O records are widely used as a proxy for summer monsoon intensity, but their validity has been questioned. Here, the authors evaluate their validity using a 150,000-year transient simulation from an isotope-enabled global climate model. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6371 Authors: Thibaut Caley, Didier M. Roche, Hans Renssen

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Synthesizing AND gate genetic circuits based on CRISPR-Cas9 for identification of bladder cancer cells (2014)

Yuchen Liu; Yayue Zeng; Li Liu; Chengle Zhuang; Xing Fu; Weiren Huang; Zhiming Cai

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article Tools derived from synthetic biology offer powerful means to refine drug delivery and disease detection. Liu et al . engineer a logical AND gate using CRISPR-Cas9 to drive gene expression only cells in which two promoters are active, and use it to selectively inhibit the growth of bladder cancer cells in vitro . Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6393 Authors: Yuchen Liu, Yayue Zeng, Li Liu, Chengle Zhuang, Xing Fu, Weiren Huang, Zhiming Cai

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Electrically controlled one-way photon flow in plasmonic nanostructures (2014)

Artur Davoyan; Nader Engheta

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-08

Beschreibung: Article If photonics and electronics are to form hybrid information processing systems, it will be necessary to manipulate and isolate light electrically, over short distances. Davoyan and Engheta propose a route to achieve this in plasmonic waveguides by exploiting the magnetic field induced by a direct current. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6250 Authors: Artur Davoyan, Nader Engheta

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n-type chalcogenides by ion implantation (2014)

Mark A. Hughes; Yanina Fedorenko; Behrad Gholipour; Jin Yao; Tae-Hoon Lee; Russell M. Gwilliam; Kevin P. Homewood; Steven Hinder; Daniel W. Hewak; Stephen R. Elliott; Richard J. Curry

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article The use of chalcogenide glasses in simple electronic devices, such as a p-n junction, is hindered by the lack of n-type material. Here, Hughes et al. demonstrate n-type doping of GeTe and GaLaSO amorphous films using bismuth-ion implantation. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6346 Authors: Mark A. Hughes, Yanina Fedorenko, Behrad Gholipour, Jin Yao, Tae-Hoon Lee, Russell M. Gwilliam, Kevin P. Homewood, Steven Hinder, Daniel W. Hewak, Stephen R. Elliott, Richard J. Curry

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An extremely low-density human population exterminated New Zealand moa (2014)

Richard N. Holdaway; Morten E. Allentoft; Christopher Jacomb; Charlotte L. Oskam; Nancy R. Beavan; Michael Bunce

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article It is generally accepted that Polynesian settlers were directly responsible for the extinction of New Zealand moa. Here, the authors present three series of radiocarbon ages that define the brief period of interaction between Polynesians and moa, and show that high human population densities are not a prerequisite for the extinction of megafauna populations. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6436 Authors: Richard N. Holdaway, Morten E. Allentoft, Christopher Jacomb, Charlotte L. Oskam, Nancy R. Beavan, Michael Bunce

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Genomic identification and characterization of the pseudoautosomal region in highly differentiated avian sex chromosomes (2014)

Linnéa Smeds; Takeshi Kawakami; Reto Burri; Paulina Bolivar; Arild Husby; Anna Qvarnström; Severin Uebbing; Hans Ellegren

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article The genetic basis of sex chromosome pseudoautosomal regions (PAR) in organisms with female heterogamety is largely unknown. Smeds et al. provide the first molecular characterization of the PAR in birds with differentiated sex chromosomes and show a potential recombination hotspot and no evidence for strong sexual antagonism in this region. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6448 Authors: Linnéa Smeds, Takeshi Kawakami, Reto Burri, Paulina Bolivar, Arild Husby, Anna Qvarnström, Severin Uebbing, Hans Ellegren

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Spin–orbital dynamics in a system of polar molecules (2014)

Sergey V. Syzranov; Michael L. Wall; Victor Gurarie; Ana Maria Rey

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article Spin–orbit coupling gives rise to a plethora of rich phenomena in many condensed matter and atomic systems. Syzranov et al. study the role of dipole–dipole interactions in ultracold polar molecule gases and show that they produce an effective spin–orbit coupling that generates chiral excitations. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6391 Authors: Sergey V. Syzranov, Michael L. Wall, Victor Gurarie, Ana Maria Rey

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Origin of the unique ventilatory apparatus of turtles (2014)

Tyler R. Lyson; Emma R. Schachner; Jennifer Botha-Brink; Torsten M. Scheyer; Markus Lambertz; G. S. Bever; Bruce S. Rubidge; Kevin de Queiroz

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article The origin of the unique turtle lung ventilatory apparatus is poorly understood. Here the authors show an increase in body wall rigidity early in evolution that allowed the abdominal muscles to become specialized for breathing and the ribs to eventually form the iconic turtle shell. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6211 Authors: Tyler R. Lyson, Emma R. Schachner, Jennifer Botha-Brink, Torsten M. Scheyer, Markus Lambertz, G. S. Bever, Bruce S. Rubidge, Kevin de Queiroz

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Mechanistic determinants of the directionality and energetics of active export by a heterodimeric ABC transporter (2014)

Nina Grossmann; Ahmet S. Vakkasoglu; Sabine Hulpke; Rupert Abele; Rachelle Gaudet; Robert Tampé

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article ABC systems are an important class of transporters involved in human pathologies for which the basis for transport remains poorly understood. Here the authors suggest a molecular basis for ATP-powered vectorial peptide export by the human transporter associated with antigen processing (TAP). Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6419 Authors: Nina Grossmann, Ahmet S. Vakkasoglu, Sabine Hulpke, Rupert Abele, Rachelle Gaudet, Robert Tampé

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Large surface relaxation in the organic semiconductor tetracene (2014)

Hazuki Morisaki; Takashi Koretsune; Chisa Hotta; Jun Takeya; Tsuyoshi Kimura; Yusuke Wakabayashi

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article Interfacial charge transport determines the performance of organic semiconductors, yet the surface influence is poorly understood. Here, Morisaki et al. observe surface relaxation and its resulting transport properties in the first monolayer of tetracene, which are dissimilar to those of the bulk. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6400 Authors: Hazuki Morisaki, Takashi Koretsune, Chisa Hotta, Jun Takeya, Tsuyoshi Kimura, Yusuke Wakabayashi

