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  • 1
    Publication Date: 2016-06-15
    Description: In the yearly Internationally Genetically Engineered Machines (iGEM) competition, teams of Bachelor's and Master's students design and build an engineered biological system using DNA technologies. Advising an iGEM team poses unique challenges due to the inherent difficulties of mounting and completing a new biological project from scratch over the course of a single academic year; the challenges in obtaining financial and structural resources for a project that will likely not be fully realized; and conflicts between educational and competition-based goals. This article shares tips and best practices for iGEM team advisors, from two team advisors with very different experiences with the iGEM competition.
    Keywords: Professional Development
    Print ISSN: 0378-1097
    Electronic ISSN: 1574-6968
    Topics: Biology
    Location Call Number Expected Availability
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  • 2
    Publication Date: 2016-04-21
    Description: RNA–RNA interactions are fast emerging as a major functional component in many newly discovered non-coding RNAs. Basepairing is believed to be a major contributor to the stability of these intermolecular interactions, much like intramolecular basepairs formed in RNA secondary structure. As such, using algorithms similar to those for predicting RNA secondary structure, computational methods have been recently developed for the prediction of RNA–RNA interactions. We provide the first comprehensive comparison comprising 14 methods that predict general intermolecular basepairs. To evaluate these, we compile an extensive data set of 54 experimentally confirmed fungal snoRNA–rRNA interactions and 102 bacterial sRNA–mRNA interactions. We test the performance accuracy of all methods, evaluating the effects of tool settings, sequence length, and multiple sequence alignment usage and quality. Our results show that—unlike for RNA secondary structure prediction—the overall best performing tools are non-comparative energy-based tools utilizing accessibility information that predict short interactions on this data set. Furthermore, we find that maintaining high accuracy across biologically different data sets and increasing input lengths remains a huge challenge, causing implications for de novo transcriptome-wide searches. Finally, we make our interaction data set publicly available for future development and benchmarking efforts.
    Keywords: Nucleic acid structure, RNA characterisation and manipulation, Computational Methods
    Print ISSN: 0305-1048
    Electronic ISSN: 1362-4962
    Topics: Biology
    Location Call Number Expected Availability
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  • 3
    facet.materialart.
    Unknown
    Kraatz, Berlin
    In:  Staatsbibliothek Berlin (SBB) | SUB Göttingen | Kart. W 15710-17,5〈1914〉;KART H 140:Rauschen
    Publication Date: 2021-06-02
    Description: Geologische Karte 1: 25 000 mit Erläuterungen. Die Karte ist ein Digitalisat der Staatsbibliothek Berlin (SBB), bereitgestellt durch den Fachinformationsdienst Kartographie und Geobasisdaten (FID Karten). Das Erläuterungsheft ist ein Digitalisat des FID GEO (Fachinformationsdienst Geowissenschaften der festen Erde), erstellt durch das GDZ (Göttinger Digitalisierungszentrum), aus dem Bestand der SUB Göttingen. GeoTIFF erstellt durch FID GEO, SUB Göttingen. Koordinaten Vorlage: Nullmeridian Ferro: E 037 40 - E 037 50 / N 055 00 - N 054 54.
    Description: map
    Description: Staatsbibliothek Berlin (SBB), DFG, SUB Göttingen
    Keywords: 912 ; 554.3 ; Светлогорск ; GeoTIFF ; Rauschen ; Geologische Karte ; Swetlogorsk ; FID-GEO-DE-7
    Language: German
    Type: map_digi
    Format: 164
    Location Call Number Expected Availability
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  • 4
    Publication Date: 2021-03-29
    Description: Abstract: The purpose of adding clay to horticultural growing media is to achieve objectives such as a well-balanced nutrient supply, buffering of the pH-value, improvement of the rewettability, cohesion of the growing medium and supply of trace elements. Criteria for choosing clay types for specific applications are necessary to assess the suitability of original materials as well as processed clays in a reliable way. A wide range of clays for different applications was chosen for this study. Differences in the mineralogical composition and in pretreatment of the selected clays resulted in specific physical and chemical characteristics of the different growing media mixes. The influence of different clays on the rewettability and cohesion of growing media was analyzed in laboratory experiments which resulted in the definition of important parameters for selection of clays and suitable methods for processing. Clays with strong K and P fixation as well as clays with spontaneous release of these macronutrients were identified. The effects of clays on the flow of nutrients were documented in crop tests. growth-trials regarding Mn toxicity, carried out with clays with different contents of active Mn, proved that an existing RHP-threshold value for Mn in clays for growing media is not justified.
