ISSN:
0170-2041
Keywords:
α-Aminoisobutyric acid
;
Molecular dynamics
;
Chemistry
;
Organic Chemistry
Source:
Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
Topics:
Chemistry and Pharmacology
Description / Table of Contents:
NMR-spektroskopische Zuordnung der Aib-Methylgruppen in α-helikaler und β-Turn-Umgebung mit Hilfe von selektiv deuterierter Aib. - Die Konformationen von Boc-Ala-Aib-Ala-OMe in LösungBoc-Ala-Aib-Ala-OMe (1a) nimmt im Kristall eine β-turn-Typ-II-ähnliche Konformation ein. Aus 13C-CP-MAS-Spektren erhält man eine magnetische Nichtäquivalenz der Aib-Cβ-Atome von 6.1 ppm. Das pro-S-Cβ-Kohlenstoff-Signal ist nach hohem Feld verschoben, wie man durch Vergleich mit den Spektren von Boc-Ala-(R)-Aib[D1]-Ala-OMe (1b) zeigen kann. Diese Zuordnung entspricht der gefundenen Tieffeldverschiebung des pro-S-Cβ-Kohlenstoffs von Aib in der Helix von Boc-[L-Glu(OBzl)]4-Aib[L-Glu(OBzl)]7-O-PEG-M (2a, in der sie mit Hilfe des (R)-Aib[D3] enthaltenen Analogons (2b) belegt wurde. Aus Moleküldynamik-Simulationen leiten wir zwei Hauptkonformationsräume für Boc-Ala-Aib-Ala-OMe in Lösung ab, die die beobachtete MNE von 2.1 ppm, die Amid-Temperaturkoeffizienten, die Kopplungskonstanten und die aus ROESY-Spektren berechneten Abstände erklären.
Notes:
Boc-Ala-Aib-Ala-OMe (1a) adopts in the crystal a conformation similar to a β-turn type II. From 13C-CP-MAS spectra the magnetic nonequivalence of the Aib-Cβ atoms amounts to 6.1 ppm. The pro-S-Cβ carbon signal is shifted upfield as can be shown by comparison with the spectra of Boc-Ala-(R)-Aib[D1]-Ala-OMe (1b). This assignment corresponds to a downfield shift of the Aib pro-S-Cβ carbon in the helix of Boc-[L-Glu(OBzl)]4-Aib-[L-Glu(OBzl)]7-O-PEG-M (2a), where it was established with the aid of the (R)-Aib[D3]-containing analog (2b), From molecular dynamics simulations of Boc-Ala-Aib-Ala-OMe we propose two major conformational species in solution that account for the observed MNE of 2.1 ppm, the temperature gradients of the amide protons, the coupling constants, and the distances derived from ROESY spectra.
Additional Material:
4 Ill.
Type of Medium:
Electronic Resource
URL:
http://dx.doi.org/10.1002/jlac.198919890260
Permalink