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Cooperative dual palladium/silver catalyst for direct difluoromethylation of aryl bromides and iodides (2014)

Yang Gu; Xuebing Leng; Qilong Shen

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article Difluoromethylation of organic molecules typically requires stoichiometric metal salts or harsh conditions. Here, the authors report a dual metal catalytic system for difluoromethylation allowing mild and direct functionalization of aryl halides, including highly functionalized molecules. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6405 Authors: Yang Gu, Xuebing Leng, Qilong Shen

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The molecular structure of the left-handed supra-molecular helix of eukaryotic polyribosomes (2014)

Alexander G. Myasnikov; Zhanna A. Afonina; Jean-François Ménétret; Vladimir A. Shirokov; Alexander S. Spirin; Bruno P. Klaholz

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article During translation, several ribosomes assemble on an mRNA strand to form polyribosomes. Here the authors describe—using cryo electron tomography—a compact state of the eukaryotic polysome where individual ribosomes contact each other and form a tight helical assembly that creates a continuous inner channel for the mRNA. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6294 Authors: Alexander G. Myasnikov, Zhanna A. Afonina, Jean-François Ménétret, Vladimir A. Shirokov, Alexander S. Spirin, Bruno P. Klaholz

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NAA10 controls osteoblast differentiation and bone formation as a feedback regulator of Runx2 (2014)

Haejin Yoon; Hye-Lim Kim; Yang-Sook Chun; Dong Hoon Shin; Kyoung-Hwa Lee; Chan Soo Shin; Dong Yeon Lee; Hong-Hee Kim; Zang Hee Lee; Hyun-Mo Ryoo; Mi-Ni Lee; Goo Taeg Oh; Jong-Wan Park

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article N -alpha-acetyltransferase 10 (NAA10) regulates cell growth and proliferation. Here the authors show that NAA10 also has a role in osteogenesis, by fine-tuning the activity of the osteogenic transcription factor Runx2. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6176 Authors: Haejin Yoon, Hye-Lim Kim, Yang-Sook Chun, Dong Hoon Shin, Kyoung-Hwa Lee, Chan Soo Shin, Dong Yeon Lee, Hong-Hee Kim, Zang Hee Lee, Hyun-Mo Ryoo, Mi-Ni Lee, Goo Taeg Oh, Jong-Wan Park

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Bond competition and phase evolution on the IrTe2 surface (2014)

Qing Li; Wenzhi Lin; Jiaqiang Yan; Xin Chen; Anthony G. Gianfrancesco; David J. Singh; David Mandrus; Sergei V. Kalinin; Minghu Pan

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-09

Beschreibung: Article Understanding the structural relationship and electronic states between incommensurate/commensurate phases remains an ongoing challenge. Here, the authors report incommensurate structures and electronic roughness on the surface of cleaved IrTe 2 . Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6358 Authors: Qing Li, Wenzhi Lin, Jiaqiang Yan, Xin Chen, Anthony G. Gianfrancesco, David J. Singh, David Mandrus, Sergei V. Kalinin, Minghu Pan

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Three-dimensional plasmonic stereoscopic prints in full colour (2014)

Xiao Ming Goh; Yihan Zheng; Shawn J. Tan; Lei Zhang; Karthik Kumar; Cheng-Wei Qiu; Joel K. W. Yang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Plasmonic nanostructures enable control over the spatial and spectral dependence of scattered light. Here, the authors use pixels formed of nanoellipse or nanosquare dimers to show polarization-dependent full-colour scattering in reflection, and build 3D stereoscopic colour microprints from them. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6361 Authors: Xiao Ming Goh, Yihan Zheng, Shawn J. Tan, Lei Zhang, Karthik Kumar, Cheng-Wei Qiu, Joel K. W. Yang

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Swimming by reciprocal motion at low Reynolds number (2014)

Tian Qiu; Tung-Chun Lee; Andrew G. Mark; Konstantin I. Morozov; Raphael Münster; Otto Mierka; Stefan Turek; Alexander M. Leshansky; Peer Fischer

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Operating devices that can navigate biomedical fluids and tissues is one of the ultimate goals of microrobotics. Whilst the current designs are restricted to non-reciprocal actuations, Qiu et al . report swimming via simple reciprocal motion by exploiting the non-Newtonian rheology of viscous fluids. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6119 Authors: Tian Qiu, Tung-Chun Lee, Andrew G. Mark, Konstantin I. Morozov, Raphael Münster, Otto Mierka, Stefan Turek, Alexander M. Leshansky, Peer Fischer

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CD95 and CD95L promote and protect cancer stem cells (2014)

Paolo Ceppi; Abbas Hadji; Frederick J. Kohlhapp; Abhinandan Pattanayak; Annika Hau; Xia Liu; Huiping Liu; Andrea E. Murmann; Marcus E. Peter

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article The death receptor CD95/Fas induces apoptosis of many normal cells but prevents necrotic death of cancer cells. Here the authors demonstrate that CD95 activation promotes a cancer stem cell (CSC) phenotype, and that CSCs but not differentiated cancer cells are resistant to CD95-mediated apoptosis and depend on CD95 signalling to prevent necrosis. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6238 Authors: Paolo Ceppi, Abbas Hadji, Frederick J. Kohlhapp, Abhinandan Pattanayak, Annika Hau, Xia Liu, Huiping Liu, Andrea E. Murmann, Marcus E. Peter

Digitale ISSN: 2041-1723

Thema: Biologie , Chemie und Pharmazie , Allgemeine Naturwissenschaft , Physik

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PAR-CLIP analysis uncovers AUF1 impact on target RNA fate and genome integrity (2014)

Je-Hyun Yoon; Supriyo De; Subramanya Srikantan; Kotb Abdelmohsen; Ioannis Grammatikakis; Jiyoung Kim; Kyoung Mi Kim; Ji Heon Noh; Elizabeth J. F. White; Jennifer L. Martindale; Xiaoling Yang; Min-Ju Kang; William H. Wood 3rd; Nicole Noren Hooten; Michele K. Evans; Kevin G. Becker; Vidisha Tripathi; Kannanganattu V. Prasanth; Gerald M. Wilson; Thomas Tuschl; Nicholas T. Ingolia; Markus Hafner; Myriam Gorospe