    Description: Zusammenfassung: Der Zusatz von Ton zu gärtnerischen Kultursubstraten ist mit vielen unterschiedlichen Zielen, wie ausgeglichener Nährstoffversorgung, Pufferung des pH-Wertes, Verbesserung der Benetzbarkeit, Bindigkeit des Substrates und Spurenelementversorgung, verknüpft. Geeignete Kriterien für die Auswahl von Tonen für spezifische Anwendungen sind nötig, um eine verlässliche Bewertung sowohl der Substratausgangsstoffe als auch von aufbereiteten Tonen zu ermöglichen. In dieser Studie wurde eine große Bandbreite von Tonen für verschiedene Anwendungen ausgewählt. Unterschiede in der mineralogischen Zusammensetzung und Aufbereitung der ausgewählten Tone spiegeln sich bei den entsprechenden physikalischen und chemischen Eigenschaften des Substrates wieder. Der Einfluss verschiedener Tone auf die Wiederbenetzbarkeit und Bindigkeit von Substraten wurde in Laborexperimenten untersucht und wichtige Parameter für die Auswahl bestimmter Tonspezies und deren Aufbereitung abgeleitet. Tone mit starker K- und P-Fixierung als auch solche mit spontaner Freisetzung dieser Makronährstoffe wurden identifiziert und in Kulturversuchen Toneffekte auf Nährstoffflüsse dokumentiert. Untersuchungen zur Mangantoxizität an Tonen mit unterschiedlichen Anteilen an aktivem Mangan ergaben, dass der bestehende RHP-Grenzwert für Mn in Substrattonen nicht gerechtfertigt ist.
    Description: DFG, SUB Göttingen, DGMT
    Description: research
    Keywords: 553.21 ; clay ; peat ; Torf ; substrate ; FID-GEO-DE-7
    Language: German
    Type: article , publishedVersion
    Location Call Number Expected Availability
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  • 5
    facet.materialart.
    Unknown
    Kraatz, Berlin
    In:  SUB Göttingen | KART B 140:4040;KART H 140:Hundeluft
    Publication Date: 2021-06-02
    Description: Geologische Karte 1: 25 000 mit Erläuterungen. Digitalisat des FID GEO (Fachinformationsdienst Geowissenschaften der festen Erde), erstellt durch das GDZ (Göttinger Digitalisierungszentrum), Karte aus dem Bestand der SUB Göttingen. GeoTIFF erstellt durch FID GEO, SUB Göttingen. Koordinaten Vorlage: Nullmeridian Ferro E 030 00 - E 030 10 / N 052 00 - N 051 54.
    Description: map
    Description: DFG, SUB Göttingen
    Keywords: 912 ; 554.3 ; Geologische Karte ; Hundeluft ; GeoTIFF ; FID-GEO-DE-7
    Language: German
    Type: map_digi
    Format: 100
    Location Call Number Expected Availability
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  • 6
    facet.materialart.
    Unknown
    Kraatz, Berlin
    In:  Staatsbibliothek Berlin (SBB) | SUB Göttingen | Kart. W 15710-17,11〈1914〉;KART H 140:Germau
    Publication Date: 2021-06-02
    Description: Geologische Karte 1: 25 000 mit Erläuterungen. Die Karte ist ein Digitalisat der Staatsbibliothek Berlin (SBB), bereitgestellt durch den Fachinformationsdienst Kartographie und Geobasisdaten (FID Karten). Das Erläuterungsheft ist ein Digitalisat des FID GEO (Fachinformationsdienst Geowissenschaften der festen Erde), erstellt durch das GDZ (Göttinger Digitalisierungszentrum), aus dem Bestand der SUB Göttingen. GeoTIFF erstellt durch FID GEO, SUB Göttingen. Koordinaten Vorlage: Nullmeridian Ferro E 037 40 - E 037 50 /N 054 54 - N 054 48.
    Description: map
    Description: Staatsbibliothek Berlin (SBB), DFG, SUB Göttingen
    Keywords: 912 ; 554.3 ; GeoTIFF ; Geologische Karte ; Germau ; Russkoje ; Русское ; FID-GEO-DE-7
    Language: German
    Type: map_digi
    Format: 140
    Location Call Number Expected Availability
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  • 7
    facet.materialart.
    Unknown
    Kraatz, Berlin
    In:  Staatsbibliothek Berlin (SBB) | SUB Göttingen | Kart. W 15710-17,4〈1914〉;KART H 140:Gr.-Dirschkeim
    Publication Date: 2021-06-02
    Description: Geologische Karte 1: 25 000 mit Erläuterungen. Die Karte ist ein Digitalisat der Staatsbibliothek Berlin (SBB), bereitgestellt durch den Fachinformationsdienst Kartographie und Geobasisdaten (FID Karten). Das Erläuterungsheft ist ein Digitalisat des FID GEO (Fachinformationsdienst Geowissenschaften der festen Erde), erstellt durch das GDZ (Göttinger Digitalisierungszentrum), aus dem Bestand der SUB Göttingen. GeoTIFF erstellt durch FID GEO, SUB Göttingen. Koordinaten Vorlage: Nullmeridian Ferro E 037 30 - E 037 40 /N 055 00 - N 054 54
    Description: map
    Description: Staatsbibliothek Berlin (SBB), DFG, SUB Göttingen
    Keywords: 912 ; 554.3 ; GeoTIFF ; Geologische Karte ; Gr. Dirschkeim ; Donskoje ; Донское ; FID-GEO-DE-7
    Language: German
    Type: map_digi
    Format: 162
    Location Call Number Expected Availability
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