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article AUF1 is an RNA-binding protein believed to function mostly by regulating the decay of its target transcripts. Here, Yoon et al. systematically identify the targets of AUF1 and provide insights into how AUF1 functions to regulate various cellular processes by enhancing the decay, stability or translation of specific RNAs. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6248 Authors: Je-Hyun Yoon, Supriyo De, Subramanya Srikantan, Kotb Abdelmohsen, Ioannis Grammatikakis, Jiyoung Kim, Kyoung Mi Kim, Ji Heon Noh, Elizabeth J. F. White, Jennifer L. Martindale, Xiaoling Yang, Min-Ju Kang, William H. Wood 3rd, Nicole Noren Hooten, Michele K. Evans, Kevin G. Becker, Vidisha Tripathi, Kannanganattu V. Prasanth, Gerald M. Wilson, Thomas Tuschl, Nicholas T. Ingolia, Markus Hafner, Myriam Gorospe

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Observation of Dicke superradiance for two artificial atoms in a cavity with high decay rate (2014)

J. A. Mlynek; A. A. Abdumalikov; C. Eichler; A. Wallraff

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Individual emitters of light in close proximity, such as atoms, can couple together via the light they create leading to a concentrated burst of radiation. Here Mlynek et al. experminetally explore the fundamental origin of this superradiance by studying two superconducting qubits coupled to a microwave cavity. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6186 Authors: J. A. Mlynek, A. A. Abdumalikov, C. Eichler, A. Wallraff

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The quantum nature of skyrmions and half-skyrmions in Cu2OSeO3 (2014)

Oleg Janson; Ioannis Rousochatzakis; Alexander A. Tsirlin; Marilena Belesi; Andrei A. Leonov; Ulrich K. Rößler; Jeroen van den Brink; Helge Rosner

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article In chiral helimagnets, the Dzyaloshinskii–Moriya interaction is known to stabilize skyrmions, but the microscopic roots remain enigmatic. Here, Janson et al. apply a multi-scale approach to Cu 2 OSeO 3 and show that its skyrmions can be traced back to magnetic tetrahedra of a quantum nature. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6376 Authors: Oleg Janson, Ioannis Rousochatzakis, Alexander A. Tsirlin, Marilena Belesi, Andrei A. Leonov, Ulrich K. Rößler, Jeroen van den Brink, Helge Rosner

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Oncogenic Kit signals on endolysosomes and endoplasmic reticulum are essential for neoplastic mast cell proliferation (2014)

Yuuki Obata; Shota Toyoshima; Ei Wakamatsu; Shunichi Suzuki; Shuhei Ogawa; Hiroyasu Esumi; Ryo Abe

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article Activating mutations of the tyrosine kinase Kit are commonly found in mast cell neoplasms and gastrointestinal stromal tumours. Here the authors show that mutant Kit, through the activation of PI3K and STAT3 pathways, elicits proliferative and survival signals from endolysosomes and from the endoplasmic reticulum. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6715 Authors: Yuuki Obata, Shota Toyoshima, Ei Wakamatsu, Shunichi Suzuki, Shuhei Ogawa, Hiroyasu Esumi, Ryo Abe

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Atomic-scale structure and properties of highly stable antiphase boundary defects in Fe3O4 (2014)

Keith P. McKenna; Florian Hofer; Daniel Gilks; Vlado K. Lazarov; Chunlin Chen; Zhongchang Wang; Yuichi Ikuhara

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article Although Fe 3 O 4 is widely investigated for a variety of applications, the relation between some defects and its properties remains poorly understood. Here, the authors use high-resolution transmission electron microscopy and simulations to determine the atomic structure of the common antiphase boundary defects. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6740 Authors: Keith P. McKenna, Florian Hofer, Daniel Gilks, Vlado K. Lazarov, Chunlin Chen, Zhongchang Wang, Yuichi Ikuhara

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The evolution of photosynthesis in chromist algae through serial endosymbioses (2014)

John W. Stiller; John Schreiber; Jipei Yue; Hui Guo; Qin Ding; Jinling Huang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article The chromalveolate hypothesis proposes that chromist algae became photosynthetic through a single endosymbiosis in a common ancestor. Here, Stiller et al . use a novel statistical approach to propose that instead, the major chromist algae arose as a result of three specific serial plastid transfers. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6764 Authors: John W. Stiller, John Schreiber, Jipei Yue, Hui Guo, Qin Ding, Jinling Huang

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Structure and properties of complex hydride perovskite materials (2014)

Pascal Schouwink; Morten B. Ley; Antoine Tissot; Hans Hagemann; Torben R. JensenĽubomír Smrčok; Radovan Černý

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-12

Beschreibung: Article Complex metal hydrides are of interest for applications such as hydrogen storage, solid-state phosphors and solid electrolytes. Here the authors present the synthesis and properties of 30 complex hydride compounds with a perovskite crystal structure, based on the BH4 − anion and new synthesis protocols involving rare-earth elements. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6706 Authors: Pascal Schouwink, Morten B. Ley, Antoine Tissot, Hans Hagemann, Torben R. Jensen, Ľubomír Smrčok, Radovan Černý

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Evolution of hidden localized flow during glass-to-liquid transition in metallic glass (2014)

Z. Wang; B. A. Sun; H. Y. Bai; W. H. Wang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Glasses are known to have very slow flow behaviour on application of force, but the structural basis for this flow is currently unclear. Here Wang et al. use a dynamic mechanical analysis to study the flow phenomena in a La-based metallic glass. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6823 Authors: Z. Wang, B. A. Sun, H. Y. Bai, W. H. Wang

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STAT3 restrains RANK- and TLR4-mediated signalling by suppressing expression of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme Ubc13 (2014)

Huiyuan Zhang; Hongbo Hu; Nathaniel Greeley; Jin Jin; Allison J Matthews; Erika Ohashi; Mauricio S. Caetano; Haiyan S. Li; Xuefeng Wu; Pijus K. Mandal; John S. McMurray; Seyed Javad Moghaddam; Shao-Cong Sun; Stephanie S. Watowich

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article The transcription factor STAT3 regulates production of inflammatory cytokines by modulating NF-κB signalling. Here the authors show that STAT3 is a transcriptional repressor of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme Ubc13, modulating NF-κB by regulating Ubc13 abundance. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6798 Authors: Huiyuan Zhang, Hongbo Hu, Nathaniel Greeley, Jin Jin, Allison J Matthews, Erika Ohashi, Mauricio S. Caetano, Haiyan S. Li, Xuefeng Wu, Pijus K. Mandal, John S. McMurray, Seyed Javad Moghaddam, Shao-Cong Sun, Stephanie S. Watowich

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Constitutive and ligand-induced EGFR signalling triggers distinct and mutually exclusive downstream signalling networks (2014)

Sharmistha Chakraborty; Li Li; Vineshkumar Thidil Puliyappadamba; Gao Guo; Kimmo J. Hatanpaa; Bruce Mickey; Rhonda F. Souza; Peggy Vo; Joachim Herz; Mei-Ru Chen; David A. Boothman; Tej K. Pandita; David H. Wang; Ganes C. Sen; Amyn A. Habib

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Epidermal growth factor receptor (EGFR) elicits the signalling function after dimerization and activation of its kinase activity and perturbations in this pathway are often found in cancer. Here the authors describe two distinct and mutually exclusive modes of EGFR signalling due to a switch of EGFR-associated proteins with the ligand. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6811 Authors: Sharmistha Chakraborty, Li Li, Vineshkumar Thidil Puliyappadamba, Gao Guo, Kimmo J. Hatanpaa, Bruce Mickey, Rhonda F. Souza, Peggy Vo, Joachim Herz, Mei-Ru Chen, David A. Boothman, Tej K. Pandita, David H. Wang, Ganes C. Sen, Amyn A. Habib

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A fully atomistic computer simulation study of cold denaturation of a β-hairpin (2014)

Changwon Yang; Soonmin Jang; Youngshang Pak

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Cold denaturation is the process by which globular proteins lose their structural integrity at sufficiently low temperatures. Here, the authors present an all-atom MD simulation of cold denaturation of the 16-mer hairpin peptide MrH1 using an explicit water model. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6773 Authors: Changwon Yang, Soonmin Jang, Youngshang Pak

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A tetrahelical DNA fold adopted by tandem repeats of alternating GGG and GCG tracts (2014)

Vojč Kocman; Janez Plavec

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article The VK1 sequence of the PLEKHG3 gene is expressed in the brain and is linked to the development of autism. Here, the authors present a structural analysis of this gene and found that due to its alternating GGG and GCG repeats, it folds into a tetrahelical structure distinct from G-quadruplexes. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6831 Authors: Vojč Kocman, Janez Plavec

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Steric engineering of metal-halide perovskites with tunable optical band gaps (2014)

Marina R. Filip; Giles E. Eperon; Henry J. Snaith; Feliciano Giustino

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article The performance of solar cells based on metal-halide perovskites has improved rapidly in recent years. First principles calculations and experiments performed by Filip et al. suggest new routes to controlling the band gap of these materials, which could enable further improvements in their performance. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6757 Authors: Marina R. Filip, Giles E. Eperon, Henry J. Snaith, Feliciano Giustino

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Spatial control of functional properties via octahedral modulations in complex oxide superlattices (2014)

E. J. Moon; R. Colby; Q. Wang; E. Karapetrova; C. M. Schlepütz; M. R. Fitzsimmons; S. J. May

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Structural properties have been a key factor that controls the electronic and magnetic behaviour at the interface of two oxide materials. Here the authors achieve a spatial control over these functional properties in oxides through the formation of octahedral superstructures in manganite superlattices. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6710 Authors: E. J. Moon, R. Colby, Q. Wang, E. Karapetrova, C. M. Schlepütz, M. R. Fitzsimmons, S. J. May

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Mutational landscape of intrahepatic cholangiocarcinoma (2014)

Shanshan Zou; Jiarui Li; Huabang Zhou; Christian Frech; Xiaolan Jiang; Jeffrey S. C. Chu; Xinyin Zhao; Yuqiong Li; Qiaomei Li; Hui Wang; Jingyi Hu; Guanyi Kong; Mengchao Wu; Chuanfan Ding; Nansheng Chen; Heping Hu

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is a fatal primary liver cancer with a known genetic component. Here the authors sequence the exomes of matched tumour and normal tissue from 103 ICC patients in China, and identify an ICC mutational profile associated with liver inflammation, fibrosis and cirrhosis. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6696 Authors: Shanshan Zou, Jiarui Li, Huabang Zhou, Christian Frech, Xiaolan Jiang, Jeffrey S. C. Chu, Xinyin Zhao, Yuqiong Li, Qiaomei Li, Hui Wang, Jingyi Hu, Guanyi Kong, Mengchao Wu, Chuanfan Ding, Nansheng Chen, Heping Hu

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Atomic electric fields revealed by a quantum mechanical approach to electron picodiffraction (2014)

Knut Müller; Florian F. Krause; Armand BéchéMarco Schowalter; Vincent Galioit; Stefan Löffler; Johan Verbeeck; Josef Zweck; Peter Schattschneider; Andreas Rosenauer

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Advances in electron microscopy are enabling ever smaller features to be probed, with the measurement of atomic electric fields standing as a major challenge. Towards that aim, Müller et al. present a simplified theoretical approach for enhancing the resolution in differential phase contrast microscopy. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6653 Authors: Knut Müller, Florian F. Krause, Armand Béché, Marco Schowalter, Vincent Galioit, Stefan Löffler, Johan Verbeeck, Josef Zweck, Peter Schattschneider, Andreas Rosenauer

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Impact of oceanic-scale interactions on the seasonal modulation of ocean dynamics by the atmosphere (2014)

Hideharu Sasaki; Patrice Klein; Bo Qiu; Yoshikazu Sasai

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Oceanic mesoscale eddies are thought to derive from internal ocean instability. Here, the authors present a high-resolution simulation of the North Pacific Ocean and show that mesoscale eddies are instead sustained by small-scale mixed-layer instabilities triggered by atmospheric forcing in winter. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6636 Authors: Hideharu Sasaki, Patrice Klein, Bo Qiu, Yoshikazu Sasai

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On the conditions of magma mixing and its bearing on andesite production in the crust (2014)

Mickael Laumonier; Bruno Scaillet; Michel Pichavant; Rémi Champallier; Joan Andujar; Laurent Arbaret

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article Andesites are a large part of the continental crust, but their origins remain enigmatic. Here, the authors update older mixing models via high-temperature experiments and thermal calculations, showing that homogeneous mixtures are only possible with high mafic fractions and during high magma flux. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6607 Authors: Mickael Laumonier, Bruno Scaillet, Michel Pichavant, Rémi Champallier, Joan Andujar, Laurent Arbaret

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The structural basis for receptor recognition of human interleukin-18 (2014)

Naotaka Tsutsumi; Takeshi Kimura; Kyohei Arita; Mariko Ariyoshi; Hidenori Ohnishi; Takahiro Yamamoto; Xiaobing Zuo; Katsumi Maenaka; Enoch Y. Park; Naomi Kondo; Masahiro Shirakawa; Hidehito Tochio; Zenichiro Kato

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-17

Beschreibung: Article IL-18 is a member of the IL-1 family of proinflammatory cytokines. Tsutsumi et al. present a crystal structure of IL-18 bound to the extracellular domains of its heterodimeric receptor, providing insight into how its unusual specificity may be targeted pharmacologically. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6340 Authors: Naotaka Tsutsumi, Takeshi Kimura, Kyohei Arita, Mariko Ariyoshi, Hidenori Ohnishi, Takahiro Yamamoto, Xiaobing Zuo, Katsumi Maenaka, Enoch Y. Park, Naomi Kondo, Masahiro Shirakawa, Hidehito Tochio, Zenichiro Kato

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Crystallographic and spectroscopic characterization and reactivities of a mononuclear non-haem iron(III)-superoxo complex (2014)

Seungwoo Hong; Kyle D. Sutherlin; Jiyoung Park; Eunji Kwon; Maxime A. Siegler; Edward I. Solomon; Wonwoo Nam

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Non-haem iron superoxo species—proposed as key intermediates in catalytic activation of molecular oxygen—have proven difficult to structurally characterize. Here, the authors obtain crystallographic and spectral characterization of a non-haem iron(III)-superoxo species and subsequently study its reactivity. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6440 Authors: Seungwoo Hong, Kyle D. Sutherlin, Jiyoung Park, Eunji Kwon, Maxime A. Siegler, Edward I. Solomon, Wonwoo Nam

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Ultra-responsive soft matter from strain-stiffening hydrogels (2014)

Maarten Jaspers; Matthew Dennison; Mathijs F. J. Mabesoone; Frederick C. Mac; Kintosh; Alan E. Rowan; Paul H. J. Kouwer

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Few synthetic hydrogels are known to display strain-stiffening behaviour. Here, Jaspers et al. show how concentration, polymer length and temperature can be used to modify the mechanical properties of synthetic gels to access mechanically highly sensitive and responsive materials. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6808 Authors: Maarten Jaspers, Matthew Dennison, Mathijs F. J. Mabesoone, Frederick C. MacKintosh, Alan E. Rowan, Paul H. J. Kouwer

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Widom line and dynamical crossovers as routes to understand supercritical water (2014)

P. Gallo; D. Corradini; M. Rovere

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Liquid and gas phases are indistinguishable at supercritical conditions. Here, Gallo et al. show that this convention is not precisely true for supercritical water on approaching its critical point due to the existence of the Widom line, which separates a liquid-like and a gas-like regime on its two sides. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6806 Authors: P. Gallo, D. Corradini, M. Rovere

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The Wilms’ tumour suppressor Wt1 is a major regulator of tumour angiogenesis and progression (2014)

Kay-Dietrich Wagner; Julien Cherfils-Vicini; Naoki Hosen; Peter Hohenstein; Eric Gilson; Nicholas D. Hastie; Jean-François Michiels; Nicole Wagner

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article The Wilms’ tumour suppressor Wt1 is highly expressed in vessels and stromal cells of human tumours, but not in adjacent healthy tissue. Here the authors show that Wt1 regulates Pecam-1 and c-kit and that deletion of Wt1 in endothelial, haematopoietic and myeloid suppressor cells leads to tumour regression. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6852 Authors: Kay-Dietrich Wagner, Julien Cherfils-Vicini, Naoki Hosen, Peter Hohenstein, Eric Gilson, Nicholas D. Hastie, Jean-François Michiels, Nicole Wagner

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Three-dimensional eukaryotic genomic organization is strongly correlated with codon usage expression and function (2014)

Alon Diament; Ron Y. Pinter; Tamir Tuller

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article The distribution of genes in eukaryotic genomes is not random. Here Diament et al. show, via a novel codon-based metric, that genes with shared function and similar expression levels tend to be close in the three-dimensional conformation of the yeast, a model plant species, mouse and human genomes. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6876 Authors: Alon Diament, Ron Y. Pinter, Tamir Tuller

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Theoretical predictions for hot-carrier generation from surface plasmon decay (2014)

Ravishankar Sundararaman; Prineha Narang; Adam S. Jermyn; William A. Goddard IIIHarry A. Atwater

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article A full theoretical understanding of plasmon decay into hot carriers will help in applications such as solar cells or photocatalysis. Here, the authors present a quantized plasmon model to calculate the hot-carrier distribution from plasmon decay and show its sensitivity to the band structure of the host metal. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6788 Authors: Ravishankar Sundararaman, Prineha Narang, Adam S. Jermyn, William A. Goddard III, Harry A. Atwater

Digitale ISSN: 2041-1723

Thema: Biologie , Chemie und Pharmazie , Allgemeine Naturwissenschaft , Physik

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Characterizing inner-shell with spectral phase interferometry for direct electric-field reconstruction (2014)

Hiroki Mashiko; Tomohiko Yamaguchi; Katsuya Oguri; Akira Suda; Hideki Gotoh

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-18

Beschreibung: Article Characterizing and understanding the profile of atomic spectral lines tells us a great deal about an atom’s properties. Here, the authors combine attosecond transient spectroscopy and the SPIDER technique to reconstruct the dipole oscillation phase of the auto-ionisation inner-shell transition in neon. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6599 Authors: Hiroki Mashiko, Tomohiko Yamaguchi, Katsuya Oguri, Akira Suda, Hideki Gotoh

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The MST1/2-SAV1 complex of the Hippo pathway promotes ciliogenesis (2014)

Miju Kim; Minchul Kim; Mi-Sun Lee; Cheol-Hee Kim; Dae-Sik Lim

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Although much is known about the structural and trafficking molecules involved in generation of primary cilia, the signalling proteins that regulate ciliogenesis are poorly defined. Here, Kim et al . identify the MST1/2-SAV1 complex, a core component of the Hippo pathway, as a key regulator of ciliogenesis in cells and zebrafish. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6370 Authors: Miju Kim, Minchul Kim, Mi-Sun Lee, Cheol-Hee Kim, Dae-Sik Lim

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A heavy analogue of the smallest bridgehead alkene stabilized by a base (2014)

Takeaki Iwamoto; Naohiko Akasaka; Shintaro Ishida

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article The highly strained nature of small bridgehead alkenes means that they often cannot be isolated, despite being postulated as transient intermediates. Here, the authors report base-stabilized heavy analogues of the smallest bridgehead alkene, with silicon occupying the vertices. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6353 Authors: Takeaki Iwamoto, Naohiko Akasaka, Shintaro Ishida

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Conflict acts as an implicit cost in reinforcement learning (2014)

James F. Cavanagh; Sean E. Masters; Kevin Bath; Michael J. Frank

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Conflict monitoring and value learning are often researched as separate processes within psychology, but they share many common neural mechanisms. Here Cavanagh et al. reveal that conflict acts as a cost during value learning, therefore suggesting a general link between conflict monitoring and value learning. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6394 Authors: James F. Cavanagh, Sean E. Masters, Kevin Bath, Michael J. Frank

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MTCL1 crosslinks and stabilizes non-centrosomal microtubules on the Golgi membrane (2014)

Yoshinori Sato; Kenji Hayashi; Yoshiko Amano; Mikiko Takahashi; Shigenobu Yonemura; Ikuko Hayashi; Hiroko Hirose; Shigeo Ohno; Atsushi Suzuki

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Microtubules that nucleate from the surface of the Golgi network are important for polarized trafficking and cell migration. Sato et al. find that these microtubules are crosslinked and stabilized by the microtubule-binding protein MTCL1, and show that this activity is required for Golgi structure and function. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6266 Authors: Yoshinori Sato, Kenji Hayashi, Yoshiko Amano, Mikiko Takahashi, Shigenobu Yonemura, Ikuko Hayashi, Hiroko Hirose, Shigeo Ohno, Atsushi Suzuki

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Autophagy supports genomic stability by degrading retrotransposon RNA (2014)

Huishan Guo; Maneka Chitiprolu; David Gagnon; Lingrui Meng; Carol Perez-Iratxeta; Diane Lagace; Derrick Gibbings

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-06

Beschreibung: Article Retrotransposons replicate via a copy-paste mechanism involving a cytoplasmic intermediate. Guo et al. report that autophagy can suppress genetic variation by degrading cytoplasmic retrotransposon RNA, suggesting additional means by which autophagy may influence tumorigenesis. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6276 Authors: Huishan Guo, Maneka Chitiprolu, David Gagnon, Lingrui Meng, Carol Perez-Iratxeta, Diane Lagace, Derrick Gibbings

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Hepatic miR-378 targets p110α and controls glucose and lipid homeostasis by modulating hepatic insulin signalling (2014)

Wei Liu; Hongchao Cao; Cheng Ye; Cunjie Chang; Minghua Lu; Yanyan Jing; Duo Zhang; Xuan Yao; Zhengjun Duan; Hongfeng Xia; Yu-cheng Wang; Jingjing Jiang; Mo-Fang Liu; Jun Yan; Hao Ying

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article PI3K is a central component of the insulin signalling pathway. Here, the authors reveal that miR-378 expression in the liver changes dynamically in response to fasting or refeeding, and show that miR-378 regulates hepatic insulin signalling by targeting the P110a subunit of PI3K. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6684 Authors: Wei Liu, Hongchao Cao, Cheng Ye, Cunjie Chang, Minghua Lu, Yanyan Jing, Duo Zhang, Xuan Yao, Zhengjun Duan, Hongfeng Xia, Yu-cheng Wang, Jingjing Jiang, Mo-Fang Liu, Jun Yan, Hao Ying

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Cryo-electron tomography reveals ciliary defects underlying human RSPH1 primary ciliary dyskinesia (2014)

Jianfeng Lin; Weining Yin; Maria C. Smith; Kangkang Song; Margaret W. Leigh; Maimoona A. Zariwala; Michael R. Knowles; Lawrence E. Ostrowski; Daniela Nicastro

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article Our current understanding of cilia biology and ciliary diseases is incomplete, in part because cilia are hard to visualize. Here, the authors use cryo-electron tomography to image the structure of human cilia with high resolution and uncover the elusive ciliary defects in Primary Ciliary Dyskinesia patients. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6727 Authors: Jianfeng Lin, Weining Yin, Maria C. Smith, Kangkang Song, Margaret W. Leigh, Maimoona A. Zariwala, Michael R. Knowles, Lawrence E. Ostrowski, Daniela Nicastro

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A 2,000-year reconstruction of the rain-fed maize agricultural niche in the US Southwest (2014)

R. Kyle Bocinsky; Timothy A. Kohler

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article Palaeoclimate research often focuses on continental, hemispheric and global scales, neglecting the local-scale changes of most importance to human adaptation. Here, the authors propose a new tree-ring-based methodology, capable of producing high-frequency, highly local climate-field reconstructions. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6618 Authors: R. Kyle Bocinsky, Timothy A. Kohler

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Kinetically tuned dimensional augmentation as a versatile synthetic route towards robust metal–organic frameworks (2014)

Dawei Feng; Kecheng Wang; Zhangwen Wei; Ying-Pin Chen; Cory M. Simon; Ravi K. Arvapally; Richard L. Martin; Mathieu Bosch; Tian-Fu Liu; Stephen Fordham; Daqiang Yuan; Mohammad A. Omary; Maciej Haranczyk; Berend Smit; Hong-Cai Zhou

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article The synthesis of ultra-stable, single crystalline metal–organic frameworks is challenging. Here, the authors describe a kinetically tuned augmentation synthetic route for the preparation of a range of robust crystalline materials from preformed trimetallic components. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6723 Authors: Dawei Feng, Kecheng Wang, Zhangwen Wei, Ying-Pin Chen, Cory M. Simon, Ravi K. Arvapally, Richard L. Martin, Mathieu Bosch, Tian-Fu Liu, Stephen Fordham, Daqiang Yuan, Mohammad A. Omary, Maciej Haranczyk, Berend Smit, Hong-Cai Zhou

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Khoisan hunter-gatherers have been the largest population throughout most of modern-human demographic history (2014)

Hie Lim Kim; Aakrosh Ratan; George H. Perry; Alvaro Montenegro; Webb Miller; Stephan C. Schuster

Springer Nature

In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article The expansion of Bantu agriculturalists 3,800 years ago in sub-Saharan Africa established first contact with Khoisan hunter-gatherers living in parts of Southern Africa. Sequencing the genomes of five Namibian-Khoisan hunter-gatherers and one Bantu individual tells a tale of admixture and isolation in the early history of modern human populations. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6692 Authors: Hie Lim Kim, Aakrosh Ratan, George H. Perry, Alvaro Montenegro, Webb Miller, Stephan C. Schuster

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Exosomes as Hedgehog carriers in cytoneme-mediated transport and secretion (2014)

Ana-Citlali Gradilla; Esperanza González; Irene Seijo; German Andrés; Marcus Bischoff; Laura González-Mendez; Vanessa Sánchez; Ainhoa Callejo; Carmen Ibáñez; Milagros Guerra; João Ramalho Ortigão-Farias; James D. Sutherland; Monika González; Rosa Barrio; Juan M. Falcón-Pérez; Isabel Guerrero

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article Long, thin projections of the cell membrane known as cytonemes are required for signalling by the secreted morphogen Hedgehog. Gradilla et al. show that cytonemes carry Hedgehog-associated exovesicles, and that exovesicle formation is required for graded Hedgehog signalling. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6649 Authors: Ana-Citlali Gradilla, Esperanza González, Irene Seijo, German Andrés, Marcus Bischoff, Laura González-Mendez, Vanessa Sánchez, Ainhoa Callejo, Carmen Ibáñez, Milagros Guerra, João Ramalho Ortigão-Farias, James D. Sutherland, Monika González, Rosa Barrio, Juan M. Falcón-Pérez, Isabel Guerrero

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Enrichment of CD56dimKIR+CD57+ highly cytotoxic NK cells in tumour-infiltrated lymph nodes of melanoma patients (2014)

Talib Hassan Ali; Simona Pisanti; Elena Ciaglia; Roberta Mortarini; Andrea Anichini; Cinzia Garofalo; Rossana Tallerico; Mario Santinami; Elio Gulletta; Caterina Ietto; Mario Galgani; Giuseppe Matarese; Maurizio Bifulco; Soldano Ferrone; Francesco Colucci; Alessandro Moretta; Klas Kärre; Ennio Carbone

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article The role of NK cells in tumour lymphatics is poorly understood. Here, the authors show that the tumour cell-infiltrated lymph nodes of melanoma patients have an altered cytokine milieu and contain an expanded population of NK cells with high tumour-cytotoxic activity. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6639 Authors: Talib Hassan Ali, Simona Pisanti, Elena Ciaglia, Roberta Mortarini, Andrea Anichini, Cinzia Garofalo, Rossana Tallerico, Mario Santinami, Elio Gulletta, Caterina Ietto, Mario Galgani, Giuseppe Matarese, Maurizio Bifulco, Soldano Ferrone, Francesco Colucci, Alessandro Moretta, Klas Kärre, Ennio Carbone

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Real-time earthquake monitoring using a search engine method (2014)

Jie Zhang; Haijiang Zhang; Enhong Chen; Yi Zheng; Wenhuan Kuang; Xiong Zhang

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-12-06

Beschreibung: Article Reporting earthquakes, including location and focal mechanism, in real time is a challenge. Here, the authors present an approach similar to a web search engine, estimating earthquake parameters by searching a large database within a second, which will potentially enable early warning systems. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6664 Authors: Jie Zhang, Haijiang Zhang, Enhong Chen, Yi Zheng, Wenhuan Kuang, Xiong Zhang

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Corrigendum: All-optical polariton transistor (2014)

D. Ballarini; M. De Giorgi; E. Cancellieri; R. HoudréE. Giacobino; R. Cingolani; A. Bramati; G. Gigli; D. Sanvitto

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-28

Beschreibung: Corrigendum Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6625 Authors: D. Ballarini, M. De Giorgi, E. Cancellieri, R. Houdré, E. Giacobino, R. Cingolani, A. Bramati, G. Gigli, D. Sanvitto

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Photon-assisted tunnelling with nonclassical light (2014)

J. -R. Souquet; M. J. Woolley; J. Gabelli; P. Simon; A. A. Clerk

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-28

Beschreibung: Article Coherently coupling microwave photons to quantum electronic conductors could provide a useful platform for quantum information processing. Souquet et al . now theoretically demonstrate that such systems can also act as sensitive probes of the quantum properties of non-classical microwave radiation. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6562 Authors: J. -R. Souquet, M. J. Woolley, J. Gabelli, P. Simon, A. A. Clerk

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Iron catalysed direct alkylation of amines with alcohols (2014)

Tao Yan; Ben L Feringa; Katalin Barta

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-28

Beschreibung: Article Direct alkylation of amines with alcohols is an atom-efficient and environmentally benign process. Here, the authors show that catalysts based on iron—an inexpensive and readily available metal—can carry out this process with high conversions and good substrate scope. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6602 Authors: Tao Yan, Ben L Feringa, Katalin Barta

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DNA methylation signatures link prenatal famine exposure to growth and metabolism (2014)

Elmar W. Tobi; Jelle J. Goeman; Ramin Monajemi; Hongcang Gu; Hein Putter; Yanju Zhang; Roderick C. Slieker; Arthur P. Stok; Peter E. Thijssen; Fabian Müller; Erik W. van Zwet; Christoph Bock; Alexander Meissner; L. H. Lumey; P. Eline Slagboom; Bastiaan T. Heijmans

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-28

Beschreibung: Article The long-term effect of prenatal nutrition on gene regulation is largely unknown. Here the authors identify differentially methylated regions in whole blood from individuals exposed to famine early after conception, and show that these epigenetic changes may have adverse metabolic consequences later in life. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6592 Authors: Elmar W. Tobi, Jelle J. Goeman, Ramin Monajemi, Hongcang Gu, Hein Putter, Yanju Zhang, Roderick C. Slieker, Arthur P. Stok, Peter E. Thijssen, Fabian Müller, Erik W. van Zwet, Christoph Bock, Alexander Meissner, L. H. Lumey, P. Eline Slagboom, Bastiaan T. Heijmans

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Epigenetic memory of the first cell fate decision prevents complete ES cell reprogramming into trophoblast (2014)

Francesco Cambuli; Alexander Murray; Wendy Dean; Dominika Dudzinska; Felix Krueger; Simon Andrews; Claire E. Senner; Simon J. Cook; Myriam Hemberger

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Publikationsdatum: 2014-11-28

Beschreibung: Article Various strategies have been reported to generate mouse trophoblast stem cells (TSCs) from mouse embryonic stem cells (ESCs). Here the authors show that, regardless of the strategy used for TSC generation, these retain an epigenetic and transcriptional memory of the ESC origin and the transition remains incomplete. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6538 Authors: Francesco Cambuli, Alexander Murray, Wendy Dean, Dominika Dudzinska, Felix Krueger, Simon Andrews, Claire E. Senner, Simon J. Cook, Myriam Hemberger

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Global 3′ UTR shortening has a limited effect on protein abundance in proliferating T cells (2014)

Andreas R. Gruber; Georges Martin; Philipp Müller; Alexander Schmidt; Andreas J. Gruber; Rafal Gumienny; Nitish Mittal; Rajesh Jayachandran; Jean Pieters; Walter Keller; Erik van Nimwegen; Mihaela Zavolan

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Publikationsdatum: 2014-11-23

Beschreibung: Article The use of alternative polyadenylation sites can potentially result in mRNA being more or less susceptible to interaction with modulators of translation or stability. Here Gruber et al . find that the shortening of 3′UTRs observed in proliferating T cells does not significantly impact protein abundance. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6465 Authors: Andreas R. Gruber, Georges Martin, Philipp Müller, Alexander Schmidt, Andreas J. Gruber, Rafal Gumienny, Nitish Mittal, Rajesh Jayachandran, Jean Pieters, Walter Keller, Erik van Nimwegen, Mihaela Zavolan

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PKM2 phosphorylates MLC2 and regulates cytokinesis of tumour cells (2014)

Yuhui Jiang; Yugang Wang; Ting Wang; David H. Hawke; Yanhua Zheng; Xinjian Li; Qin Zhou; Sadhan Majumder; Erfei Bi; David X. Liu; Suyun Huang; Zhimin Lu

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-23

Beschreibung: Article The pyruvate kinase type M2 (PKM2) has a well-established role in cancer due to its functions in regulating glucose metabolism, G1-S transition and mitotic checkpoint. Here the authors identified a novel role for PKM2 in regulating cytokinesis in cancer cells through the phosphorylation of the myosin light chain 2 at the contractile ring. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6566 Authors: Yuhui Jiang, Yugang Wang, Ting Wang, David H. Hawke, Yanhua Zheng, Xinjian Li, Qin Zhou, Sadhan Majumder, Erfei Bi, David X. Liu, Suyun Huang, Zhimin Lu

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Asymmetric trapping of zwitterionic intermediates by sulphur ylides in a palladium-catalysed decarboxylation-cycloaddition sequence (2014)

Tian-Ren Li; Fen Tan; Liang-Qiu Lu; Yi Wei; Ya-Ni Wang; Yi-Yin Liu; Qing-Qing Yang; Jia-Rong Chen; De-Qing Shi; Wen-Jing Xiao

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Publikationsdatum: 2014-11-23

Beschreibung: Article Sulphur ylides are useful reagents in organic synthesis, typically reacting with highly polar reagents. Here, the authors show a catalytic asymmetric process for the addition of sulphur ylides to cyclic allylic esters with loss of CO 2 , giving access to chiral, highly functionalised indolines. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6500 Authors: Tian-Ren Li, Fen Tan, Liang-Qiu Lu, Yi Wei, Ya-Ni Wang, Yi-Yin Liu, Qing-Qing Yang, Jia-Rong Chen, De-Qing Shi, Wen-Jing Xiao

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RHOA inactivation enhances Wnt signalling and promotes colorectal cancer (2014)

Paulo Rodrigues; Irati Macaya; Sarah Bazzocco; Rocco Mazzolini; Elena Andretta; Higinio Dopeso; Silvia Mateo-Lozano; Josipa BilićFernando Cartón-García; Rocio Nieto; Lucia Suárez-López; Elsa Afonso; Stefania Landolfi; Javier Hernandez-Losa; Kazuto Kobayashi; Santiago Ramón y Cajal; Josep Tabernero; Niall C. Tebbutt; John M. Mariadason; Simo Schwartz Jr.Diego Arango

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In: Nature Communications

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Publikationsdatum: 2014-11-23

Beschreibung: Article The small GTPase RhoA has oncogenic effects in several cancer types. Here the authors show that loss of RhoA accelerates colon cancer progression by promoting accumulation of nuclear ß-catenin, resulting in enhanced proliferation and invasion mediated by the Wnt signalling pathway in human and murine colon cancer cells. Nature Communications doi: 10.1038/ncomms6458 Authors: Paulo Rodrigues, Irati Macaya, Sarah Bazzocco, Rocco Mazzolini, Elena Andretta, Higinio Dopeso, Silvia Mateo-Lozano, Josipa Bilić, Fernando Cartón-García, Rocio Nieto, Lucia Suárez-López, Elsa Afonso, Stefania Landolfi, Javier Hernandez-Losa, Kazuto Kobayashi, Santiago Ramón y Cajal, Josep Tabernero, Niall C. Tebbutt, John M. Mariadason, Simo Schwartz Jr., Diego Arango

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